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諾獎(jiǎng)級(jí)技術(shù)CRISPR二代啟動(dòng)商用有望改寫人類疾病療法(開發(fā)了可編程分子機(jī)器它可以進(jìn)入到細(xì)胞中選定的DNA位點(diǎn)直接將一個(gè)堿基轉(zhuǎn)換為另一個(gè)堿基而不會(huì)造成DNA雙鏈斷裂)

 山峰云繞 2018-05-15

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(開發(fā)了可編程分子機(jī)器它可以進(jìn)入到細(xì)胞中選定的DNA位點(diǎn)直接將一個(gè)堿基轉(zhuǎn)換為另一個(gè)堿基而不會(huì)造成DNA雙鏈斷裂)

CRISPR 的問(wèn)世帶來(lái)了基因編輯的黃金時(shí)代,而在《Science》不久前的一篇報(bào)道中,CRISPR 已經(jīng)被認(rèn)為是“諾獎(jiǎng)級(jí)技術(shù)”。無(wú)數(shù)科學(xué)家都在擁抱這項(xiàng)技術(shù),希望用其幫助人類攻克疾病,另外,也有不少科學(xué)家成立公司,將這項(xiàng)技術(shù)投入到新型藥物、療法、食品的研發(fā)之中,其中就包括兩位頂尖華人科學(xué)家—— 麻省理工學(xué)院教授張鋒(Feng Zhang)和哈佛大學(xué)教授劉如謙(David Liu)。

就在今天,由張鋒和劉如謙等人共同創(chuàng)立的 Beam Therapeutics 對(duì)外宣布了最新的融資進(jìn)展,高達(dá) 8700 萬(wàn)美元的 A 輪融資由 F-PrimeCapitalPartners 和 ArchVenturePartners 領(lǐng)投。

此外,哈佛大學(xué)也已經(jīng)授予 Beam Therapeutics 公司全球授權(quán),準(zhǔn)許團(tuán)隊(duì)開發(fā)并商業(yè)化其一系列用于治療人類疾病的革命性基因編輯技術(shù)。其中的關(guān)鍵技術(shù)就是被稱為“ CRISPR 2.0 ”的堿基編輯(base editing)——這種基因編輯方法將有可能用于一系列目前還沒(méi)辦法徹底治愈的遺傳疾病。

諾獎(jiǎng)級(jí)技術(shù)CRISPR二代啟動(dòng)商用,有望改寫人類疾病療法!

圖丨Beam Therapeutics團(tuán)隊(duì):CEO John Evans 及聯(lián)合創(chuàng)始人劉如謙、Keith Joung、 張鋒(從左至右)

“我們開發(fā)了可編程分子機(jī)器,它可以進(jìn)入到細(xì)胞中選定的 DNA 位點(diǎn),直接將一個(gè)堿基轉(zhuǎn)換為另一個(gè)堿基,而不會(huì)造成 DNA 雙鏈斷裂”,劉如謙說(shuō)。

這一獲批的技術(shù)平臺(tái)不僅能夠?qū)崿F(xiàn)堿基編輯,還能夠通過(guò)使用其他的相關(guān)技術(shù),擴(kuò)大堿基編輯的作用范圍,為基因編輯治療創(chuàng)造更廣泛的人類遺傳條件。

“堿基編輯是一個(gè)強(qiáng)大的技術(shù),可以處理其他基因編輯技術(shù)難以處理的大量遺傳病”,哈佛大學(xué)技術(shù)發(fā)展辦公室(Office Of Technology Development)商業(yè)發(fā)展主任 Vivian Berlin 說(shuō)。

諾獎(jiǎng)級(jí)技術(shù)CRISPR二代啟動(dòng)商用,有望改寫人類疾病療法!

圖丨Vivian Berlin

目前,Beam Therapeutics 專注于四大領(lǐng)域的發(fā)展:

  • 基因矯正:修正致病的突變,引入臨床上有益或起到抑制作用的變異;
  • 基因調(diào)節(jié):編輯基因的調(diào)控元件;
  • 基因沉寂:引入終止密碼子,從而關(guān)閉基因的翻譯;
  • 基因重編碼:通過(guò)編輯密碼子改變蛋白質(zhì)的氨基酸序列。
諾獎(jiǎng)級(jí)技術(shù)CRISPR二代啟動(dòng)商用,有望改寫人類疾病療法!

(資料來(lái)源:Beam Therapeutics)

哈佛大學(xué)高級(jí)副教務(wù)長(zhǎng)兼首席技術(shù)開發(fā)官 Isaac T. Kohlberg 對(duì)這一技術(shù)的評(píng)價(jià)頗高,“其中蘊(yùn)藏的機(jī)會(huì)不僅是局限在疾病治療上,而且可能從根本上改變醫(yī)學(xué)實(shí)踐?!?/p>

改變游戲規(guī)則的創(chuàng)新

眾所周知,人類基因包含 60 億個(gè) DNA 堿基,這些化學(xué)堿基通過(guò) A、C、G、T 來(lái)表達(dá)。這些堿基通過(guò)配對(duì),比如 A 和 T、C 和 G,來(lái)組成 DNA 雙螺旋結(jié)構(gòu)。

但 DNA 序列有數(shù)以萬(wàn)計(jì)的變異都被認(rèn)為會(huì)導(dǎo)致疾病。而大多數(shù)與疾病相關(guān)的人類 DNA 變異是出自于點(diǎn)突變(point mutations),或是基因組中單個(gè)堿基對(duì)(base pair)被另一個(gè)堿基對(duì)取代。在已知的與疾病相關(guān)的 5 萬(wàn)種人類基因變異中,有 32000 種是由點(diǎn)突變?cè)斐傻模T如神經(jīng)退行性疾?。╪eurodegenerative)、代謝疾病、血液疾病、視力或聽(tīng)力喪失等疾病都榜上有名。

諾獎(jiǎng)級(jí)技術(shù)CRISPR二代啟動(dòng)商用,有望改寫人類疾病療法!

圖丨遺傳性疾病與基因突變有關(guān) (資料來(lái)源:Beam Therapeutics)

使用 CRISPR 結(jié)合酶的基因組編輯技術(shù)如 Cas9 和 Cpf1,通過(guò)插入或刪去多個(gè)核苷酸來(lái)改變基因的方式,已經(jīng)展現(xiàn)出很大的發(fā)展前景,但如何干凈、有效地校正單個(gè)核苷酸仍有許多困難,而哈佛大學(xué)授權(quán)給 Beam Therapeutics 公司的堿基編輯技術(shù)恰恰能解決這樣的問(wèn)題。

劉如謙將此技術(shù)比喻為在工作上找到了對(duì)的工具。現(xiàn)有的基因組編輯方法是企圖改正點(diǎn)突變,包括使用 CRISPR/Cas9 系統(tǒng),將 CRISPR 作為分子剪刀進(jìn)行雙鏈 DNA 斷裂,然后依靠引入的 DNA 模板來(lái)指導(dǎo)校正。

然而,細(xì)胞內(nèi)的雙鏈斷裂會(huì)觸發(fā)末端連接過(guò)程,重新連接斷裂末端,但會(huì)導(dǎo)致隨機(jī)插入和刪除。因此,點(diǎn)突變的精確校正通常必須與這些不希望產(chǎn)生的副產(chǎn)物展開競(jìng)爭(zhēng)。此外,使用 CRISPR/Cas9 進(jìn)行精確校正通常依賴細(xì)胞組分,這些成分在活躍的分裂細(xì)胞中存在。

劉如謙解釋說(shuō):“相比于在特定的基因中修復(fù)造成疾病的突變,切割基因標(biāo)靶點(diǎn),更會(huì)破壞基因或造成基因突變變體?!?/p>

諾獎(jiǎng)級(jí)技術(shù)CRISPR二代啟動(dòng)商用,有望改寫人類疾病療法!

相比之下,劉如謙的哈佛實(shí)驗(yàn)室開發(fā)出了一種更精準(zhǔn)地 DNA 編輯工具,可以用來(lái)修改 DNA 單堿基。這種名為“堿基編輯”的基因編輯方法將有可能用于一系列目前還沒(méi)辦法徹底治愈的遺傳疾病。

堿基編輯事實(shí)上是將 CRISPR 進(jìn)行改良后的版本,可以每次只對(duì)單堿基進(jìn)行編輯,而不會(huì)造成 DNA 鏈斷裂。這種方法之所以有效,是因?yàn)槠鋵?shí)有時(shí)候 DNA 長(zhǎng)鏈中只會(huì)有某一對(duì)堿基發(fā)生變異,這種現(xiàn)象正是“點(diǎn)突變”。

具體而言,研究團(tuán)隊(duì)對(duì)現(xiàn)有 CRISPR 技術(shù)做了修改,使其靶向特定的單堿基。新的基因編輯工具可以重構(gòu)單堿基 A 的原子結(jié)構(gòu),使其重組為 G,從而觸發(fā)細(xì)胞對(duì)其他 DNA 鏈進(jìn)行修復(fù)以完成整個(gè)轉(zhuǎn)換過(guò)程。而最終的結(jié)果就是 A-T 堿基對(duì)被成功轉(zhuǎn)換為 G-C 堿基對(duì)。這種技術(shù)的精妙之處就在于,將基因編碼中的錯(cuò)誤進(jìn)行重寫,而不是像傳統(tǒng)編輯方法那樣對(duì) DNA 片段整體進(jìn)行剪輯或切除。

“標(biāo)準(zhǔn)的基因編輯方法,比如 CRISPR-Cas9,可能會(huì)對(duì) DNA 雙鏈結(jié)構(gòu)造成破壞。但如果目標(biāo)是要插入或敲除某些 DNA 堿基,這種方式還是非常有效的?!眲⑷缰t表示?!暗绻繕?biāo)僅僅是修復(fù)某個(gè)點(diǎn)突變,堿基編輯無(wú)疑是一種更安全有效的方式。”

他認(rèn)為,新的堿基編輯方法并不是要替代傳統(tǒng)的 CRISPR 基因編輯技術(shù),而是為治療某些疾病提供其他可選的方案。打個(gè)很容易懂的比方:如果說(shuō) CRISPR 是一把剪刀,那堿基編輯則更像一支鉛筆。

諾獎(jiǎng)級(jí)技術(shù)CRISPR二代啟動(dòng)商用,有望改寫人類疾病療法!

圖丨Beam公司單堿基編輯技術(shù)示意(資料來(lái)源:Beam Therapeutics)

"在過(guò)去一年半的時(shí)間里,我們已經(jīng)極大地?cái)U(kuò)展了堿基編輯技術(shù)的范圍",劉如謙說(shuō),"不僅擴(kuò)大了它們的目標(biāo)范圍,還提高了他們的目標(biāo) DNA 特性、創(chuàng)造了新的堿基編輯種類,而這可能對(duì)基因疾病的治療產(chǎn)生重大影響。"

"我們的終極目標(biāo)是: 在一個(gè)未經(jīng)修飾的生物體中,無(wú)論是人類、植物還是動(dòng)物,都能夠隨意地、安全地、高效地將 DNA 堿基改變?yōu)榱硪粋€(gè) DNA 堿基。如果我們能夠達(dá)到這一目標(biāo),那人類社會(huì)將因此受益無(wú)窮",劉如謙說(shuō)。

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