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凝膠阻滯

 myhalic 2020-05-07

一、原理

電泳遷移率分析,也可稱作遷移電泳,凝膠電泳分析,凝膠遷移率分析,條帶移動(dòng)分析或者凝膠阻滯分析,這種方法常用來研究蛋白質(zhì)-DNA,蛋白質(zhì)-RNA的相互作用,對(duì)照泳道(不含蛋白質(zhì)的DNA/RNA探針)將出現(xiàn)單一的條帶。如果蛋白質(zhì)與片段結(jié)合,形成大的復(fù)合物,因此在凝膠上遷移的速度慢從來遷移率減低。

二、材料和試劑

1. DTTPromega)

2. poly-dIdC(Sigma)

3. 32P-labeledprobe

4. BSA(Sigma)

5. 常用化學(xué)品試劑(Sigma)

6. 濾紙(GEHeathcare)

三、步驟

1. 制備聚丙烯酰胺凝膠

1)裝配板,墊片,及夾具。用1%瓊脂糖封閉底部與側(cè)面,防止膠漏。

2)5%聚丙烯酰胺凝膠的制備

Platesize

Large

Medium

H2O

78 mL

39 mL

10×TBE

5 mL

2.5 mL

30%丙烯酰胺(19:1)

16.6 mL

8.4 mL

10%過硫酸銨

1000 uL

500 uL

3)混勻,盡量減少泡沫的形成。加100 uL/50 uLTEMED。
4)混勻后倒入膠板,插梳子。凝膠聚合大概需10分鐘。
5)聚合后,凝膠可用塑料膜包裹后4℃保存。

2. 制備5×結(jié)合緩沖液。

3. 結(jié)合反應(yīng)

1 uL poly-dIdC(1ug/uLinTE)

2 uL 5x結(jié)合緩沖液

1 uL 標(biāo)記探針

如有必要加1uL未標(biāo)記的DNA探針片段(如競(jìng)爭(zhēng)試驗(yàn))

0.1 uL 100xBSA

若干體積(uL)的核提取物(5ug總蛋白

H2O到10 uL 總體積

室溫孵育30分鐘。如有必要可再加入蛋白抗體,使阻滯更加明顯,加抗體后再室溫孵育30分鐘。

4. 在結(jié)合反應(yīng)孵育的過程中,將膠裝在電泳槽,在0.5×TBE電泳緩沖液,150伏電壓下,預(yù)跑30分鐘,之后上樣,150 V 電泳2小時(shí)。

5. 制干膠(可選):將膠轉(zhuǎn)移到濾紙上。膠上蓋濾紙,80℃真空干燥器中干燥1-2小時(shí)。

6. 壓片曝光在暗室中將膠放在暗盒中,放膠片。在-80℃條件下曝光。

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