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嘌呤霉素(puromycin)抗體檢測蛋白合成和翻譯抑制的原理和方法

 智者不學生物 2024-02-10 發(fā)布于上海

嘌呤霉素抑制蛋白合成的原理:

嘌呤霉素(puromycin)和氨酰-tRNA分子3'末端的結(jié)構(gòu)類似,能夠與核糖體的A位點結(jié)合,從而被添加到新合成的肽鏈中去。puromycin和核糖體的A位點結(jié)合然后摻入延伸的肽鏈之后,則無法繼續(xù)參與隨后的肽鏈延伸反應,導致蛋白質(zhì)合成的提前終止,然后釋放出C-末端含有嘌呤霉素的不成熟的多肽(如下圖紅色部分所示)。因此,向細胞中添加puromycin會抑制細胞內(nèi)所有的蛋白質(zhì)合成。

嘌呤霉素抑制蛋白合成原理(圖片來源于www.cellco.com)

含有puromycin的不成熟的多肽可以被針對puromycin的抗體識別,因此可以通過WB或者IFA檢測細胞內(nèi)總的蛋白質(zhì)合成情況,或者翻譯抑制情況。

puromycin抗體檢測蛋白翻譯抑制案例詳解:

(1)puromycin抗體WB法

如下圖所示,作者用鼠諾如病毒(murine norovirus,MNV)感染骨髓來源的巨噬細胞,分別于感染后的3h、6h、9h、12h和15h收樣,每次收樣前10 ug/ml的puromycin處理20min,目的是讓puromycin摻入到新和成的多肽中去,然后就能用puromycin的抗體檢測新和成的多肽了。結(jié)果顯示,隨著感染時間延長,puromycin抗體能夠檢測到的蛋白含量逐漸降低,說明新和成的蛋白減少了,也就是證明MNV感染抑制了蛋白翻譯。

鼠諾如病毒感染抑制宿主蛋白翻譯(Svenja Fritzlar et al. 2019. mBio)

(2)puromycin抗體IFA法

puromycin的抗體除了可以做WB,也可以通過做IFA來檢測細胞蛋白翻譯抑制。作者同樣是用MNV感染,分別于感染后的6h、9h和12h固定細胞,固定前10 ug/ml的puromycin處理30min。

如下圖所示,anti-puromycin檢測的是新和成的多肽,anti-VPg標記被MNV感染的陽性細胞。尤其是MNV感染12hpi時,MNV陽性的細胞(紅色)中puromycin的信號降低,說明MNV感染的細胞中蛋白翻譯被抑制。

鼠諾如病毒感染抑制宿主蛋白翻譯(Svenja Fritzlar et al. 2019. mBio)

puromycin抗體篩選蛋白翻譯抑制因子:

為了篩選MNV編碼的蛋白翻譯抑制因子,作者將MNV編碼的基因轉(zhuǎn)染到HEK-293T細胞中,用10 ug/ml的puromycin處理20min,收樣WB用puromycin抗體檢測蛋白翻譯情況,結(jié)果顯示NS3能夠抑制宿主蛋白翻譯。

同樣的,MNV編碼的基因轉(zhuǎn)染到Vero細胞中,用10 ug/ml的puromycin處理30min,然后用puromycin抗體染色檢測蛋白翻譯情況,結(jié)果顯示NS3能夠抑制宿主蛋白翻譯,因為NS3陽性細胞(紅色)中puromycin信號(綠色)是降低的。

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