基因組序列數(shù)據(jù)和相關(guān)分析對(duì)于追蹤病原體的適應(yīng)、演化和突變情況至關(guān)重要，因此對(duì)于公共衛(wèi)生領(lǐng)域防范、準(zhǔn)備和應(yīng)對(duì)工作至關(guān)重要。它們對(duì)于疾病診斷、治療和疫苗研發(fā)也非常關(guān)鍵1。

在過去各次疫情中，由于多種因素，病原體基因組序列的發(fā)布一直被推遲，包括科學(xué)家希望保留使用其數(shù)據(jù)發(fā)表研究的權(quán)利、在分享成果方面猶豫不決、需要在速度和準(zhǔn)確性之間取得平衡、政府擔(dān)心對(duì)于由此產(chǎn)生的疫苗和療法的負(fù)擔(dān)能力等2。雖然病原體基因組序列信息很重要，但目前尚無共享這些數(shù)據(jù)的全球系統(tǒng)，并且共享數(shù)據(jù)的各種存儲(chǔ)庫和站點(diǎn)都按照不同原則和由存儲(chǔ)網(wǎng)站的競(jìng)爭(zhēng)動(dòng)機(jī)決定的條款運(yùn)行。這些不同的原則和條款妨礙了為公共衛(wèi)生目標(biāo)而共享和匯總數(shù)據(jù)。

回顧這一脫節(jié)系統(tǒng)的差距和弱點(diǎn)后，我們提出了三種解決方案：在存儲(chǔ)庫之間制定公共衛(wèi)生訪問協(xié)議，從而可以開展關(guān)鍵研究，而不受到不同使用條款的阻礙；存儲(chǔ)庫和科學(xué)期刊出版商整合形成技術(shù)解決方案，推動(dòng)承認(rèn)在原始數(shù)據(jù)方面的貢獻(xiàn)；將獲取這些數(shù)據(jù)納入目前正在談判中的大流行病防范、準(zhǔn)備和應(yīng)對(duì)國際協(xié)定中。

SARS-CoV-2基因組首次發(fā)布以來的故事證明了這一問題。科學(xué)家對(duì)病毒基因組進(jìn)行測(cè)序，并于2020年1月10日將測(cè)序結(jié)果發(fā)布給公眾3。文章發(fā)表在Virological.org（由愛丁堡大學(xué)[University of Edinburgh]的Andrew Rambaut管理的開放獲取網(wǎng)站）和GenBank（由美國國立衛(wèi)生研究院[NIH]管理的基因序列數(shù)據(jù)庫）。GenBank是國際核苷酸序列數(shù)據(jù)庫合作組織（International Nucleotide Sequence Database Collaboration，INSDC）的一部分，該組織還包括日本DNA數(shù)據(jù)庫（DNA Data Bank of Japan）和歐洲核苷酸檔案（European Nucleotide Archive）。測(cè)序結(jié)果還發(fā)布在全球共享流感數(shù)據(jù)倡議組織（Global Initiative on Sharing All Influenza Data，GISAID）數(shù)據(jù)庫，這是一個(gè)最初為流感基因序列建立的存儲(chǔ)庫，現(xiàn)已擴(kuò)展到包括其他病毒基因組。

多個(gè)存儲(chǔ)庫并存所帶來的問題因以下兩方面差異而加?。禾峁?shù)據(jù)所遵循的條款，以及管理數(shù)據(jù)后續(xù)使用、來源確認(rèn)和將數(shù)據(jù)納入下游應(yīng)用、診斷、治療或疫苗的規(guī)則（見表格）。

GISAID用戶和貢獻(xiàn)者受其數(shù)字訪問協(xié)議（DAA）的約束，每個(gè)用戶的身份經(jīng)過驗(yàn)證，以便DAA條款可以被強(qiáng)制執(zhí)行。根據(jù)該協(xié)議，用戶不得將提交給GISAID的任何數(shù)據(jù)共享或發(fā)布到其他非GISAID服務(wù)器，也不得將GISAID數(shù)據(jù)和與SARS-CoV-2基因序列相關(guān)的任何其他數(shù)據(jù)庫關(guān)聯(lián)。他們必須注明其在出版物中使用的數(shù)據(jù)來源，并盡最大努力與原始實(shí)驗(yàn)室合作，讓其科學(xué)家參與分析，并與他們合作開發(fā)從這些數(shù)據(jù)衍生出的產(chǎn)品，包括商業(yè)化產(chǎn)品。

Virological.org的服務(wù)條款規(guī)定，對(duì)網(wǎng)站的貢獻(xiàn)是根據(jù)知識(shí)共享署名-非商業(yè)-類似分享3.0非移植許可（CC BY-NC-SA 3.0）進(jìn)行授權(quán)，因此貢獻(xiàn)材料的用戶可以自由地以任何媒介或格式復(fù)制和重新發(fā)布，并可以通過轉(zhuǎn)換或在其基礎(chǔ)上構(gòu)建的方式調(diào)整材料。使用數(shù)據(jù)的人必須給予數(shù)據(jù)提供者適當(dāng)致謝。然而，這些數(shù)據(jù)不得用于商業(yè)目的。Virological .org將自己描述為一個(gè)論壇，盡管它扮演著數(shù)據(jù)共享的角色，類似于那些更正式地將自己定義為存儲(chǔ)庫的網(wǎng)站。

GenBank本身并沒有對(duì)其存儲(chǔ)數(shù)據(jù)的使用設(shè)立規(guī)則。它指出，“NCBI無法評(píng)估（知識(shí)產(chǎn)權(quán)和歸屬）聲明的有效性……因此……不能就信息的使用、復(fù)制或發(fā)布提供評(píng)論或無限制許可……”4 因此，對(duì)GenBank的貢獻(xiàn)實(shí)際上是不受監(jiān)管的。

對(duì)于追蹤可能出現(xiàn)流行和大流行的病原體的科學(xué)家和公共衛(wèi)生機(jī)構(gòu)而言，訪問免費(fèi)的非營利性存儲(chǔ)庫至關(guān)重要。儲(chǔ)存庫的多樣性以及相互競(jìng)爭(zhēng)和沖突的使用條款導(dǎo)致疫苗開發(fā)工具不夠理想、在研發(fā)工作中的地方或區(qū)域代表性不足、診斷方法不能快速定制、也未針對(duì)病原體原始株或新變異株進(jìn)行測(cè)試，以及基因組監(jiān)測(cè)中的流行病學(xué)特征失衡和不具代表性5。

為防范和應(yīng)對(duì)疫情，世界衛(wèi)生組織（WHO）召開了共享數(shù)據(jù)會(huì)議，但未能提供統(tǒng)一的指導(dǎo)或解決方案。無論是2021年“具有大流行和流行潛力的病原體全球基因組監(jiān)測(cè)戰(zhàn)略”（2021 Global Genomic Surveillance Strategy for Pathogens with Pandemic and Epidemic Potential），還是最近發(fā)布的《WHO病原體基因組數(shù)據(jù)共享指導(dǎo)原則》（WHO Guiding Principles for Pathogen Genome Data Sharing），都沒有就存儲(chǔ)庫及其規(guī)則或作用作出切實(shí)可行的決定。

當(dāng)然，收集病原體樣本并生成基因序列數(shù)據(jù)的研究人員的利益應(yīng)該受到保護(hù)。這種保護(hù)包括確保其數(shù)據(jù)用戶在發(fā)表結(jié)果或其他產(chǎn)出中對(duì)最初研究人員致謝。最初研究人員在進(jìn)一步研究或分析合作中也有合法權(quán)益。新工具和解決方案將取決于存儲(chǔ)庫、政府、貢獻(xiàn)者和用戶之間的協(xié)調(diào)、多學(xué)科和跨界關(guān)系。如果匯總數(shù)據(jù)是數(shù)據(jù)共享事業(yè)的一項(xiàng)基本目標(biāo)（就像存儲(chǔ)庫、政府和世衛(wèi)組織建議的那樣），那么不僅WHO原則應(yīng)闡明這一目標(biāo)，而且應(yīng)為此目標(biāo)協(xié)調(diào)多邊努力。

幾個(gè)關(guān)鍵步驟可以幫助解決目前全球病原體基因組序列數(shù)據(jù)共享系統(tǒng)和WHO方法中的弱點(diǎn)。首先，儲(chǔ)存庫可以相互簽訂正式的公共衛(wèi)生使用協(xié)議。例如，INSDC存儲(chǔ)庫和GISAID之間的這種協(xié)議將使簽署機(jī)構(gòu)的工作人員更容易獲得訪問和匯總數(shù)據(jù)、分析和報(bào)告變異的許可。作為交換，簽署機(jī)構(gòu)應(yīng)保證其工作人員不會(huì)在未經(jīng)許可的情況下轉(zhuǎn)移他人的存儲(chǔ)庫記錄。NIH為生物樣本轉(zhuǎn)移制定的簡(jiǎn)單函件協(xié)議（Simple Letter Agreement）提供了模板，可在此基礎(chǔ)上修改后用于上述目的。WHO可以創(chuàng)建和維護(hù)數(shù)據(jù)庫所有者之間協(xié)議的存儲(chǔ)庫，并牽頭協(xié)調(diào)和制定標(biāo)準(zhǔn)化、互操作性和共享規(guī)則。正在談判的國際流行病協(xié)定可專門為這一任務(wù)提供財(cái)政支持。

其次，可以部署技術(shù)解決方案，以促進(jìn)對(duì)數(shù)據(jù)貢獻(xiàn)者的致謝，并將其標(biāo)準(zhǔn)化。INSDC模式包括能夠進(jìn)行歸屬和引用的唯一登記號(hào)；其他措施可以包括軟件服務(wù)，使模板確認(rèn)自動(dòng)化，并創(chuàng)建對(duì)出版物和原始數(shù)據(jù)進(jìn)行表彰的機(jī)制。出版商也在探索一些措施，以確保文章中所依賴數(shù)據(jù)的提供者得到致謝。我們的目標(biāo)是使研究人員能夠開放地訪問聚合數(shù)據(jù)集，同時(shí)能夠確定每部分的提交者。GISAID在積極制定訪問和歸屬政策，但還可以為數(shù)據(jù)匯總提供更大便利。

最后，世界衛(wèi)生大會(huì)（World Health Assembly）召集了一個(gè)政府間談判機(jī)構(gòu)，起草關(guān)于疾病大流行防范、準(zhǔn)備和應(yīng)對(duì)工作的公約、協(xié)定或其他文書。目前的草案只要求擁有病原體基因組數(shù)據(jù)的政府將它們上傳到一個(gè)或多個(gè)自己選擇的“公開數(shù)據(jù)庫”。正如我們所指出的，核心問題不是政府擁有什么，而是研究人員擁有什么，以及他們共享材料的條款。因此，該協(xié)定可能為各國政府確立有意義的義務(wù)，即通過法律促進(jìn)數(shù)據(jù)共享和使用。此類法律可能規(guī)定政府研究人員和公共衛(wèi)生機(jī)構(gòu)（可能還有接受政府資助的組織）共享這些數(shù)據(jù)，而且可能包括在某些權(quán)利和諒解的前提下，為此類共享提供資助。

目前，地方和國家數(shù)據(jù)系統(tǒng)沒有連接，存儲(chǔ)系統(tǒng)在不同規(guī)則下運(yùn)行，相互沖突的政府優(yōu)先事項(xiàng)可能會(huì)造成干擾。未來準(zhǔn)備工作取決于數(shù)據(jù)系統(tǒng)之間的互操作性、更有效的數(shù)據(jù)使用、國際協(xié)調(diào)與合作以及關(guān)于歸屬和使用的明確、一致規(guī)則。

1. Armstrong GL, MacCannell DR, Taylor J, et al. Pathogen genomics in public health. N Engl J Med 2019;381:2569-2580.

2. Halabi S, Rourke M, Katz R. The effect of proprietary and attribution claims on data sharing during infectious disease emergencies. J Health Care Law Policy 2021;23:203-226.

3. Holmes EC. Novel 2019 coronavirus genome. Virological.org, January 10, 2020 (https:///t/novel-2019-coronavirus-genome/319).

4. National Institutes of Health. NCBI website and data usage policies and disclaimers (https://www.ncbi.nlm./home/about/policies/).

5. Joi P. Data-sharing in a pandemic: even though scientists shared more than ever, it still wasn't enough. Gavi, April 5, 2022 (https://www./vaccineswork/data-sharing-pandemic-even-though-scientists-shared-more-ever-it-still-wasnt-enough).