今天我們承接上篇文章（如何根據(jù)疾病查SNP位點？）介紹進行l(wèi)ncRNA或者miRNA的SNP研究的時候，能用到的工具：

1.     lncSNP 2.0 http://210.46.80.146/lincsnp/search.php

這里我們通過疾病進行檢索，單擊Disease 以后我們在檢索框中輸入胃癌 Gastric cancer：

我們看到136條胃癌相關(guān)的SNP位點，其中涉及到的lncRNA有7146條：

數(shù)據(jù)我們可以下載查看。

2.     MirSNP：http://bioinfo./mirsnp/search/

這里的信息就包括了基因、miRNA和SNP的信息，我們可以通過miRNA進行檢索：

這里我們就看到了gene-miRNA-SNP的關(guān)系：

也就是說SNP導致miRNA與靶基因的結(jié)合調(diào)控異常從而調(diào)控靶基因表達。這樣的課題和文章非常多，比如：

1.   癌基因FNDC3B的3’UTR長度多態(tài)性介導miRNA調(diào)控鼻咽癌轉(zhuǎn)移機制的研究 （2016年中標基金）

2.   BER通路基因miRNA結(jié)合位點基因多態(tài)性與結(jié)直腸癌易感性的關(guān)聯(lián)及功能研究（2015年中標基金）

3.   MRP1/ABCC1基因3' UTR單核苷酸多態(tài)性介導miRNA對原發(fā)性肝癌多藥耐藥性的影響 （2014年中標基金）

4.   TRIOBP基因miRNA結(jié)合位點SNP對職業(yè)噪聲性聽力損失易感性的作用研究（2013年中標基金）

我們可以參考以前寫過的文章：（文章篇）S5E21: SNP，miRNA和lncRNA的課題設(shè)計？（文末兩個福利）

當然，這個數(shù)據(jù)庫還可以讓我們進行批量檢索：

比如我們通過多個基因進行檢索：

3.     lncRNASNP：http://bioinfo.life./lncRNASNP/

比如：

就可以通過snp查詢miRNA以及l(fā)ncRNA：

以及SNP位點的存在對miRNA與lncRNA結(jié)合的影響：

這個數(shù)據(jù)庫可以幫我們提出科學假說：由于SNP位點的存在，導致lncRNA與miRNA之間的結(jié)合異常，從而導致lncRNA對miRNA的sponge吸附作用異常，進而與疾病的發(fā)生發(fā)展產(chǎn)生聯(lián)系。

4.     miRdSNP：http://mirdsnp.ccr./index.php

我們可以通過Gene，miRNA，SNP和疾病進行檢索：

比如我們選擇Stroke，就檢索到了相關(guān)的分子：

總結(jié)：以上介紹的四個數(shù)據(jù)庫再加上前面介紹的SNP4Disease可以幫我們建立從疾病到SNP位點的聯(lián)系，至于SNP位點如何與疾病的發(fā)生發(fā)展相關(guān)，則要根據(jù)SNP所在的位點來確定。我們前面寫過一篇介紹，大家可以參考：

突變位點在非編碼區(qū)，這可怎么辦？