轉(zhuǎn)錄組測(cè)序背景簡(jiǎn)介 狹義的轉(zhuǎn)錄組默認(rèn)只包含mRNA,但是廣義的轉(zhuǎn)錄組指的是細(xì)胞或組織中所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合,其中包含mRNA和非編碼RNA(non-coding RNA, ncRNA)。非編碼RNA目前的研究多集中在具有調(diào)控功能的small RNA(以miRNA為代表),長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNA, lncRNA)和環(huán)狀RNA(circular RNA, circRNA)上,而這幾類(lèi)ncRNA的調(diào)控對(duì)象都和mRNA有關(guān)。因此,全轉(zhuǎn)錄組即包含了ncRNAs和mRNA。全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序即對(duì)以上四種ncRNA進(jìn)行測(cè)序,并分析這四者之間復(fù)雜的相互作用關(guān)系。 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)優(yōu)勢(shì) 文庫(kù)優(yōu)化:針對(duì)不同長(zhǎng)度序列采用兩種文庫(kù)構(gòu)建方法,去核糖體鏈特異性文庫(kù)可獲得mRNA、lncRNA和circRNA信息。 數(shù)據(jù)全面:全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序可獲取4類(lèi)主要RNA(miRNA,mRNA,lncRNA,circRNA)數(shù)據(jù),可對(duì)這些數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)分析及整合分析 關(guān)聯(lián)全面:通過(guò)對(duì)mRNA /miRNA/lncRNA/circRN序列測(cè)定及后續(xù)分析,深入開(kāi)展全轉(zhuǎn)錄組調(diào)控網(wǎng)絡(luò)(ceRNA網(wǎng)絡(luò))分析 |
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