這里說的穩(wěn)轉細胞系的構建是指慢病毒轉染構建的穩(wěn)轉細胞系,可以構建表達細胞系,也能構建敲降細胞系,經常有人問我什么叫穩(wěn)轉和順轉的區(qū)別。瞬轉細胞系,一般情況下能夠穩(wěn)定表達最多長一周左右,而穩(wěn)轉細胞系,只要構建成功就能穩(wěn)定表達,沒有時間限制,但是也不是肯定的,一般實驗構建的細胞系超過 10 代以后,這個細胞系就有可能不靠譜了。 接下來,咱們講講穩(wěn)轉細胞系的構建。 一般來講 shRNA 用的是 HIV 病毒,雖然已經經過處理,但是一聽這名字也覺得滲人,無論如何保護自己是在實驗室永葆青春的基礎,所以一定要保護好自己,需要生物安全柜(往里吹風最好),或者超凈臺(把風給關了 (*^__^*))。(下圖是慢病毒構建載體示意圖) 病毒來了,需要分裝,-80 保存,反復凍融影響病毒活性,一般情況系,我是將病毒分成 10 ul 一管。其次是看清你自己的病毒情況,是熒光標記(一般 GFP),還是非熒光標記 (一般標簽蛋白是過表達是 Flag,敲降是 scramble)。 元元做的是腫瘤相關實驗,所以咱們這里講的是貼壁的腫瘤細胞的穩(wěn)轉,一定注意,元元講的是普適的方法,一定要看廠家的說明書。一般先用帶有 GFP 熒光的病毒摸一下合適的病毒量。先做一下預實驗,(別人都講 MOI 值,即感染時病毒與細胞數(shù)量的比值),元元不講。 1. 慢病毒轉染前 18~24 小時,將貼壁細胞 以 1×10^5(根據(jù)細胞大小而定,一般轉染前細胞長到 40-60% 為宜)孔鋪到 24 孔板中。使細胞在慢病毒轉染時的數(shù)量為 2×10^5/孔左右。 2. 加入 polybrene6-8 ug/ml(這個相當是破膜劑,只有細胞膜破了,病毒才有機會進入細胞內發(fā)揮作用),設置合適的病毒濃度梯度,比如 24 孔板,設置 5 個梯度,分別加入病毒量是 0,1,2,3,4,5 ul,37 ℃ 孵育。這時候用的是無血清的培養(yǎng)基培養(yǎng)。 3. 4~6 h 換液 (正常的含血清的新鮮培養(yǎng)基),繼續(xù)培養(yǎng),如果慢病毒含有熒光蛋白,一般轉染 48 小時后可見明顯熒光表達,72 小時后更加明顯。用熒光顯微鏡觀察細胞的轉染效率,一般病毒量達到一定程度之后就熒光強度就不再增加了。 4. 選擇一個合適的病毒量就可以做實驗了,如果 3ul 的時候病毒的轉染效率已經和后面的沒有區(qū)別了,在 24 孔板里,合適的病毒量就是 3ul。這時候就可以構建的穩(wěn)轉細胞系了。 5. 當你把實驗組對照組轉完病毒后 24 h 就可以進行嘌呤篩選,因為病毒轉完之后轉染效率不可能達到 100%,而慢病毒在構建的時候就含有嘌呤抗性基因,一旦轉入細胞,嘌呤抗性基因就能表達嘌呤抗性蛋白,可以抵抗嘌呤對細胞的殺傷作用。有人問了,嘌呤濃度怎么定 (一句話摸濃度,在 24 孔板里,設置不同濃度梯度,48 h 細胞全部殺死的濃度即為你要的嘌呤濃度),一般在 1 ug/ml 左右,所以設定濃度一般在 0~4 ug/ml。 常見問題解答 1. 元元,我病毒轉染效率不高怎么辦? 答:最簡單粗暴的方法是加大病毒量,不好使,那么就得從步驟入手了第一:4~6 h 換液的時間延長,8~10 h,設置過夜試試。還有一種是 4~6 小時換液的時候用的等量的有血清新鮮培養(yǎng)基稀釋原有的無血清的培養(yǎng)基,不撤掉病毒,繼續(xù)培養(yǎng) 24 小時,用新鮮培養(yǎng)基替換含有病毒的培養(yǎng)基。 2. 元元,我著急做實驗,我不用 24 孔板,行不行,我用瓶,用平皿行不行? 答:如果你病毒量足夠的話,完全可以。那怎么換算呢,根據(jù)細胞量或者培養(yǎng)基以及底面積自己算個大概的病毒量就行。 自己換算吧,元元數(shù)學不好。 3. 元元,還有個問題是不是擴增倍數(shù)越多越好? 答:這個不是的,HIV 病毒是逆轉錄病毒,會隨機插入基因組,擴增倍數(shù)越大,說明插入基因組的數(shù)量越多,這樣基因被損壞的越多,一般文章非編碼 6~8 倍左右,編碼基因 2~4 倍即可,太多了不好。 4.元元,還有個問題...... 答:今天打烊了。 作者:元元 |
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