【原】PNAS | 結(jié)直腸癌相關(guān)腸道菌群可造成致癌的表觀遺傳特征

微生態(tài) 2021-04-13

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推薦：江舜堯

編譯：勝寒

編輯：小菌菌

法國巴黎東區(qū)大學(xué)EC2M3課題組Iradj Sobhani等人于2019年11月11日在PNAS發(fā)表題目為《Colorectal cancer-associated microbiota contributes to oncogenic epigenetic signatures》的文章，在對(duì)266個(gè)個(gè)體的初步研究中，結(jié)果表明表觀基因組(甲基化)DNA改變與CRC和微生物群組成相關(guān)。該研究促進(jìn)了我們對(duì)結(jié)腸畸形在結(jié)直腸癌發(fā)病機(jī)制中的作用的認(rèn)識(shí)和理解。

文章摘要

散發(fā)性結(jié)直腸癌(CRC)是宿主與其環(huán)境之間復(fù)雜相互作用的結(jié)果。環(huán)境壓力引起宿主細(xì)胞DNA改變，這種改變與癌癥的發(fā)生有關(guān)。本文在人和小鼠上對(duì)這些改變的表觀遺傳學(xué)性質(zhì)進(jìn)行了研究。無菌小鼠接受結(jié)腸鏡檢查正常的人的糞便或CRC患者的糞便，之后進(jìn)行7或14周的監(jiān)測(cè)。在人類糞便轉(zhuǎn)移后監(jiān)測(cè)異常的隱窩病灶、管腔菌群和DNA改變(結(jié)腸外顯子組測(cè)序和甲基化模式)。在小鼠結(jié)腸粘膜中，與CRC相關(guān)的微生物群誘導(dǎo)了更多的高甲基化基因。在CRC中，SFRP1、2、3、PENK、NPY、ALX4、SEPT9和WIF1高甲基化，但在正常組織或糞便捐贈(zèng)者的排泄物中沒有發(fā)現(xiàn)。在一項(xiàng)初步研究(n = 266)中，3個(gè)基因(Wif1、PENK和NPY)的血液甲基化水平與CRC異常密切相關(guān)。在一項(xiàng)驗(yàn)證研究中(n= 1000)，這些基因的累積甲基化指數(shù)(CMI)在CRCs中明顯高于對(duì)照組。此外，包括糞便免疫化學(xué)血液檢測(cè)在內(nèi)的多因素分析顯示，CMI是CRC患病的獨(dú)立危險(xiǎn)因素。最后，通過全基因組分析確定了血液中CMI較高個(gè)體的糞便細(xì)菌種類。與CRC相關(guān)的菌群異?？梢哉T導(dǎo)宿主基因的甲基化，而相應(yīng)CMIs和相關(guān)細(xì)菌是CRC潛在的生物標(biāo)志物。