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一文讀懂凋亡執(zhí)行蛋白Caspase家族那些事

 ypgao 2019-11-01

背景介紹

盡管凋亡過程的詳細(xì)機(jī)制尚不完全清楚,但是已經(jīng)確定Caspase即半胱氨酸蛋白酶在凋亡執(zhí)行過程中起著至關(guān)重要的作用,而且細(xì)胞凋亡的過程實(shí)際上是Caspase被活化并發(fā)生凋亡蛋白酶的級聯(lián)反應(yīng),Caspase家族蛋白存在于胞漿中,它們同源性很高,結(jié)構(gòu)相似,均含有一個半胱氨酸激活位點(diǎn),特異地?cái)嚅_天冬氨酸殘基后的肽鍵,目前被發(fā)現(xiàn)的Caspases有14種,它們參與調(diào)節(jié)多種生物學(xué)過程,與細(xì)胞凋亡密切相關(guān),此外還參與細(xì)胞的生長、分化、增殖和運(yùn)動。

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Caspases家族

哺乳動物Caspase家族蛋白根據(jù)結(jié)構(gòu)和功能,可以分為三大類(圖1):

第一類:促凋亡Caspases

主要包括Caspase-2,8,9,10,3,6,7。它們以級聯(lián)放大的方式對胞內(nèi)蛋白進(jìn)行高效切割,最終導(dǎo)致細(xì)胞凋亡。它們被分為兩派,其中Caspase 2,8,9,10參與細(xì)胞凋亡的起始(啟動者,initiators);Caspase 3,6,7參與細(xì)胞凋亡執(zhí)行(效應(yīng)者,effectors)。

第二類:促炎性Caspases

主要包括Caspase-1,4,5,11,12,13。在先天性免疫應(yīng)答激活期間,促炎性Caspases介導(dǎo)特異性細(xì)胞因子(cytokines)的成熟,如Pro-IL-1β和Pro-IL-18,形成有活性的IL-1β和IL-18;但也可能參與一種稱為pyroptosis(焦亡)的細(xì)胞死亡形式。

第三類:角化細(xì)胞分化

圖1:Caspase家族圖譜。圖片來源于網(wǎng)絡(luò)

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Caspases活化

細(xì)胞中合成的Caspases以無活性的酶原狀態(tài)存在,經(jīng)過活化后方能執(zhí)行剪切功能。Caspase的活化是有順序的多步水解的過程,Caspase分子各異,但是它們活化的過程相似。需在兩個亞基的連接區(qū)的天冬氨酸位點(diǎn)進(jìn)行切割,結(jié)果產(chǎn)生了由兩個亞基組成的異二聚體,再由兩個二聚體形成有活性的四聚體。通常N-末端的肽在活化時也被除去,但對于Caspase-9是否去除N-末端肽對活性無影響。

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凋亡執(zhí)行

Caspase 3和7具有相近的底物和抑制劑特異性,它們異源活化后降解PARP,DFF-45(DNA fragmentation factor-45),導(dǎo)致DNA修復(fù)的抑制并啟動DNA的降解。而Caspase-6的底物是lamin A(詳情請點(diǎn)擊往期推文:爆款產(chǎn)品-明星分子Lamin A/C重組兔單抗)和keratin 18,它們的降解導(dǎo)致核纖層和細(xì)胞骨架的崩解。

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細(xì)胞凋亡的檢測方法

細(xì)胞凋亡與壞死是兩種完全不同的細(xì)胞死亡形式,根據(jù)死亡細(xì)胞在形態(tài)學(xué)、生物化學(xué)和分子生物學(xué)上的差別,可以將二者區(qū)別開來。

細(xì)胞凋亡的檢測方法有很多,下面介紹幾種常用的測定方法。

方法一:形態(tài)學(xué)檢測

以顯微鏡觀察細(xì)胞甚至是亞細(xì)胞層面的形態(tài)變化和形態(tài)學(xué)特征,而具體的顯微鏡技術(shù)以及其所檢測的凋亡形態(tài)學(xué)特征見下圖(圖2):

圖2:顯微鏡技術(shù)及其檢測的凋亡相關(guān)形態(tài)學(xué)特征。圖片來源于網(wǎng)絡(luò)

方法二:流式細(xì)胞術(shù)檢測(FCM,  Annexin V-PI雙染色實(shí)驗(yàn))

在正常細(xì)胞中,磷脂酰絲氨酸(PS)只分布于細(xì)胞膜磷脂雙分子層內(nèi)側(cè),細(xì)胞處于凋亡早期時,PS發(fā)生外翻出現(xiàn)在細(xì)胞外側(cè),Annexin V作為一種磷脂結(jié)合蛋白,可與PS高度親和,因而Annexin V是檢測細(xì)胞早期凋亡的靈敏指標(biāo)。PI是一種核酸染料,它不能透過完整的細(xì)胞膜,但在凋亡晚期和死細(xì)胞中,PI可透過細(xì)胞膜與細(xì)胞核結(jié)合。Annexin V和PI配合使用,可以將凋亡早期細(xì)胞和晚期細(xì)胞以及死細(xì)胞區(qū)分開來。

Annexin V-PI雙染實(shí)驗(yàn)可將細(xì)胞分為四種類型(圖3

圖3:Annexin V-PI雙染色實(shí)驗(yàn)

B3象限:Annexin V陰性且PI陰性(雙陰性細(xì)胞):活細(xì)胞;

B4象限:Annexin V陽性且PI陰性:早期凋亡細(xì)胞;

B2象限:Annexin V陽性且PI陽性(雙陽性細(xì)胞):晚期凋亡細(xì)胞;

B1象限:Annexin V陰性且PI陽性:壞死細(xì)胞。

3.核酸電泳檢測(DNA片段檢測法)

細(xì)胞凋亡時DNA會發(fā)生片段化,形成200bp的整數(shù)倍;而壞死細(xì)胞時DNA發(fā)生無規(guī)則斷裂。因而在凝膠電泳中,如果出現(xiàn)這種顯著特征的電泳條帶,就可以判斷細(xì)胞發(fā)生了凋亡。

圖4:DNA片段凝膠電泳

4. mRNA水平的檢測

科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)了很多在細(xì)胞凋亡時表達(dá)異常的基因,檢測這些特異基因的表達(dá)水平也成為檢測細(xì)胞凋亡的一種常用方法。據(jù)報道,F(xiàn)as 蛋白結(jié)合受體后能誘導(dǎo)癌細(xì)胞中的細(xì)胞毒性T細(xì)胞(Cytotoxic T cells)等靶細(xì)胞。Bcl-2 和Bcl-xL作為抗凋亡的調(diào)節(jié)物,它們的表達(dá)水平比例決定了細(xì)胞是凋亡還是存活。因而可以用qPCR技術(shù)(詳情請點(diǎn)擊往期推文:新款通用型qPCR mix,專治各種不服 & 新品上市--Genious 2X SYBR Green Fast qPCR Mix)來檢測Fas, Bax 和 Bcl-xL基因的 mRNA表達(dá)水平來進(jìn)行細(xì)胞凋亡的檢測。

5. 細(xì)胞色素C的定位檢測

細(xì)胞色素C(Cytochrome C)作為一種信號物質(zhì),在細(xì)胞凋亡中發(fā)揮著重要的作用。正常情況下,它存在于線粒體內(nèi)膜和外膜之間的腔中,凋亡信號刺激使其從線粒體釋放至細(xì)胞漿,結(jié)合Apaf-1(Apoptotic protease activating factor-1)后啟動Caspase級聯(lián)反應(yīng)。因而可以通過組化或熒光方法檢測Cytochrome C定位來判斷細(xì)胞凋亡。

6. 凋亡明星分子檢測

通常以Western Blot檢測凋亡通路明星蛋白,如Caspase家族蛋白,Caspase 8,Caspase 6,和Caspase 3的前體和剪接體,以及Caspase 3的底物PARP分子;又如Bcl-2家族蛋白,抑制凋亡的Bcl-2和促進(jìn)凋亡的Bax,在以Western Blot檢測Bcl-2和Bax的表達(dá)量后,通過Bcl-2/Bax的比值,可表征細(xì)胞凋亡的程度。

圖5:ABclonal第四代重組兔單抗制備流程

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