1600多年前，邵伯古鎮(zhèn)以東還是茫茫湖面，有古艾菱湖、淥洋湖、荇絲湖和星蕩湖等湖蕩。謝安在邵伯古鎮(zhèn)西側(cè)筑埭，護(hù)佑低洼農(nóng)田，使揚(yáng)州到邵伯一帶成為宜居之地，僅在低洼處留有湖泊，古邗溝就從中穿過，這里成為一塊風(fēng)水寶地。

邵伯湖最早見于《水經(jīng)注》中，當(dāng)時(shí)叫武廣湖。北魏酈道元在《水經(jīng)注》中描述，邗溝開挖的時(shí)候，引江水經(jīng)茱萸灣北上，在武廣湖（今邵伯湖）和陸陽湖（淥洋湖）之間，到宋代才開始有邵伯湖之稱。邵伯古鎮(zhèn)中大街古巡檢司的院子里有一棵古甘棠樹，據(jù)說就是因念謝安筑埭治水有功而植，邵伯湖因而又名甘棠湖。那時(shí)，邵伯湖還僅是一個(gè)小型湖泊。

一直到明代，邵伯湖水系井然，在汩汩清流的滋潤下，揚(yáng)州東北部平原桑麻披綠，稻麥飄香，較少水旱災(zāi)害。邵伯湖風(fēng)帆漁槕，往來不絕，邵伯荷花遠(yuǎn)近聞名。宋代文章太守歐陽修嘗曾主持操辦了“荷花酒筵”。清代的鄒熊寫道：“揚(yáng)州女兒紅羅襦，阿姊搖船阿妹俱。姊采蓮花妹采葉，要他葉上走明珠。”

1431年，平江伯陳瑄開芒稻河，修筑運(yùn)河大堤，以抬高運(yùn)河的水位，保證京杭大運(yùn)河的通航，這樣就形成了兩湖夾一河（東為古淥洋湖、艾菱湖、西為古邵伯湖）的雛形。

     明朝中期以后，黃河泥沙淤積，洪澤湖、高郵湖、邵伯湖底抬高，洪澤湖和高郵湖逐漸變?yōu)閼液粸榱吮ｄ钸\(yùn)，人為抬升運(yùn)河水位，不斷加高運(yùn)河大堤，運(yùn)河以東地區(qū)則形成里下河洼地。

運(yùn)河以西地區(qū)，運(yùn)河水位上升，這樣一來，邵伯湖的形勢嚴(yán)峻了起來。萬歷年間江都縣知縣張寧說：“過去高郵、寶應(yīng)問題嚴(yán)重，現(xiàn)在邵伯的問題更嚴(yán)重?！庇谑菦Q定開河。本來準(zhǔn)備從瓦窯鋪開河，但是當(dāng)時(shí)揚(yáng)州沿河(灣頭)已有集市、街道，于是決定在邵伯鎮(zhèn)南金家灣開河。

1595年，為了防止明祖陵被淹和保護(hù)漕運(yùn)，當(dāng)時(shí)的總理河督楊一魁接萬歷皇帝旨意，開始實(shí)施“分黃導(dǎo)淮”工程，開挖金灣河，修建金灣北閘和芒稻減水閘，加高運(yùn)河大堤，引黃濟(jì)運(yùn)，從此，拉開黃河、淮河水自揚(yáng)州入海、入江的序幕。

每年汛期，黃河、淮河洪水一路上浩浩蕩蕩，鋪天蓋地，沖向低洼的東南方，邵伯湖一時(shí)間風(fēng)急水吼，濁浪滔天，給揚(yáng)州地區(qū)的人民帶來深重災(zāi)難。

邵伯地處高郵、江都交通要到，明清以來一直都是官府漕運(yùn)的咽喉要地，是黃河、淮河洪水入江的重要通道。為了力保邵伯古鎮(zhèn)以東地區(qū)不被淹，開始不斷加高堤壩，以阻擋洪水對里下河洼地的侵襲。水漲壩高，又由于黃河水泥沙淤積，湖底不斷淤積，使邵伯湖逐漸成為一個(gè)湖底高過東部平地的懸湖。

由于接納了黃河、淮河的洪水，邵伯湖則由一個(gè)小湖逐漸演變?yōu)榇蟮暮?。明萬歷《江都縣志》云：邵伯運(yùn)河以西有“邵伯、黃之、赤岸、新城、白茆、朱家六湖”。 清代乾隆皇帝曾形容邵伯湖：“東西南北四湖通，謝傅遺休擬召公。” 這說明當(dāng)時(shí)的邵伯湖四面都是湖泊，黃河、淮河洪水南泄，小湖才匯聚成了大的的邵伯湖。

當(dāng)時(shí)，漕運(yùn)都要經(jīng)邵伯湖而過，湖面風(fēng)大浪急，為了解決了邵伯湖的風(fēng)濤之險(xiǎn)。1600年，邵伯湖開通月河（里運(yùn)河），避免了邵伯湖風(fēng)浪大，船舶經(jīng)常翻船的劫難，形成了東為里下河洼地、中為運(yùn)河、西為邵伯湖的格局。

   1851年，黃河、淮河大水，沖毀三河壩，洪水下泄，入寶應(yīng)湖、高郵湖、邵伯湖，以金灣河、芒稻河、廖家溝、夾江至三江營入江。至此，形成淮河入江水道。黃河、淮河的洪水全部由此南排入江。每當(dāng)洪汛季節(jié)，淮河水不能順利下泄，又受長江江水壅托，又進(jìn)一步抬高了運(yùn)西諸湖的水位，使邵伯湖湖面日漸拓寬。

1855年黃河雖然北去，但淮河本身就是一條洪水肆虐的大河，淮河入海通道已經(jīng)完全淤塞，洶涌的洪水涌入邵伯湖中，引起災(zāi)害仍然很大。

1931年的大水，邵伯鎮(zhèn)慘遭滅頂，決堤的洪水吞嚙了幾千條生命，邵伯以東地區(qū)，一片汪洋。