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科學(xué)松鼠會 ? 百歲老人的秘密

 皖林專欄 2013-05-05

“個人基因測序服務(wù)又添新產(chǎn)品:想知道您能否長命百歲?只需要刮取少量口腔上皮細胞,我們將為您解讀命運的天書!”

面對這樣的廣告,你是急不可待,躍躍欲試?還是絞著手帕,萬般糾結(jié)?若屬后者,令人心安的是這樣的產(chǎn)品遠未上市;而對于前者,則有捷報傳來——科學(xué)家們向此目標(biāo)大大邁進了一步。

波士頓大學(xué)生物統(tǒng)計系的保拉·薩巴斯蒂亞尼(Paola Sebastiani)與醫(yī)學(xué)院的托馬斯·波爾斯(ThomasPerls)所領(lǐng)導(dǎo)的研究團隊在《科學(xué)》雜志上發(fā)表論文,聲稱通過分析150個遺傳基因的記號,可以預(yù)測個人活過百歲的概率?!邦A(yù)測模型的正確率達到77%?!边@是否意味著已經(jīng)炙手可熱的個人基因測序業(yè)務(wù)將很快提供該項服務(wù)?波爾斯澄清:“作為文章作者,我們并不認為時機已經(jīng)成熟。”此外,除了預(yù)測,我們還能做些什么?這項研究是否意味著科學(xué)家們成功定位一百五十個“長壽基因”,進而很快就能弄清了長壽的生物機制,甚至可以利用醫(yī)藥或者基因工程的方式來促使人人長壽?薩巴斯蒂亞尼卻冷靜地告訴記者:“此刻所做的一切只是統(tǒng)計分析而已,若想要了解其中的生物機制,以及這些基因記號究竟為(人類長壽)做出了多大貢獻,還有許多工作要做。所以,這只是第一步?!蹦敲?,我們究竟應(yīng)該怎樣解讀這項科研的意義?且從這150個遺傳基因的記號從頭說起。

百里挑一的差異

我們絕大部分的遺傳密碼,記載在細胞核內(nèi)二十三對長鏈般的DNA上,而每條長鏈由四種核苷酸分子組成。你可以將核苷酸看做四色的珠子,千萬顆乃至上億顆這樣的珠子串在一起,它們的顏色和順序,記載了我們從雙親那里繼承而來的遺傳信息。如果從北京街頭隨便抓來兩個毫無親緣關(guān)系的陌生人,他們體內(nèi)每條長鏈99.5%以上的部分都是完全一致的。也就是說,這倆人之間,平均每上百顆珠子里,只有一顆的顏色不同。

如果在在一小段DNA里,只有一顆珠子在人群中有不同顏色(通常只有兩種顏色),這顆珠子所在的位置,就被稱作“單核苷酸多態(tài)性”(singlenucleotide polymorphism, 縮寫SNP,讀音snip)位點??v觀人類基因組,平均每一百到三百個核苷酸里會出現(xiàn)一個SNP位點,而我們個體基因組中90%的花樣,都以SNP的形態(tài)存在??梢哉f,每人都有一套顏色特異的SNP珠子,它們雖然相對數(shù)量不大,卻使得我們遺傳密碼個性鮮明,并為個體差異起到可觀的決定作用。

既然SNP如此關(guān)鍵,近年來,運用一種叫做全基因組關(guān)聯(lián)(genomewide association, 縮寫GWA,讀音giwa)分析的特殊研究手段,從眾多SNP位點中找到與特定健康狀況“有關(guān)”的那些,成為遺傳界炙手可熱的領(lǐng)域。簡而言之,這樣的研究通常找來兩組人群,一組有特定健康狀況——譬如患有某種疾病,而另一組沒有??茖W(xué)家們通過分子生物學(xué)的手段,確定每個被試個體體內(nèi)一組SNP珠子的顏色是紅是綠,再通過統(tǒng)計方法,計算紅色(或綠色)珠子是否特別容易出現(xiàn)在患有疾病的被試體內(nèi),如果答案衛(wèi)士,該SNP就被判為與這種疾病“相關(guān)”。

預(yù)示長壽的密文

過去五年里,利用GWA,科學(xué)家們已經(jīng)先后發(fā)現(xiàn)成百上千個SNP,分別與四十多種疾病相關(guān)——其中包括心血管疾病、糖尿病、自閉癥、癌癥等常見疾病。而本文開頭所提到的研究者,則找來兩組已過世的老人的血樣:一組特別高壽,終年在95歲到119歲;而另一組則與廣大群眾差別不大,終年在53歲到90歲之間。研究者先從二十六萬個SNP中,找出數(shù)十個各自與長壽相關(guān)的單個SNP位點;又建立統(tǒng)計模型,找到一套“具有預(yù)測性的”SNP,共有150個。通過確定每一個被試體內(nèi)這套SNP的顏色,他們可以計算出該個體活過百歲的概率——如果超過一半,就被定義為“很可能高壽”。由于被試的壽命都已知,把計算機算出來的結(jié)果和實際情況一比較,發(fā)現(xiàn)77%的百歲老人都確實被模型預(yù)測為高壽者,這,就是“準確性達到77%”的來源。

那這是否意味著,如果有人對你體內(nèi)這150個SNP進行測定,就能以77%的準確度預(yù)測你能否活到百歲呢?顯然并不是這么簡單。首先,GWA手段很容易受到被試的特定遺傳背景(譬如所屬人種)的影響,利用GWA手段所得到的類似研究結(jié)果,都需要在不同人群中得到多次重復(fù)確認,才能被學(xué)界認可。而預(yù)測的準確性,也很容易受到影響。事實上,波爾斯他們也在研究中重復(fù)過兩次,每次的準確性都不相同。

其次,“統(tǒng)計是最大的謊言”雖然是一句行內(nèi)人的笑話,但也說明對統(tǒng)計結(jié)果的解釋,需要格外謹慎:用任何統(tǒng)計方法計算出來的、代表概率或準確性的結(jié)果,嚴格來說,都只在統(tǒng)計學(xué)本身的范疇里有意義。在科學(xué)家們做出進一步的功能性實驗和分析之前,這些結(jié)果并沒有顯著的生物學(xué)意義。事實上,GWA所找到的大多數(shù)SNP,都很可能與長壽毫無關(guān)系,只是因為誤差、實驗設(shè)計的特點,或者這些SNP正巧和導(dǎo)致長壽的基因做了近鄰,才被找了出來。另外,這150個SNP遠未涵蓋所有與長壽相關(guān)的遺傳密碼——在異常高壽的老人中,有三十位被模型判斷為“活到百歲希望渺?!?,而他們之中不少人卻有著悠久的長壽家族史,這就暗示著還有其他促進長壽的遺傳因素并未被發(fā)現(xiàn)。

最后,科學(xué)家們最擔(dān)心的,則是如果這項研究被直接用于個人基因測序,會對每個接受測序的顧客產(chǎn)生什么樣的心理暗示——如果你知道自己基因優(yōu)良,會不會縱容自己抽煙酗酒?又或者如果你發(fā)現(xiàn)自己活過百歲的可能性不大,會不會自暴自棄,變成一只沙發(fā)土豆?事實上,雖然遺傳密碼對我們的健康起到至關(guān)重要的作用,但外界環(huán)境的影響卻絕對不容忽視——在很多情況下,環(huán)境的作用甚至遠遠大于基因。過于強調(diào)基因的作用,而忽略健康生活習(xí)慣的重要性,對于任何人,都將是一場災(zāi)難。有研究表明,基因?qū)ξ覀兪欠衲芑畹?5歲,只起到20-30%的作用。而就在這項研究之中,有15%的未活到百歲的被試卻被計算機定位為“高壽者”。換言之,他們很可能繼承了優(yōu)秀的長壽密碼,卻因為其他因素而無緣高壽。

剛剛起步的探索

對于生物醫(yī)學(xué)研究者,統(tǒng)計概率固然重要,但最關(guān)鍵的,恐怕是怎樣利用這些統(tǒng)計結(jié)果,來摸清生命現(xiàn)象之下的生理基礎(chǔ),并進一步探索能為人類健康服務(wù)的道路。這些年來,GWA研究之所以風(fēng)起云涌,則在于科學(xué)家們認為,它能有效地為進一步的研究指明方向,提供槍靶。在GWA之前,為了找到疾病的遺傳根源,遺傳學(xué)家往往需要做大量的家族連鎖分析。這樣的工作,相當(dāng)費時費力,并需要研究者提出預(yù)設(shè)猜想——猜測致病基因在DNA上的大致位置。而且,大多數(shù)常見疾病的罪魁禍首都可歸結(jié)于多個基因的共同作用,可傳統(tǒng)的遺傳連鎖分析卻對多基因分析效果不佳。而GWA相對簡便快捷,不需要任何關(guān)于基因位置的預(yù)設(shè),可以同時分析數(shù)以十萬計的遺傳基因位點,一舉找出多個與疾病有統(tǒng)計相關(guān)性的基因密碼,自然備受研究者的青睞。

GWA找到的與健康狀況相關(guān)的SNP位點中,有兩種對生物醫(yī)學(xué)研究意義重大:一種能直接影響基因功能的SNP位點。這些位點是紅是綠,往往可以決定該基因所制造出來的蛋白質(zhì)的序列、功能,直接影響生理。2005年,科學(xué)家們曾經(jīng)利用GWA一舉發(fā)現(xiàn)導(dǎo)致老年性黃斑變性(age-relatedmacular degeneration,一種在老人中極為常見的致盲因素)的基因“補體因子H”(ComplementFactor H)。這個基因與炎癥相關(guān),似乎和視力風(fēng)馬牛不相及,若非GWA研究,恐怕很少有人會想到它是重要嫌犯之一。另一種SNP位點,本身并不影響到任何基因的功能,可是卻因為與嫌犯在DNA上位置接近,被GWA發(fā)現(xiàn)??茖W(xué)家們于是可以順藤摸瓜,通過這些地圖標(biāo)識般的SNP,找到真正的罪魁禍首??峙麓蠖鄶?shù)的GWA研究所能找到的SNP,還是屬于這后一種情況。

薩巴斯蒂亞尼和波爾斯的研究中所找到的與長壽相關(guān)的SNP,有一些似乎確實在衰老機制中有著一席之地。這些SNP曾在過去的遺傳相關(guān)性研究中被發(fā)現(xiàn),與老年癡呆、肌肉萎縮、骨骼代謝、免疫應(yīng)激等方面相關(guān)。今后,它們將會作為備選基因,供研究衰老的科學(xué)家細細省視。另外,當(dāng)這篇文章的作者們分析那些兩千多個已知的、與老年疾病相關(guān)的SNP位點時,他們驚訝地發(fā)現(xiàn),這些SNP的分布,在長壽組與對照組之間,并沒有任何區(qū)別。這可能預(yù)示著,長壽的秘訣不在于免于繼承那些致病基因,而在于擁有一批“健康基因”,能延緩老年疾病的發(fā)作——事實上,大多數(shù)百歲老人,在他們九十來歲時,還相當(dāng)健康,少有病痛。

不過,這樣研究結(jié)果的復(fù)雜性意味著:想通過一兩個基因來全面解釋為何有人能特別長壽?這樣的努力不太可能“結(jié)出碩果”,英國紐卡斯特大學(xué)衰老與健康研究中心的主任托馬斯·柯克伍德(ThomasKirkwood)說,“我們不是在尋找那幾個設(shè)定生命時鐘的基因。事實的真相,當(dāng)它被揭露時,將會異常繁雜?!?/p>

參考文獻:

原文:

Sebastianiet al., Genetic Signatures of Exceptional Longevity in Humans,Science DOI: 10.1126/science.1190532,http://www./cgi/content/abstract/science.1190532v1

其他參考論文:

Cordell HJ, Clayton DG. Geneticassociation studies. 2005 Lancet366:1121-31.

Dawn Teare M, Barrett JH. Geneticlinkage studies. 2005 Lancet 366:1036-1044

Klein RJ et al., Complement Factor HPolymorphism in Age-Related Macular Degeneration 2005 Science 308:385-389

Pearson TA How to Interpret aGenome-wide Association Study. 2008 JAMA 299:1335-1344

Psychiatric GWAS ConsortiumCoordinating Committee, Cichon S et al., Genomewide association studies:history, rationale, and prospects for psychiatric disorders. 2009 Am JPsychiatry. 166:540-556

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