來(lái)自中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院、美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院、新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院等機(jī)構(gòu)的研究人員針對(duì)3項(xiàng)中國(guó)人群食管鱗狀細(xì)胞癌(esophageal squamous cell carcinoma ,ESCC)全基因組關(guān)聯(lián)（GWAS）研究進(jìn)行了聯(lián)合分析，結(jié)果發(fā)表在8月17日的《自然遺傳學(xué)》（Nature Genetics）雜志上。

中國(guó)工程院院士、中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué)腫瘤醫(yī)院腫瘤研究所的林東昕(Dongxin Lin)教授、新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院的王立東（Li-Dong Wang）教授以及美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院的Philip R Taylor是這篇論文的共同通訊作者。

食管癌是世界上最常見(jiàn)的六大惡性腫瘤之一，也是中國(guó)最常見(jiàn)的惡性腫瘤，居中國(guó)惡性腫瘤死因的第四位。由于早期無(wú)明顯特異的臨床癥狀，大多數(shù)患者發(fā)現(xiàn)確診已到中晚期，5年生存率只有10%左右。食管癌從組織病理學(xué)類型可分為鱗狀細(xì)胞癌和腺癌。在中國(guó)的食管癌主要是鱗狀細(xì)胞癌，約占95%。

食管癌主要的流行病學(xué)特征是顯著的地域性分布差異。河南、河北、山西三省交界處的太行山南麓是中國(guó)、乃至于全世界食管癌發(fā)病率和死亡率最高的地區(qū)。食管癌的另一個(gè)流行病學(xué)特征是明顯的家族聚集現(xiàn)象。提示遺傳因素在食管癌的發(fā)生中占有相當(dāng)重要的地位。

全基因組關(guān)聯(lián)分析（Genome-wide association study，GWAS）是一種對(duì)全基因組范圍內(nèi)的常見(jiàn)遺傳變異（單核苷酸多態(tài)性和拷貝數(shù)）基因總體關(guān)聯(lián)分析的方法，在全基因組范圍內(nèi)進(jìn)行整體研究，能夠一次性對(duì)疾病進(jìn)行輪廓性概覽，適用于復(fù)雜疾病的研究。在全基因組層面上，開(kāi)展多中心、大樣本、反復(fù)驗(yàn)證的基因與疾病的關(guān)聯(lián)研究，有可能全面揭示出疾病發(fā)生、發(fā)展與治療相關(guān)的遺傳基因。

近年來(lái)，包括林東昕、王立東在內(nèi)的中國(guó)科學(xué)家研究團(tuán)體通過(guò)大樣本的病例-對(duì)照研究，對(duì)中國(guó)人群的ESCC遺傳傾向特征展開(kāi)了廣泛的分析研究，采用GWAS技術(shù)篩查出了一些易感SNP位點(diǎn)和基因，并深入地分析了ESCC與吸煙、飲酒、暴露于特定化學(xué)致癌物等環(huán)境因素和生活方式之間的關(guān)系。使得我國(guó)的食管癌易感基因研究居于國(guó)際先進(jìn)水平。

在這篇新文章中，研究人員對(duì)于以往林東昕院士、王立東教授和美國(guó)國(guó)立研究院的三項(xiàng)GWAS研究進(jìn)行了兩階段聯(lián)合分析。研究人員首先分析了5,337例中國(guó)ESCC和5,787名對(duì)照，隨后又在9,654例ESCC病例和10,058對(duì)照中進(jìn)行了驗(yàn)證。在對(duì)年齡、性別、兩特征向量等均進(jìn)行了調(diào)整的logistic回歸模型中，研究人員確定了由rs7447927 at 5q31.2 (per-allele odds ratio (OR) = 0.85, 95% confidence interval (CI) = 0.82–0.88; P = 7.72 × 10?20)，和rs1642764 at 17p13.1 (per-allele OR = 0.88, 95% CI = 0.85–0.91; P = 3.10 × 10?13)標(biāo)記的、具有全基因組意義的兩個(gè)新位點(diǎn)。rs7447927是TMEM173基因中的一個(gè)同義SNP，rs1642764則是ATP1B2基因中、靠近TP53的一個(gè)內(nèi)含子SNP。此外，他們還在具有最高ESCC風(fēng)險(xiǎn)的兩個(gè)群體中鑒別出了定位在6p21.32上HLA-II區(qū)域中、具有全基因組意義的一個(gè)位點(diǎn)。

聯(lián)合分析鑒別出了一些新的ESCC易感位點(diǎn)以及ESCC高風(fēng)險(xiǎn)的太行山區(qū)域人群所特有的一個(gè)新位點(diǎn)。這為我們更深入地了解食管癌的發(fā)病機(jī)制，為食管癌高危人群預(yù)警、早期診斷、個(gè)體化預(yù)防和治療以及新型高效藥物的篩選提供了理論依據(jù)和分子靶標(biāo)。

參考原文：

Joint analysis of three genome-wide association studies of esophageal squamous cell carcinoma in Chinese populations

來(lái)源：生物通

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