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文獻(xiàn)搜索在每個(gè)科學(xué)家的日常生活中都是不變的。我們花費(fèi)大部分時(shí)間來(lái)積累信息。無(wú)論是編寫(xiě)一個(gè)基金本子，設(shè)計(jì)/排除一個(gè)棘手的實(shí)驗(yàn)···這都需要我們了解領(lǐng)域的最新動(dòng)態(tài)。其中，我們的大多數(shù)研究和文獻(xiàn)搜索都是在線(xiàn)完成的。

對(duì)于生物醫(yī)學(xué)和生命科學(xué)，文獻(xiàn)檢索的首選網(wǎng)站是PubMed，由美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書(shū)館（NLM）的國(guó)家生物技術(shù)信息中心（NCBI）維護(hù)。通過(guò)PubMed，你可以訪(fǎng)問(wèn)MEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)中的引文，以及生命科學(xué)期刊和書(shū)籍。

因此，筆者在這里想跟各位分享下關(guān)于PubMed的一些使用心得和技巧。

PubMed（https://www.ncbi.nlm./pubmed/）是美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書(shū)館(NLM)所屬的國(guó)家生物技術(shù)信息中心(NCBI)于2000年4月開(kāi)發(fā)的，基于WEB的生物醫(yī)學(xué)信息檢索系統(tǒng)，它是NCBI Entrez整個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)查詢(xún)系統(tǒng)中的一個(gè)。

PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)源為MEDLINE、OLDMEDLINE、Record in process、Record supplied by publisher等，其核心為MEDLINE（一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)，包含來(lái)自7000多種期刊的超過(guò)2700萬(wàn)篇文章的書(shū)目信息），但也包括其他與醫(yī)學(xué)相關(guān)的領(lǐng)域，且界面提供與綜合分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的鏈接，其內(nèi)容包括：DNA與蛋白質(zhì)序列，基因圖數(shù)據(jù)，3D蛋白構(gòu)象，人類(lèi)孟德?tīng)栠z傳在線(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)(OMIM)，全文鏈接等。

據(jù)統(tǒng)計(jì)，在平均工作日，來(lái)自世界各地的約250萬(wàn)用戶(hù)訪(fǎng)問(wèn)PubMed以執(zhí)行大約300萬(wàn)次搜索和900萬(wàn)次頁(yè)面瀏覽。

說(shuō)到PubMed，就不得不提下另一與其緊密聯(lián)系且強(qiáng)大的數(shù)據(jù)庫(kù)——PubMed Central（https://www.ncbi.nlm./pmc/）——存儲(chǔ)了文獻(xiàn)的全文，且每天增加1000多篇文章，這也為改進(jìn)PubMed提供了機(jī)會(huì)。除了向用戶(hù)提供更多內(nèi)容之外，PubMed Central也在開(kāi)發(fā)自動(dòng)化方法來(lái)應(yīng)對(duì)與全文（包括圖表中的文本）的可用性可以改善搜索。

展望未來(lái)，開(kāi)發(fā)PubMed的團(tuán)隊(duì)還設(shè)想PubMed作為獲取一系列不同NCBI文獻(xiàn)資源的中心切入點(diǎn)，創(chuàng)建了一個(gè)新的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)，內(nèi)部稱(chēng)為PubOne，將不同類(lèi)型的文檔（如PubMed摘要，PubMed Central的全文，書(shū)籍章節(jié)等）合并為一個(gè)記錄，以便使所有一對(duì)一訪(fǎng)問(wèn)生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)，進(jìn)一步計(jì)劃探索PubMed是否可以使用開(kāi)放數(shù)據(jù)和替代指標(biāo)中的各種計(jì)劃的輸出來(lái)改進(jìn)搜索。還提到，PubMed的開(kāi)發(fā)受益于開(kāi)源平臺(tái)和技術(shù)和用戶(hù)反饋，會(huì)加快創(chuàng)建PubMed 2.0。（團(tuán)隊(duì)2017年發(fā)表的文章）

好了，不扯了，進(jìn)入主題，如何利用好PubMed？筆者擬劃分3部分來(lái)闡述：

第一部分：如何精準(zhǔn)高效地進(jìn)行文獻(xiàn)搜索（本次推送）

第二部分：搜索結(jié)果的篩選、閱讀、保存與利用（下次推送）

第三部分：PubMed的高階應(yīng)用（下下次推送）

敬請(qǐng)期待！

首先，創(chuàng)建一個(gè)myNCBI帳戶(hù)。相信筆者，無(wú)論如何，你都想要這樣做。

（PubMed首頁(yè)）

這個(gè)帳戶(hù)為您提供了許多優(yōu)秀的資源，不僅適用于PubMed，也適用于其他NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)和工具。

注冊(cè)賬號(hào)的步驟比較簡(jiǎn)單，就不闡述了。（支持QQ郵箱）

現(xiàn)在，筆者想專(zhuān)注于使用PubMed的文獻(xiàn)搜索，更具體地說(shuō)，關(guān)于如何保存和整理搜索。因此，首先設(shè)置你的帳戶(hù)，然后按照筆者的提示，了解如何將PubMed與myNCBI一起使用。

（筆者賬號(hào)的myNCBI）

PubMed的搜索，可分為三種：基本搜索、高級(jí)搜索和臨床主題查詢(xún)。

幾個(gè)注意點(diǎn)：

1.當(dāng)完整文獻(xiàn)的標(biāo)題搜索不到時(shí)，善用關(guān)鍵詞搜索。一般而言，輸入完整的文獻(xiàn)標(biāo)題，PubMed都會(huì)給你搜索到，但是，這并非萬(wàn)能，這主要是由于，你所識(shí)別的與PubMed所識(shí)別的不一致。如你輸入的Correction for Tang and Dubayah，在PubMed的眼中則是Correction AND for AND Tang AND and AND Dubayah，這是不一樣的。

2.文獻(xiàn)的期刊信息、PMID、DOI號(hào)，往往搜索的更為精準(zhǔn)。

如參考文獻(xiàn)的信息：Vitalone MJ, Wei L, Fujiki M, Lau AH, Littau E, Esquivel C, Martinez OM, Krams SM. Liver microRNA Profile of Induced Allograft Tolerance. Transplantation. 2016 Apr;100(4):781-90。那么，后部分的紅色字體，也可以被PubMed所識(shí)別，進(jìn)而搜索出來(lái)。如有DOI，PMID也一樣，優(yōu)先這些信息搜索。

3.避免這類(lèi)詞的搜索。

首先，進(jìn)入高級(jí)搜索：

在All Fields里，包含以下可搜索領(lǐng)域：

高級(jí)搜索的使用：

1.選好Fields；

2.輸入關(guān)鍵詞；

3.點(diǎn)擊Search，PubMed自動(dòng)生成搜索語(yǔ)法，并進(jìn)行搜索。

另外，可適當(dāng)使用“AND”、“OR”、“NOT”的關(guān)系。

下面，介紹幾個(gè)常用的Fields：

Author [AU]

搜索此字段的格式為：姓氏后跟空格，前兩個(gè)首字母后跟空格和后綴縮寫(xiě)（如果適用），全部沒(méi)有句點(diǎn)或姓氏后面的逗號(hào)。搜索時(shí)可以省略縮寫(xiě)和后綴。

PubMed會(huì)自動(dòng)截?cái)鄬?duì)作者姓名的搜索，以便考慮不同的首字母，例如，o’brien j [au]將檢索o’brien ja，o’brien jb，o’brien jc jr，以及o’brien j。要關(guān)閉自動(dòng)截?cái)?，?qǐng)將作者姓名用雙引號(hào)括起來(lái)并用括號(hào)中的[au]標(biāo)記，例如“o’brien j”[au]以?xún)H檢索o’brien j。

Entrez Date [EDAT]

這是代表引文添加到PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)的日期。例外情況：截至2008年12月15日，PubMed在發(fā)布之日起超過(guò)12個(gè)月后加入PubMed，EDAT設(shè)置為發(fā)布日期，但書(shū)籍引用除外。搜索結(jié)果以Entrez日期順序顯示，即后進(jìn)先出。

注意：Entrez日期不會(huì)更改，以反映發(fā)布商提供的記錄被提升到正在處理的日期，或者正在將進(jìn)程內(nèi)記錄提升為MEDLINE索引的日期。

First Author Name [1AU]

文獻(xiàn)中的第一作者，你們懂的。

Grant Number [GR]

基金號(hào)搜索字段包括指定美國(guó)PHS（公共衛(wèi)生服務(wù)）機(jī)構(gòu)以及其他國(guó)家或國(guó)際資金來(lái)源的財(cái)務(wù)支持的研究資助號(hào)碼，合同號(hào)碼或兩者。授權(quán)數(shù)據(jù)的四個(gè)部分是：

1. 數(shù)字，例如，LM05545

2. PHS 2字符授權(quán)縮寫(xiě)，例如LM

3. 研究所的首字母縮略詞，例如NLM NIH HHS

4. 國(guó)家，例如美國(guó)

Journal [TA]

期刊檢索字段包括期刊標(biāo)題縮寫(xiě)，完整期刊標(biāo)題或ISSN編號(hào)（例如，J Biol Chem，Journal of Biological Chemistry，0021-9258）。

Last Author Name [LASTAU]

引用中的最后一個(gè)作者姓名,即通訊作者。

Publication Date [DP]

發(fā)布日期是文章發(fā)布的日期。

必須使用格式y(tǒng)yyy / mm / dd [dp]搜索日期或日期范圍，例如1998/03/06 [dp]。月份和日期是可選的（例如，1998 [dp]或1998/03 [dp]）。

Title [TI]

引文標(biāo)題中包含的單詞和數(shù)字，以及書(shū)籍引文的集合標(biāo)題。

（PubMed Help，https://www.ncbi.nlm./books/NBK3827/#pubmedhelp.Searching_by_date）

當(dāng)我們了解這些可搜索領(lǐng)域的具體定義，那么，我們就可綜合各個(gè)不同可搜索領(lǐng)域的關(guān)鍵詞，可助我們更快地找到我們想找到的文獻(xiàn)。

PubMed Tools下面的Clinical Queries鏈接。PubMed臨床查詢(xún)頁(yè)面旨在通過(guò)三個(gè)臨床研究領(lǐng)域篩選一個(gè)搜索：臨床研究類(lèi)別，系統(tǒng)評(píng)價(jià)和醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)。

當(dāng)中，臨床研究類(lèi)別，提供五個(gè)類(lèi)別供您選擇：

范圍可以定義為Broad（默認(rèn)值）或Narrow：

此功能用于幫助查找系統(tǒng)評(píng)價(jià)和類(lèi)似文章。它將您的搜索詞與引文確定為系統(tǒng)評(píng)價(jià)，薈萃分析，臨床試驗(yàn)評(píng)論，循證醫(yī)學(xué)，共識(shí)發(fā)展會(huì)議和指南相結(jié)合。

過(guò)濾醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)主題的引文。您可以選擇以下主題：診斷，鑒別診斷，臨床描述，管理，遺傳咨詢(xún)，分子遺傳學(xué)，基因檢測(cè)或所有（列出的主題）。