作為一個(gè)既沒有任何經(jīng)費(fèi)也沒有基礎(chǔ)科研條件的醫(yī)學(xué)小白,需要申請課題,該怎么辦呢?俗話說得好:”辦法總比困難多”。沒有經(jīng)費(fèi)、沒有經(jīng)驗(yàn)的情況下,也能想到并設(shè)計(jì)好一個(gè)課題,進(jìn)行申請基金。當(dāng)然,作為小白,申請課題肯定要申請入門級別的,例如校級課題、市級課題,畢竟是沒有辦法來做預(yù)實(shí)驗(yàn)的。 作為醫(yī)學(xué)小白,我們可以設(shè)計(jì)可行性比較強(qiáng)、套路化比較成熟的課題,ceRNA相關(guān)的課題正好符合這些特點(diǎn),非常適合小白。下面分享一下如何設(shè)計(jì)ceRNA相關(guān)的課題: 首先,我們要知道ceRNA機(jī)制:circRNA或者lncRNA通過調(diào)控下游的miRNA的表達(dá),進(jìn)而調(diào)控mRNA的表達(dá)。也就是說做ceRNA需要三個(gè)分子:circRNA(lncRNA)、miRNA、mRNA,找到其中的一個(gè)分子就可以找到突破口了。 我們可以找到一個(gè)circRNA或者lncRNA作為突破口,進(jìn)而找到下游miRNA、mRNA,也可以采用逆推法,先找到一個(gè)基因作為突破口,進(jìn)行預(yù)測上游的miRNA,進(jìn)而得到上游的lncRNA或者circRNA。現(xiàn)在都流行結(jié)合熱點(diǎn)進(jìn)行設(shè)計(jì)課題,所以我們更加喜歡采用逆推法。 我們可以確定一個(gè)熱點(diǎn)基因作為突破口進(jìn)行設(shè)計(jì)ceRNA課題。如何確定一個(gè)值得深入研究的熱點(diǎn)基因呢?首先,可以多看文獻(xiàn),從文獻(xiàn)中找到這樣的基因,當(dāng)然,很多時(shí)候往往是找不到的,或者沒有足夠的時(shí)間來看文獻(xiàn),這種方法根本行不通。還有沒有別的方法呢?肯定是有的,例如我們可以利用挖掘TCGA數(shù)據(jù)庫的方法:通過差異分析、Cox分析、表達(dá)與臨床的相關(guān)性分析來篩選一個(gè)值得深入研究的熱點(diǎn)基因。 END 下方查看歷史文章 |
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