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Nature Communications:黃燦華/魏霞蔚團(tuán)隊(duì)揭示肝細(xì)胞癌中絲氨酸合成調(diào)控的新機(jī)制

 MITOMMY 2023-03-07 發(fā)布于上海

肝細(xì)胞癌中絲氨酸合成調(diào)控的新機(jī)制



中科脂典協(xié)助完成

精確代謝組和非靶向代謝流分析服務(wù)

2023年2月,四川大學(xué)華西醫(yī)院等單位的相關(guān)研究人員在《Nature Communications》(IF: 17.7)上發(fā)表了題為“PHGDH arginine methylation by PRMT1 promotes serine synthesis and represents a therapeutic vulnerability in hepatocellular carcinoma”的研究論文,揭示了磷酸甘油酸脫氫酶(PHGDH)活性和絲氨酸合成的調(diào)節(jié)機(jī)制,并為肝細(xì)胞癌(HCC)提供了一個(gè)潛在治療靶點(diǎn)。

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亮點(diǎn)概述:
  • 蛋白質(zhì)精氨氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶1(PRMT1)介導(dǎo)的R236精氨酸甲基化修飾上調(diào)磷酸甘油酸脫氫酶(PHGDH)活性,促進(jìn)肝細(xì)胞癌(HCC)細(xì)胞生長。

  • PRMT1介導(dǎo)的PHGDH精氨酸甲基化激活絲氨酸代謝,改善細(xì)胞內(nèi)氧化應(yīng)激。

  • 通過合成肽阻斷PHGDH精氨酸甲基化可抑制肝癌生長

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   研究背景   

絲氨酸代謝在多種癌癥類型中被激活,通過為大分子(如蛋白質(zhì)、核苷酸和脂質(zhì))合成提供前體和為甲基化反應(yīng)提供一碳單元來支持腫瘤生長和轉(zhuǎn)移。此外,絲氨酸合成偶聯(lián)一碳代謝產(chǎn)生谷胱甘肽(GSH)NADPH,兩種主要的內(nèi)在抗氧化劑,以維持癌細(xì)胞中的氧化還原平衡。然而,在癌癥中調(diào)控絲氨酸合成的潛在機(jī)制仍不清楚。

磷酸甘油酸脫氫酶(PHGDH)是從頭絲氨酸生物合成途徑中的第一種限速酶,催化3-磷酸甘油酸(3-PG)形成3-磷酸羥基丙酮酸。最近的研究表明,PHGDH經(jīng)常過度表達(dá),以激活絲氨酸合成并促進(jìn)多種類型癌癥的腫瘤生長,是一個(gè)很有希望的癌癥治療靶點(diǎn)。雖然PHGDH在癌癥中過度表達(dá)的機(jī)制已經(jīng)得到了很好的說明,但PHGDH活性在癌癥中的作用和調(diào)節(jié)機(jī)制尚待闡釋。

蛋白質(zhì)精氨酸甲基化是一種普遍存在的翻譯后修飾,由蛋白質(zhì)精氨氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶(PRMT)催化,在廣泛的生物學(xué)過程中發(fā)揮著關(guān)鍵作用,如mRNA剪接、DNA損傷、轉(zhuǎn)錄和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)。值得注意的是,最近的研究表明,PRMTs介導(dǎo)的蛋白精氨酸甲基化調(diào)節(jié)癌癥代謝,包括葡萄糖代謝、谷氨酰胺代謝和脂質(zhì)代謝。然而,蛋白精氨酸甲基化在癌癥細(xì)胞絲氨酸代謝中的作用仍不清楚。

研究人員首選對20多對肝細(xì)胞癌(HCC)和相鄰正常組織進(jìn)行了非靶代謝組學(xué)和RNA-seq分析,通過比較富集代謝通路的代謝基因、代謝產(chǎn)物的差異豐度評分,發(fā)現(xiàn)HCC組織中代謝組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)圖譜之間存在不一致性。HCC組織中的絲氨酸水平增加,而PHGDH的表達(dá)卻明顯下調(diào),這歸因于HCC組織中PHGDH的催化活性與正常組織相比顯著增加,從而激活了絲氨酸合成。PHGDH催化活性的升高對HCC的生長至關(guān)重要,在PHGDH低表達(dá)的情況下,采用PHGDH小分子抑制劑或CRISPR/Cas9敲除PHGDH仍可抑制肝癌細(xì)胞生長。

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PHGDH 催化活性升高是 HCC 生長所必需的

接著,研究人員探究了HCC中PHGDH活性的調(diào)節(jié)機(jī)制,發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶PRMT1可與PHGDH第83位纈氨酸(V83)相互作用,使得PHGDH第236位精氨酸(R236)位點(diǎn)發(fā)生甲基化修飾,精氨酸甲基化修飾通過促進(jìn)PHGDH對底物3-PG的親和力而提高了酶的催化活性。

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R236處的精氨酸甲基化通過增加底物親和力提高了PHGDH的催化活性

鑒于PHGDH是從頭合成絲氨酸的第一個(gè)限速酶,研究人員隨后評估了PHGDH的R236甲基化對HCC細(xì)胞絲氨酸合成、抗氧化能力以及增殖的影響,發(fā)現(xiàn)PRMT1介導(dǎo)的PHGDH精氨酸甲基化修飾可促進(jìn)HCC細(xì)胞中的絲氨酸合成,增強(qiáng)GSH和NADPH的水平,防止ROS積累并維持氧化還原平衡,改善了HCC細(xì)胞中的氧化應(yīng)激,并在體內(nèi)外促進(jìn)HCC細(xì)胞的生長和增殖。

此外,研究人員還評估PRMT1介導(dǎo)的PHGDH甲基化的臨床相關(guān)性,發(fā)現(xiàn)與正常組織相比,HCC組織顯示PHGDH的R236甲基化水平顯著升高,且與PRMT1蛋白水平、PHGDH活性成正相關(guān)。PHGDH的R236甲基化和PRMT1蛋白水平較高與HCC患者預(yù)后較差相關(guān),表明肝癌發(fā)展需要高水平的PRMT1介導(dǎo)的PHGDH甲基化。

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PRMT1介導(dǎo)的PHGDH的R236甲基化促進(jìn)HCC細(xì)胞的生長

鑒于PRMT1介導(dǎo)的PHGDH R236甲基化對于HCC的發(fā)展是必要的,研究人員最后探究了PHGDH甲基化是否可以作為治療靶點(diǎn)。發(fā)現(xiàn)使用合成肽阻斷PHGDH甲基化可以降低PHGDH活性,促進(jìn)細(xì)胞內(nèi)ROS積累,在體內(nèi)外抑制HCC細(xì)胞生長,表明靶向PHGDH甲基化并結(jié)合飲食中的絲氨酸/甘氨酸限制可能是治療HCC的潛在治療策略。

總之,該研究揭示了調(diào)節(jié)PHGDH活性和絲氨酸代謝的機(jī)制,并提示PRMT1介導(dǎo)的PHGDH甲基化是HCC的潛在治療靶點(diǎn)。

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