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Science封面最新論文來自西湖大學(xué):揭秘新冠病毒如何入侵細(xì)胞

 頤源書屋 2020-03-27
3 月 27 日,來自中國研究團隊的一篇學(xué)術(shù)論文,登上了世界著名學(xué)術(shù)期刊《Science》的封面。這篇論文的研究成果是與新型冠狀病毒相關(guān)的。具體來說,該論文成功解析新型冠狀病毒(COVID-19)細(xì)胞表面受體 ACE2 的全長三維結(jié)構(gòu),以及新型冠狀病毒表面 S 蛋白受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域與細(xì)胞表面受體 ACE2 全長蛋白復(fù)合物的三維結(jié)構(gòu)。

值得一提的是,這篇論文是自本次疫情全球爆發(fā)以來《Science》雜志所刊載的第一篇專門研究新冠病毒的封面論文。
新冠病毒侵入細(xì)胞的關(guān)鍵:S 蛋白和 ACE2
新型冠狀病毒引發(fā)的肺炎疫情,讓冠狀病毒、S 蛋白、ACE2 這些冷僻的生物學(xué)名詞再次進入公眾視野。
研究人員發(fā)現(xiàn),新型冠狀病毒感染人體細(xì)胞的關(guān)鍵在于冠狀病毒的 S 蛋白與人體ACE2 蛋白的結(jié)合。準(zhǔn)確地說,是病毒的 S 蛋白“劫持” 了原本是控制血壓的 ACE2,通過與它的結(jié)合入侵人體。
那么,什么是 S 蛋白?
S 蛋白全稱為 Spike Glycoprotein (刺突糖蛋白)。它位于新冠病毒最外層,像一個個突起的 “皇冠”。

根據(jù)美國得克薩斯大學(xué)奧斯汀分校研究團隊的最新解析結(jié)果,新冠病毒 S 蛋白以三聚體形態(tài)存在,每一個單體中約有 1300 多個氨基酸,其中 300 多個氨基酸構(gòu)成了 “受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域”,即 S 蛋白與 ACE2 相聯(lián)結(jié)的地方。
那么,什么又是 ACE2?
ACE2,Angiotensin-converting enzyme 2,中文全稱為血管緊張素轉(zhuǎn)化酶 2,是人體內(nèi)一種參與血壓調(diào)節(jié)的蛋白,在肺、心臟、腎臟和腸道廣泛存在。

那么,人體細(xì)胞的一個蛋白,怎么會與病毒發(fā)生聯(lián)系?
西湖大學(xué)特聘研究員陶亮用了一個形象的比喻:
如果把人體想象成一間房屋,把新冠病毒想象成強盜,那么,ACE2 就是這間房屋的 '門把手' ;S 蛋白抓住了它,病毒從而長驅(qū)直入闖進人體細(xì)胞。
所以,對 S 蛋白和 ACE2 的研究,成為解讀新冠病毒侵入細(xì)胞過程的關(guān)鍵,這也是西湖大學(xué)周強實驗室的研究重點所在。
同時,也正如加州大學(xué)洛杉磯分校分子與醫(yī)學(xué)藥理學(xué)、生物工程特聘教授孫仁所言:
S 蛋白與其受體的相互作用,是病毒傳播的重要決定因素之一。因此,觀察 S蛋白受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域的序列及對應(yīng)結(jié)構(gòu)在病毒跨物種傳播過程中、傳播后的變化,對我們了解確認(rèn)傳播機制、預(yù)測傳播能力來說是一條有效路徑。
S 蛋白像一座橋橫跨在 ACE2 表面
這次登上《Science》封面的論文成果,本質(zhì)上是在解釋病毒 S 蛋白和 ACE2 的全貌以及彼此間的互相作用。論文標(biāo)題為:
Structural basis for the recognition of the SARS-CoV-2 by full-length human ACE2
在此前已經(jīng)成功解析出 ACE2 全長蛋白的高分辨三維空間結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,這篇論文成果解析出了 ACE2 全長蛋白與新冠病毒 S 蛋白受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域的復(fù)合物結(jié)構(gòu),整體分辨率 2.9 埃(埃,公制長度單位,1 埃等于 0.1 納米,這個單位名稱是為紀(jì)念瑞典物理學(xué)家 Anders Jonas ngstrm 而定的),其中 S 蛋白受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域部分的分辨率為 3.5 埃。
那么,研究人員從解析出來的復(fù)合物結(jié)構(gòu)中看見了什么?
原來,在形態(tài)上,新冠病毒的 S 蛋白像一座橋橫跨在 ACE2 表面,又像病毒的一只手,緊緊抓住 ACE2,這一點與 SARS 病毒很相似。新冠病毒 S 蛋白的受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域與 SARS 病毒的序列也非常像,相似性達(dá)到 82%。
進一步分析,研究人員可以看到新冠病毒表面的 S 蛋白到底是由哪些氨基酸與ACE2 相互作用??梢钥吹?,對比此前已經(jīng)解析出來的 SARS 病毒與 ACE2 的相互作用,新冠病毒 S 蛋白有一部分氨基酸殘基發(fā)生了較大改變。
這也許可以解釋為什么新冠病毒和 SARS 與 ACE2 的結(jié)合能力不一樣,這種結(jié)合能力可能影響了病毒的傳染力。
不過,這種病毒的傳染力究竟是增強還是減弱,還需要通過其他實驗手段驗證。
其實,在這一研究成果早在北京時間 2 月 21 日就已經(jīng)在預(yù)印版平臺 bioRxiv 發(fā)布,并第一時間向全社會公開——美國東部時間 3 月 4 日,該論文被《Science》雜志正式接收。

最終出現(xiàn),它出現(xiàn)在 3 月 27 日《Science》雜志封面上。
值得一提的是,清華大學(xué)王新泉教授研究團隊和中國科學(xué)院微生物研究所齊建勛研究團隊分別獨立解析了 ACE2 的 N 端蛋白酶結(jié)構(gòu)域與新冠病毒 S 蛋白受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域的晶體結(jié)構(gòu)。
而這些信息與周強團隊所獲取的相關(guān)電鏡結(jié)構(gòu)互為支持、互為補充。
這項成果究竟意味著什么?
在新冠疫情依舊全球蔓延的情況下,對于病毒相關(guān)的科學(xué)研究備受關(guān)注——那么,這項受到《Science》雜志充分肯定的研究成果意味著什么?
對此,周強團隊也做了具體說明。
周強團隊表示,此次對復(fù)合物結(jié)構(gòu)的解析屬于基礎(chǔ)研究領(lǐng)域的突破,與抗疫藥物的研發(fā)沒有必然聯(lián)系。
不過,從另一方面講,它又確實非常重要。因為蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)在很大程度上決定了它的性質(zhì)與功能,看清新冠病毒 S 蛋白、ACE2 及其相互作用的結(jié)構(gòu),相當(dāng)于看清了“敵人的樣子”,為后續(xù)科學(xué)家的靶向藥物研究提供了更多信息。
而在這次研究的基礎(chǔ)之上,計算生物學(xué)的研究人員可以在此基礎(chǔ)上去構(gòu)建不同的模型,進而展開具有針對性的研究,判斷什么樣的突變可能會進一步提高 S 蛋白與 ACE2 的相互作用,從而設(shè)計針對 S 蛋白或者 ACE2 蛋白的藥物和抗體;又或者設(shè)計小分子破壞它們之間的相互作用。
這些,都可以為藥物設(shè)計和檢測手段開發(fā)提供堅實的基礎(chǔ)。
這項研究也受到多位學(xué)科內(nèi)專家的肯定。比如,美國得克薩斯大學(xué)西南醫(yī)學(xué)中心生物物理系主任、霍華德休斯醫(yī)學(xué)研究所研究員 Michael K. Rosen 認(rèn)為:
周強團隊的這一生物物理學(xué)研究,在理解新冠病毒如何侵染人體細(xì)胞方面取得了重要進展,相關(guān)研究成果最終將對研發(fā)精準(zhǔn)的新冠肺炎診斷、治療手段起到關(guān)鍵作用。
而加州大學(xué)洛杉磯分校分子與醫(yī)學(xué)藥理學(xué)、生物工程特聘教授孫仁也表示:
周強團隊的研究,在理解病毒入侵細(xì)胞的機制上邁出了重要一步,并有助于我們進一步理解病毒跨物種及物種間的傳播。而對于不同冠狀病毒的 S 蛋白和不同宿主的 ACE2,針對其多種組合的相互作用方式進行比較研究,或許會得出更多關(guān)鍵信息。
這篇論文背后的作者團隊 
這項論文成果來自于西湖大學(xué)周強實驗室。
其中,西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院研究員周強為通訊作者,西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院博士后鄢仁鴻為第一作者。
周強,出生于 1982 年,清華大學(xué)本碩博畢業(yè),博士畢業(yè)后繼續(xù)留實驗室從事博士后研究工作;2015 年博士后出站后在清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院顏寧教授課題組任副研究員;2019 年初加盟西湖大學(xué)擔(dān)任西湖學(xué)者、特聘研究員,開展獨立研究工作。

在研究領(lǐng)域方面,周強博士長期從事冷凍電鏡單顆粒技術(shù)的學(xué)習(xí)和研究,與同事和合作者合作解析了多個重要生物大分子復(fù)合物或者膜蛋白的結(jié)構(gòu),主要工作包括 SNAP-SNARE 復(fù)合物,炎癥體復(fù)合物,Niemann-Pick C1 (NPC1) 蛋白,真核電壓門控鈉離子通道等。
其中真核電壓門控鈉離子通道結(jié)合門控調(diào)節(jié)毒素 Dc1a 以及河豚毒素的分辨率達(dá)到了 2.6 埃,是目前已發(fā)表的冷凍電鏡單顆粒技術(shù)解析的膜蛋白結(jié)構(gòu)的最高分辨率,為后續(xù)的基于結(jié)構(gòu)的小分子藥物開發(fā)奠定了基礎(chǔ)。
而周強研究員的博士課題組,則主要以冷凍電鏡為主要研究手段,結(jié)合生物化學(xué)、分子生物學(xué)、計算生物學(xué)等技術(shù)研究與重大疾病或者重要生物學(xué)過程相關(guān)的生物大分子復(fù)合物、膜蛋白的結(jié)構(gòu)以及工作機制。
在過去兩年,周強實驗室一直在研究人源氨基酸轉(zhuǎn)運蛋白,他們鎖定了數(shù)種目標(biāo)蛋白,ACE2 就是其中一種;而后新冠肺炎疫情爆發(fā),周強團隊迅速提升了 ACE2 研究工作的優(yōu)先級,并最終獲得了如今的研究成果。
祝賀周強團隊!
論文下載地址:
https://science./content/sci/367/6485/1444.full.pdf
本文參考鏈接:
https://www./info/1017/4362.htm
https://www./info/1622/3832.htm
https://science./content/367/6485/1444
https://science./content/367/6485

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