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生物信息學(xué)數(shù)據(jù)挖掘SCI文章怎么寫?——文獻(xiàn)精讀

 whtjzhuhe 2017-09-26




長(zhǎng)非編碼RNA(lncRNA)

近年來lncRNA在各種癌癥中起關(guān)鍵作用,包括非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)。因此在腫瘤研究中,lncRNA也開啟了研究處于火熱模式。今天為大家介紹一篇lncRNA 在肺癌中的研究。

                             

               

    首先簡(jiǎn)單介紹下全文的思路:在作者的研究中,主要專注于lncRNA LINC00968在NSCLC中的生物學(xué)功能和臨床意義。研究發(fā)現(xiàn)LINC00968在LUAD、LUSC組織中以及非小細(xì)胞肺癌中表達(dá)顯著增加。抑制LINC00968能夠在體外抑制NSCLC增長(zhǎng),遷移和侵襲。通過敲低LINC00968檢測(cè)凋亡相關(guān)蛋白BCL-2表達(dá)降低,BAX表達(dá)增加。同時(shí)作者觀察到Wnt信號(hào)通路參與LINC00968誘導(dǎo)的NSCLC進(jìn)展。作者推測(cè)LINC00968可以作為非小細(xì)胞肺癌的新型的預(yù)后生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)

    下面就來了解一下作者的研究?jī)?nèi)容吧。

利用數(shù)據(jù)庫篩選lncRNA

LINC00968在肺癌組織以及非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞系中表達(dá)顯著增高。

    首先作者通過oncomine數(shù)據(jù)庫分析發(fā)現(xiàn),LINC00968LUAD、LUSC組織中表達(dá)顯著上調(diào)。作者進(jìn)而在非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞系A549, H460, H1299, H1975, H358中驗(yàn)證發(fā)現(xiàn)LINC00968表達(dá)顯著高于正常細(xì)胞系BES-2B。推測(cè)LINC00968可能參與非小細(xì)胞肺癌惡性化進(jìn)程。

LINC00968的表型研究

1、敲減LINC00968抑制非小細(xì)胞肺癌增殖、遷移、侵襲能力。

    為了研究敲減LINC00968是否能夠影響非小細(xì)胞肺癌腫瘤發(fā)展進(jìn)程,作者向A549、H1299細(xì)胞中轉(zhuǎn)染敲減質(zhì)粒LV-shLINC00968以及對(duì)照質(zhì)粒LV-NC進(jìn)行有效的敲減LINC00968的表達(dá)。

  1. 通過cck8增殖實(shí)驗(yàn)檢測(cè)發(fā)現(xiàn),LV-shLINC00968可以顯著抑制細(xì)胞的存活。

  2. 細(xì)胞遷移侵襲實(shí)驗(yàn)證明,抑制LINC00968可以顯著抑制細(xì)胞的遷移侵襲能力。

2、過表達(dá)LINC00968,可以促進(jìn)非小細(xì)胞肺癌增殖、遷移、侵襲能力。

作者向A549、H1299細(xì)胞中轉(zhuǎn)染過表達(dá)質(zhì)粒LV-LINC00968以及對(duì)照質(zhì)粒LV-NC進(jìn)行有效的提高LINC00968的表達(dá)。cck8增殖實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞遷移侵襲實(shí)驗(yàn)證明過表達(dá)LINC00968,可以促進(jìn)腫瘤進(jìn)程。

3、敲減LINC00968可以引起A549細(xì)胞發(fā)生凋亡。

為了驗(yàn)證LINC00968是否參與調(diào)控腫瘤細(xì)胞的調(diào)亡,作者通過流式細(xì)胞術(shù)驗(yàn)證敲減LINC00968可以引起A549細(xì)胞凋亡的發(fā)生。同時(shí),敲減LINC00968可以下調(diào)凋亡抑制基因BCL2的表達(dá),以及上調(diào)促凋亡基因BAX的表達(dá)。

LINC00968的機(jī)制研究

為了探究LINC00968調(diào)控非小細(xì)胞肺癌進(jìn)程的機(jī)制,作者關(guān)注到Wnt/β-catenin信號(hào)通路。通過蛋白免疫印跡實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),下調(diào)LINC00968的表達(dá)可以引起β-catenin以及 CyclinD1表達(dá)顯著下調(diào),而GSK-3β的表達(dá)顯著上調(diào)。提示LINC00968可能參與調(diào)控Wnt/β-catenin 的活性。

在體外實(shí)驗(yàn)后,作者又進(jìn)行了體內(nèi)實(shí)驗(yàn)。通過構(gòu)建裸鼠腫瘤模型,作者向裸鼠體內(nèi)注射了A549的敲減LINC00968細(xì)胞株,腫瘤進(jìn)程受到抑制,并且呈時(shí)間依賴關(guān)系。腫瘤組織中BCL-2的蛋白表達(dá)水平降低,BAX蛋白表達(dá)水平升高,與體外結(jié)果一致。








    


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