細(xì)胞周期是指細(xì)胞分裂結(jié)束到下一次細(xì)胞分裂結(jié)束所經(jīng)歷的時(shí)間,它代表著生命從一代向下一代傳遞的連續(xù)過程,與前幾期我們介紹過的細(xì)胞學(xué)實(shí)驗(yàn)(細(xì)胞增殖、克隆形成等)一樣,細(xì)胞周期也是評價(jià)細(xì)胞增殖功能的重要實(shí)驗(yàn)。流式細(xì)胞儀是檢測細(xì)胞周期最常用的方法,然而我們會(huì)碰到細(xì)胞量不夠、細(xì)胞碎片太多等原因,導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)一次次重復(fù),本文就一起看看如何把細(xì)胞周期的數(shù)據(jù)變的更加漂亮,準(zhǔn)確!
一、細(xì)胞周期簡介
主要分為以下2大過程: 分裂間期:間期又分為三期、即DNA合成前期(G1期)、DNA合成期(S期)與DNA合成后期(G2期); 分裂期M期:細(xì)胞分裂期,指細(xì)胞分裂開始到結(jié)束。
細(xì)胞周期圖(來自網(wǎng)絡(luò))
注:G0期是指某些細(xì)胞在分裂結(jié)束后會(huì)暫時(shí)離開細(xì)胞周期,停止細(xì)胞分裂;但在一定適宜刺激下,又可進(jìn)入周期; 因?yàn)榉至验g期持續(xù)的時(shí)間遠(yuǎn)遠(yuǎn)比分裂期持續(xù)時(shí)間長,在一個(gè)正常細(xì)胞周期中,分裂間期時(shí)間會(huì)占整個(gè)細(xì)胞周期的90%~95%; 不同類型細(xì)胞的G1期時(shí)間長短不同,所以其細(xì)胞周期時(shí)間存在差異。如:人類胃上皮細(xì)胞為24小時(shí),骨髓細(xì)胞為18小時(shí),HeLa細(xì)胞為21小時(shí)。
二、常用的實(shí)驗(yàn)方法
細(xì)胞周期常用檢測方法有流式檢測法、BrdU(5-溴脫氧尿嘧啶核苷)摻入法及同位素標(biāo)記法等,其中流式檢測法因適用于大量樣品檢測,可快速分析單個(gè)細(xì)胞的多種特性,是目前最為常用的測定細(xì)胞周期的一種方法,下面就詳細(xì)介紹如何利用流式細(xì)胞儀進(jìn)行周期分析。
1. 流式檢測的實(shí)驗(yàn)原理
由于細(xì)胞周期各時(shí)相的DNA含量不同,因此,可通過特異性與DNA結(jié)合染料來檢測細(xì)胞內(nèi)的DNA含量來測定細(xì)胞周期。流式中常用碘化丙啶(Propidium,簡稱PI)與DNA結(jié)合,其熒光強(qiáng)度與DNA含量成正比。因此,通過流式細(xì)胞儀對細(xì)胞內(nèi)DNA含量進(jìn)行檢測,同時(shí)獲得的流式直方圖對應(yīng)的各細(xì)胞周期可通過特殊軟件計(jì)算各時(shí)相的細(xì)胞百分率。
2. 流式細(xì)胞儀的實(shí)驗(yàn)步驟
A. 收集細(xì)胞 取適量的對數(shù)生長期細(xì)胞接種于6cm中,在相應(yīng)的條件下(如藥物)處理相應(yīng)時(shí)間后,倒去培養(yǎng)基,用胰酶適度消化細(xì)胞,離心收集細(xì)胞,棄去上清;
Tips: 細(xì)胞數(shù)量:一般情況下,由于在細(xì)胞周期中分析的細(xì)胞數(shù)應(yīng)達(dá)到1.0*104~3.0*104才具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。因此,單次流式細(xì)胞儀檢測細(xì)胞周期時(shí),1份樣品的細(xì)胞數(shù)量至少為106; 細(xì)胞培養(yǎng)時(shí)間:一般藥物等處理時(shí)間最好是大于細(xì)胞增殖一代的周期,可根據(jù)具體細(xì)胞分裂時(shí)間決定,如乳腺癌細(xì)胞我們一般處理24h。
B. 清洗及固定細(xì)胞 用PBS清洗細(xì)胞2遍,吸凈離心管殘余的PBS后,加入300μL PBS重懸,將細(xì)胞吹散,避免細(xì)胞成團(tuán)。隨后將細(xì)胞懸液逐滴滴入700μL無水乙醇(預(yù)冷),即用70-75%的乙醇固定細(xì)胞,然后4℃固定過夜。
Tips:
C. 洗滌細(xì)胞 次日,離心收集細(xì)胞,用移液槍吸走上清,然后用1mL PBS重懸細(xì)胞并離心清洗2~3遍。
Tips:
D. RNA酶消化和PI染色 在避光條件下,每個(gè)樣品加入1避光 RNase (10mg/mL)和5和mg/m(5mg/mL)混勻后室溫避光條孵育30min。
E. 上機(jī)檢測 將檢測樣品轉(zhuǎn)移到5mL的流式管后用流式細(xì)胞儀檢測細(xì)胞周期,采用flowjo或modifit軟件進(jìn)行DNA含量分析。
Tips: 3. 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分析
常用的流式檢測法分析細(xì)胞周期的方法是根據(jù)細(xì)胞DNA含量(橫坐標(biāo))結(jié)合縱坐標(biāo)的細(xì)胞數(shù)量來分析的,如下的乳腺癌細(xì)胞系T47D細(xì)胞周期分布圖:
乳腺癌細(xì)胞系MCF-7細(xì)胞周期分布圖
圖形區(qū)(左側(cè))
G0/G1期:流式檢測結(jié)果圖的第一個(gè)峰;G1期是DNA含量最少的時(shí)期,DNA復(fù)制還沒有開始;G0期是細(xì)胞靜止期,不復(fù)制DNA,無法與G1期分開,所以報(bào)告為G0/G1期;
S期:在流式結(jié)果圖中顯示為第二個(gè)不高但很寬的峰;此時(shí)期細(xì)胞開始復(fù)制到完成復(fù)制,是一個(gè)一倍DNA到二倍DNA的過程;
G2/M期:流式檢測結(jié)果圖的第三個(gè)峰。G2期是DNA復(fù)制完成至分裂的一段時(shí)間,此時(shí)細(xì)胞內(nèi)含二倍DNA;M期是細(xì)胞分裂的過程,此時(shí)細(xì)胞內(nèi)是二倍DNA,無法與G2期分開,所以報(bào)告為G2/M期。
數(shù)據(jù)分析區(qū)(右側(cè)紅方框)
各時(shí)期比值:Dip G1-45.66% at 49.04表示G1期DNA含量平均值為49.04(2N),占細(xì)胞總數(shù)的45.66%。同理,Dip G2-15.12% at98.08則表示G2期DNA含量平均值為98.08(4N),占細(xì)胞總數(shù)的15.12%。以此類推,可以得知S期和G2/G1期的百分比;
CV:表示峰的變異系數(shù),一般CV越小,峰形越好,越尖銳;能控制在5%左右是比較好的結(jié)果,一般小于10%就被認(rèn)可了。
Debris:表示細(xì)胞碎片,越少越好;
其他:Aggregates:表示細(xì)胞聚集體;Modeled events:表示儀器檢測到的總細(xì)胞數(shù);All cycle events:表示在細(xì)胞周期中分析的細(xì)胞數(shù)(即排除了細(xì)胞碎片和聚集體)
舉例:如常用于研究藥物或者基因等對細(xì)胞周期阻滯的影響
通過比較Control組和藥物組,發(fā)現(xiàn)化合物影響乳腺癌細(xì)胞系MDA-MB231的細(xì)胞周期分布,處理組的G2/M期峰值變高,即G2/M期細(xì)胞數(shù)量增多,即藥將其阻滯在G2/M期。注:對于未處理的細(xì)胞一般都是分裂間期時(shí)間比分裂期長,即G1-S期>M期。
藥物處理MDA-MB231細(xì)胞后的周期分布圖[2]
常見問題解答
是否可以直接用70~75%的乙醇固定細(xì)胞? 不可以,直接70~75%乙醇加入很容易導(dǎo)致細(xì)胞聚團(tuán)現(xiàn)象,很難重懸成單細(xì)胞,影響固定效果,甚至容易導(dǎo)致固定后無細(xì)胞沉淀的現(xiàn)象。正確做法是:待細(xì)胞充分分散成單細(xì)胞后,緩慢地滴入無水乙醇中,使其終濃度為70~75%乙醇。
上機(jī)細(xì)胞量過少,無法獲得數(shù)據(jù)結(jié)果? 首先,要保證收集足夠的細(xì)胞樣品(個(gè)人經(jīng)驗(yàn)至少收集100萬左右);如果藥物處理后細(xì)胞死亡過多,應(yīng)該降低藥物濃度; 其次,固定細(xì)胞時(shí)先用預(yù)冷的PBS重懸細(xì)胞,再逐滴滴入無水乙醇中; 細(xì)胞清洗時(shí),不可過度吹打細(xì)胞,以防產(chǎn)生過多的細(xì)胞碎片; 最后,盡量采用尖底的離心管和水平的離心機(jī),離心后盡量用移液槍吸走上清,不要傾倒,殘留一點(diǎn),不要吸完;
什么樣的數(shù)據(jù)結(jié)果可以用? G2/M期細(xì)胞的DNA含量是G1期的2倍,在直方圖上形成一個(gè)2倍于G1信號峰的高斯峰; CV(變異系數(shù))表示峰的寬度,CV值越小,峰形越好,最好是在5%左右,一般小于10%也被認(rèn)可。 RCS最好是在1~3,高于5則不被認(rèn)可。RCS高,說明數(shù)據(jù)的分布和軟件所建立模型的預(yù)期值的差別比較大,可能由于處理細(xì)胞的時(shí)候RNA酶消化不好,或者是PI的濃度不佳造成的。
在實(shí)驗(yàn)操作過程中,如何提高G0/G1峰分辨率和精確度? 變異系數(shù)(Coefficient of Variation,CV值)反映G0/G1峰分辨率和精確度。而樣品CV值為樣品固有,與樣本制備過程中細(xì)胞質(zhì)量有關(guān)。細(xì)胞碎片越少、細(xì)胞聚團(tuán)越少、RNA酶消化越充分,可以減少樣本的CV值,提高G0/G1峰分辨率和精確度。
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