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江蘇大學張禎Anal. Chem.:基于MOFs與核酸相互作用的DNA探針用于生物傳感!

 崛步化學 2023-03-18 發(fā)布于北京

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研究內容


將DNA探針吸附到納米材料上是一種很有前途的生物測定策略,通常使用熒光或催化活性來產生信號。盡管重要,但目前對建立在納米材料-DNA相互作用基礎上的傳感行為缺乏系統(tǒng)的理解,極大地限制了合理的方法設計及其后續(xù)應用。

江蘇大學張禎教授課題組通過使用多功能金屬有機框架(MOFs)(FeTCPP?UiO-66)作為模型來研究MOFs-DNA相互作用,主要通過將血紅素樣配體FeTCPP整合到常用的MOFs(UiO-66)中來合成。結果表明,吸附在FeTCPP?UiO-66上的熒光標記DNA通過光誘導電子轉移、熒光共振能量轉移和內部過濾效應被猝滅?;诖嗽O計了一種針對黃曲霉毒素B1的熒光/比色雙模檢測方法,獲得了令人滿意的檢測性能。相關工作以“Insight into the Sensing Behavior of DNA Probes Based on MOF-Nucleic Acid Interaction for Bioanalysis”為題發(fā)表在國際著名期刊Analytical Chemistry上。

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研究要點


要點1. 在不同的DNA結構中,FAM標記的ssDNA和發(fā)夾DNA可以緊密地吸附在FeTCPP?UiO-66上,并伴隨著通過PET、FRET和IFE的熒光猝滅。然而,粘端dsDNA和適體-靶標結合也被FeTCPP?UiO-66吸附,這阻礙了響應靶標刺激的熒光信號的產生。相比之下,HCR產生的長dsDNA在FeTCPP?UiO-66猝滅中可以很大程度上保留熒光,這可以用于信號放大。

要點2. DNA探針的結構依賴性吸附行為也影響了FeTCPP?UiO-66的過氧化物酶樣活性。得益于其柔性結構和與FeTCPP?UiO-66的強大相互作用力,ssDNA可以通過阻斷底物的可及性來最大限度地抑制FeTCPP?UiO-66的活性。這種抑制強烈依賴于鏈長,但與堿基組成無關。

要點3. 作者建立了一種用于快速、高靈敏度檢測黃曲霉毒素B1(AFB1)的雙模生物傳感器,其中兩個信號的相互驗證用于克服環(huán)境干擾。

該研究對DNA探針在納米材料上的吸附行為提出了一些新的概念,表明基于MOFs-DNA相互作用構建生物傳感器具有很好的應用前景。

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研究圖文


圖1.(A)FeTCPP?UiO-66合成過程的示意圖。(C)FeTCPP?UiO-66的TEM。(D)FeTCPP?UiO-66的XRD。(E)FeTCPP和FeTCPP?UiO-66的FTIR。FeTCPP?UiO-66的(F)Fe 2p和(G)Zr 3d的(F,G)高分辨率XPS。
圖2.(A)FeTCPP?UiO-66對FAM熒光猝滅的機制。(B)FAM染料和FeTCPP?UiO-66的能級。(C)FAM的激發(fā)和發(fā)射光譜以及FeTCPP?UiO-66的吸收光譜。(D)FeTCPP?UiO-66存在或不存在下不同DNA結構的熒光光譜。(E)吸附有FAM標記的(a)發(fā)夾DNA和(b)HCR產物的FeTCPP?UiO-66的共聚焦顯微鏡圖像。左欄表示亮場圖像,中欄表示熒光圖像,右欄表示左欄和中欄的合并圖像,所有比例尺均為2 μm。(F)在FeTCPP?UiO-66猝滅下HCR產物的熒光保留方案。(G)吸附在FeTCPP?UiO-66上的FAM適體的“開啟”熒光信號的方案(a)通過靶雜交誘導的探針釋放以及(b)基于不同DNA結構的不同吸附親和力。(H)FAM適體通過“預混合”和“后混合”方案的相對熒光強度。
圖3.(A)吸附的DNA阻斷過氧化物酶底物對FeTCPP?UiO-66表面的可及性的示意圖。(B)吸附的DNA對FeTCPP?UiO-66對用H2O2(C-H)氧化ABTS和TMB的催化活性的影響。(C-H)ABTS和TMB反應溶液在裸露或不同DNA處理的FeTCP?UiO-66存在下的典型紫外-可見吸收光譜和照片(插圖)。(I)(a)裸露的FeTCPP?UiO-66,(b)ssDNA處理的FeTCPP?UiO-66,(c)發(fā)夾狀DNA處理的FeTCPP?UiO-66,(d)粘端dsDNA處理的FeTCPP?UiO-66,(e)dsDNA處理的FeTCPP?UiO-66和(f)HCR產物處理的FeTCPP?UiO-66對ABTS和TMB氧化的相對活性。(J)在不同濃度的ssDNA存在下,FeTCPP?UiO-66對ABTS(綠點)和TMB(藍點)氧化的催化活性。(K)用300 nM ssDNA處理不同濃度的FeTCPP?UiO-66的活性。
圖4.(A)基于MOF-DNA相互作用的AFB1檢測雙模傳感策略的示意圖。(B)傳感器的紫外-可見吸收光譜對0至324.0 nM的不同濃度的AFB1作出響應。(C)418 nm處的吸光度與AFB1濃度在1.0至144.0 nm范圍內的線性關系。(D)分析平臺的熒光光譜對0至259.2 nM的不同濃度的AFB1作出響應。(E)520 nm處的熒光強度與AFB1濃度在0.1至259.2 nM范圍內的線性關系。

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文獻詳情


Insight into the Sensing Behavior of DNA Probes Based on MOF-Nucleic Acid Interaction for Bioanalysis
Dinghui Xiong, Jie Cheng, Fengxiang Ai, Xinyu Wang, Jiaxuan Xiao, Fang Zhu, Kun Zeng, Kun Wang, Zhen Zhang*
Anal. Chem.
DOI: 10.1021/acs.analchem.3c00832

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