今天是第563期日報(bào)。

梅奧學(xué)報(bào)：癌癥精準(zhǔn)治療，腸道菌群不可或缺！

Mayo Clinic Proceedings[IF:6.686]

① 長期住院、免疫抑制、多次使用抗生素、化療等因素會導(dǎo)致腸道失調(diào)，因而癌癥患者是艱難梭菌感染（CDI）的易感人群；② Hefazi等人報(bào)告了對23名接受過化療的癌癥患者使用糞菌移植（FMT）治療復(fù)發(fā)性CDI，有效率達(dá)86%，且無嚴(yán)重不良反應(yīng)和感染并發(fā)癥；③ 該研究表明，在高感染風(fēng)險的癌癥患者中，用FMT治療CDI是安全且有效的；④ 腸道菌群和癌癥的關(guān)系復(fù)雜而密切，可以作為生物標(biāo)記物、診斷工具、治療靶點(diǎn)，是癌癥精準(zhǔn)治療中不可缺少的因素。

Gut Microbiota and Cancer Patients: A Broad-Ranging Relationship

2017-11-01  DOI: 10.1016/j.mayocp.2017.09.009

梅奧學(xué)報(bào)：FMT用于化療后腫瘤患者CDI，安全有效！

Mayo Clinic Proceedings[IF:6.686]

① 2012-2016年間，23名惡性腫瘤患者接受糞菌移植（FMT）以應(yīng)對艱難梭菌感染（CDI）；② 患者在FMT前平均12個月接受化療，平均有4次CDI復(fù)發(fā)且平均接受106天的抗生素治療；③ FMT后60天內(nèi)，23人的艱難梭菌均為陰性，除3人外無人復(fù)發(fā)腹瀉，1人在FMT后5天因與FMT無關(guān)的心臟驟停而死亡；④ 22人存活60天或以上，11人接受進(jìn)一步化療，10人使用更多抗生素，2人分別在FMT后14和22月復(fù)發(fā)CDI；⑤ 所有案例中，無歸因于FMT的其他嚴(yán)重不良反應(yīng)和感染并發(fā)癥。

Safety and Efficacy of Fecal Microbiota Transplant for Recurrent Clostridium difficile Infection in Patients With Cancer Treated With Cytotoxic Chemotherapy: A Single-Institution Retrospective Case Series

2017-11-01  DOI: 10.1016/j.mayocp.2017.08.016

TEM：預(yù)防1型糖尿病，或可以糖攻糖

Trends in Endocrinology and Metabolism[IF:10.893]

① Zhang等人的研究表明甘露糖具有免疫調(diào)節(jié)功能，可特異性誘導(dǎo)初始T細(xì)胞向調(diào)節(jié)性T細(xì)胞（Treg）分化；② 在小鼠模型中，口服甘露糖可預(yù)防和抑制某些自身免疫疾病，包括非肥胖性一型糖尿病和卵清蛋白誘導(dǎo)的呼吸道炎癥；③ 甘露糖經(jīng)SLC2A轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞內(nèi)，增強(qiáng)線粒體中脂肪酸氧化產(chǎn)生自由基、上調(diào)整合素αVβ8的表達(dá)，進(jìn)而激活TGF-β，誘導(dǎo)產(chǎn)生FoxP3 Treg細(xì)胞；④ 該研究表明甘露糖或可用于一型糖尿病等自身免疫疾病的預(yù)防和治療，具有臨床意義。

A Sweet Deal for Diabetes

2017-11-01  DOI: 10.1016/j.tem.2017.10.006

Nature子刊：甘露糖誘導(dǎo)Treg并抑制小鼠1型糖尿病

Nature Medicine[IF:29.886]

① D-甘露糖是葡萄糖的差向異構(gòu)體，存在于植物和水果中；② 細(xì)胞實(shí)驗(yàn)表明，甘露糖可以誘導(dǎo)人類和小鼠的初始T細(xì)胞向Foxp3 調(diào)節(jié)性T細(xì)胞（Treg）分化；③ T細(xì)胞中，甘露糖能提升整合素αVβ8的表達(dá)、脂肪酸氧化和自由基水平，促使TGF-β活化，從而增強(qiáng)TGF-β信號，誘導(dǎo)Treg細(xì)胞生成；④ 在小鼠中，口服甘露糖能增加Treg細(xì)胞的比例，抑制自身免疫性的1型糖尿病和卵清蛋白誘導(dǎo)的呼吸道炎癥；⑤ 甘露糖的免疫調(diào)節(jié)作用具有潛在的臨床應(yīng)用價值。

D-mannose induces regulatory T cells and suppresses immunopathology

2017-07-24  DOI: 10.1038/nm.4375

Neurotherapeutics：多發(fā)性硬化中的飲食、菌群與維生素（綜述）

Neurotherapeutics[IF:5.166]

① 連接多發(fā)性硬化中飲食、腸道菌群、維生素D/A的關(guān)鍵是低度炎癥；② 高卡路里、高動物脂肪的西式飲食使腸道菌群失調(diào)，其引起的腸道炎癥導(dǎo)致腸道屏障泄露，從而破壞血腦屏障，最終導(dǎo)致神經(jīng)炎癥；③ 與此相反，富含纖維的素食飲食與腸道生態(tài)平衡及健康相關(guān)；④ 在低度炎癥狀態(tài)下維生素D的水平缺乏，服用高劑量維生素D3可恢復(fù)其正常水平；⑤ 維生素D與其受體結(jié)合需要維生素A的參與，從而發(fā)揮其抗炎癥作用，對于維生素缺乏者，這兩種維生素均需提供。

Diet, Gut Microbiota, and Vitamins D  A in Multiple Sclerosis

2017-10-24  DOI: 10.1007/s13311-017-0581-4

GB：不依賴于參考基因組的宏基因組分析算法——MetaGen

Genome Biology[IF:11.908]

① 開發(fā)一種新的統(tǒng)計(jì)宏基因組算法MetaGen，可在不使用參考基因組的情況下，同時鑒定出微生物物種并估計(jì)其相對豐度；② 作為取舍，這種算法需要多個宏基因組樣品（通常需要不少于10個樣品），才能得到高精度的binning結(jié)果；③ 與其它不依賴于參考基因組的方法（基于k-mer分布或覆蓋信息的算法）相比，該算法的物種binning準(zhǔn)確率更高，且在測序覆蓋度較低時仍相當(dāng)有效；④ 通過模擬及真實(shí)宏基因組研究驗(yàn)證了該算法的有效性。

MetaGen: reference-free learning with multiple metagenomic samples

2017-10-03  DOI: 10.1186/s13059-017-1323-y

NAR：EBI宏基因組分析平臺2017年度報(bào)告

Nucleic Acids Research[IF:10.162]

① EBI宏基因組提供了一個對特殊環(huán)境中的微生物種群測序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析并歸檔的免費(fèi)平臺；② 在過去的20多年內(nèi)，EBI宏基因組將其數(shù)據(jù)集的數(shù)量增加了10倍，并且在增加通量的同時，添加了最新的計(jì)算分析工具及參考數(shù)據(jù)集；③ 添加了基于大/小亞基RNA標(biāo)記基因的分類方法，并添加了宏基因組組裝作為新的分析服務(wù)；④ 從公共數(shù)據(jù)集中產(chǎn)生了超過2400個組裝集合，基于此生成了一個包含超過5000萬序列的可搜索、非冗余的蛋白數(shù)據(jù)庫。

EBI Metagenomics in 2017: enriching the analysis of microbial communities, from sequence reads to assemblies

2017-10-23  DOI: 10.1093/nar/gkx967

AJP：敲入自身抗體基因的小鼠模型

American Journal of Pathology[IF:4.057]

① 先前的研究報(bào)道，通過敲入自身抗體564的IgH和IgL基因，建立雜合非自身免疫小鼠模型，其自身免疫抗體高表達(dá)依賴于TLR7受體；② 與雜合子不同，純合子小鼠不僅表達(dá)高水平的自身免疫抗體，還具有高發(fā)成熟B細(xì)胞腫瘤和細(xì)菌易感性更高的特性；③ 更重要的是口服抗生素后，小鼠沒有感染、未發(fā)生淋巴瘤，甚至自身免疫癥狀也減輕；④ 該小鼠模型對未來研究自身免疫疾病、淋巴瘤以及腸道菌群之間的聯(lián)系具有重要意義。

Associations of Autoimmunity, Immunodeficiency, Lymphomagenesis, and Gut Microbiota in Mice with Knockins for a Pathogenic Autoantibody

2017-07-17  DOI: 10.1016/j.ajpath.2017.05.017