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熒光原位雜交技術(shù)(FISH)的基本原理及應(yīng)用

 開(kāi)心100mm05xkw 2018-09-16

我接觸“FISH”也是剛剛兩年多的時(shí)間,作為一個(gè)“初學(xué)者”剛開(kāi)始接觸“FISH”可能跟大多數(shù)人一樣滿(mǎn)腦子的疑惑:“FISH”是做什么的?有什么臨床作用呢?那些紅紅綠綠的點(diǎn)都是些什么意思?……今天讓我們慢慢的去揭開(kāi)FISH的不太神秘的面紗。

1.FISH的前世今生

      

       在FISH技術(shù)問(wèn)世之前,基于20世紀(jì)60年代,放射性核素探針的原位雜交方法,檢測(cè)間期染色體和分裂期染色體上特定DNA和RNA序列的方法,該方法存在操做比較麻煩、分辨率有限、探針不穩(wěn)定、放射性同位素的危害較高等問(wèn)題,故目前棄之不用。20世紀(jì)80年代用非放射性半抗原如生物素進(jìn)行核酸標(biāo)記的技術(shù)逐漸開(kāi)展后,探針也開(kāi)始使用這種非放射性標(biāo)記方法。隨后FISH技術(shù)逐漸開(kāi)展起來(lái),1986年以后該技術(shù)被應(yīng)用于分析細(xì)胞分裂期染色體鋪片的DNA序列。相對(duì)于放射性來(lái)說(shuō),F(xiàn)ISH具有穩(wěn)定性好、操作安全、結(jié)果迅速、空間定位準(zhǔn)確、干擾信號(hào)少、一張玻片可以標(biāo)記多種顏色探針等優(yōu)點(diǎn)。這些優(yōu)點(diǎn)逐漸使FISH成為一種研究分子細(xì)胞遺傳學(xué)很好的方法。

     FISH即染色體熒光原位雜交(Flourescence in situ hybridization,FISH)是通過(guò)熒光素標(biāo)記的DNA探針與樣本細(xì)胞核內(nèi)的DNA靶序列雜交,從而獲得細(xì)胞核內(nèi)染色體或基因狀態(tài)的信息。FISH是將傳統(tǒng)的細(xì)胞遺傳學(xué)同DNA技術(shù)相結(jié)合,開(kāi)創(chuàng)了一門(mén)新的學(xué)科——分子細(xì)胞遺傳學(xué)。(如下圖所示)



 2.FISH信號(hào)解讀-紅紅綠綠是什么 

    

       目前臨床上用于FISH檢測(cè)的探針的熒光素大都是綠色的和橙紅色標(biāo)記,可大致分為:染色體計(jì)數(shù)(著絲粒)探針(centromere-enumeration probes,CEP),位點(diǎn)特異性識(shí)別探針(locus-specific identifier probes,LSI),染色體涂染(paint,WCP)探針。其中CEP和LSI探針中的計(jì)數(shù)探針、融合探針及分離重排探針,在血液病診斷與預(yù)后分型中最為常用。比如骨髓增生異常綜合征(MDS)中8號(hào)染色體數(shù)目會(huì)增加;又或者多發(fā)性骨髓瘤(MM)中IGH基因的結(jié)構(gòu)重排和AML-M3中的PML/RARA融合基因。檢測(cè)的結(jié)果可以是擴(kuò)增、缺失、融合、斷裂等。



 計(jì)數(shù)探針的原理 

       通過(guò)標(biāo)記某條染色體或者是某個(gè)基因特有的特異性DNA片段,與目的基因相結(jié)合,從而產(chǎn)生熒光雜交信號(hào)。由于正常人的染色體是二倍體,那么正常人的檢測(cè)信號(hào)就是兩個(gè),當(dāng)信號(hào)多于兩個(gè)或者少于兩個(gè)(排除切片影響),該染色體或者基因就異常(擴(kuò)增或缺失);如下圖8號(hào)染色體三體。



雙色雙融合探針的原理

         含有用兩種不同顏色熒光素標(biāo)記的探針(一般用綠色和橙紅色兩種),分別對(duì)應(yīng)兩個(gè)獨(dú)立的靶基因位點(diǎn),當(dāng)兩個(gè)獨(dú)立的靶基因位點(diǎn)相互融合就會(huì)形成典型的兩個(gè)融合信號(hào)(黃色)和一個(gè)正常的綠色信號(hào)及一個(gè)正常的紅色信號(hào);如下圖慢性粒細(xì)胞白血病BCR/ABL融合基因形成模式圖。



重排探針的原理

        某基因發(fā)生重排時(shí)會(huì)在相對(duì)恒定位置斷開(kāi),通過(guò)不同顏色熒光素標(biāo)記斷裂點(diǎn)兩端特異性的DNA片段,該基因沒(méi)有發(fā)生重排,紅色和綠色靠近會(huì)發(fā)生混合色形成黃色;如果發(fā)生斷裂,則形成單獨(dú)的顏色(如單獨(dú)的紅或綠),當(dāng)然,重排探針同樣能夠提示數(shù)目異常(如多倍體)。如下圖IGH基因的重排。



注:部分圖片素材來(lái)自雅培官網(wǎng)


 3.常見(jiàn)的FISH臨床應(yīng)用有哪些 


在實(shí)體腫瘤中應(yīng)用


       1)指導(dǎo)靶向藥物的使用,如乳腺癌赫賽汀(HER2)、肺癌克唑替尼(ALK/ROS1/CMET);

       2)指導(dǎo)腫瘤預(yù)后,如腦膠質(zhì)瘤的預(yù)后(1p和19q缺失)、神經(jīng)母細(xì)胞瘤和分化型神經(jīng)母細(xì)胞瘤(NMYC)。

   
     

在淋巴造血腫瘤中的應(yīng)用

   

        1)明確診斷,如急性早幼粒白血病:t(15;17),慢性粒細(xì)胞白血病:t(9;22),套細(xì)胞淋巴瘤:t(11;14),Buikitt淋巴瘤:c-MYC基因重排;雙打擊及三打擊淋巴瘤:MYC,BCL2,BCL6。

       2) 血液腫瘤,如急性淋巴細(xì)胞白血病、慢性淋巴細(xì)胞白血病、骨髓增生異常綜合征、多發(fā)性骨髓瘤等進(jìn)行危險(xiǎn)分層。


表1 骨髓增生異常綜合征常見(jiàn)FISH檢測(cè)意義

    SH探針

              檢測(cè)意義

Y染色體

單獨(dú)缺失預(yù)后好

EGR1[5q31]

單獨(dú)缺失預(yù)后好(5q綜合征)

del(20q)[D20S108(20q12)]

單獨(dú)缺失預(yù)后好

CEP8 

預(yù)后中等

D7S486(7q31)/CEP7

缺失預(yù)后差

P53

缺失預(yù)后差


表2 慢性淋巴細(xì)胞白血病中常見(jiàn)FISH檢測(cè)意義

FISH探針

檢測(cè)意義

P53[17p13.1]

缺失預(yù)后差

ATM[11q22.3]

缺失預(yù)后差

CEP12 

預(yù)后中等

13q14.3/13q34(D13S319/13q34)

單獨(dú)缺失提示預(yù)后良好


表3多發(fā)性骨髓瘤中常見(jiàn)FISH檢測(cè)意義

 FISH探針

                檢測(cè)意義

RB1[13q14]  

缺失預(yù)后差

P53[17p13.1]

缺失預(yù)后差

IGH[14q32]

IGH基因相關(guān)檢測(cè),如發(fā)生t(11;14)和t(6;14)易位或者無(wú)其他遺傳改變患者,提示預(yù)后良好,如發(fā)生t(4;14),t(14;16),t(14;20)這三種易位,提示預(yù)后差

IgH/CCND1 t(11;14)

IgH/MAF t(14;16)

IgH/FGFR3 t(4;14)

IgH/MAFB t(14;20)

IgH/CCND3 t(6;14)

CKS1B/CDKN2C(1q21)

缺失或擴(kuò)增提示預(yù)后差

注:歐洲骨髓瘤工作組推薦MM患者要做漿細(xì)胞CD138分選后相關(guān)FISH檢查


        3)檢測(cè)染色體隱蔽易位或常規(guī)細(xì)胞遺傳學(xué)不能發(fā)現(xiàn)的異常。

       4)微小殘留病定量和分析大量分裂和不分裂細(xì)胞,評(píng)估細(xì)胞遺傳學(xué)緩解和復(fù)發(fā)(靈敏度不如實(shí)時(shí)定量PCR)。


 4.FISH檢測(cè)的優(yōu)勢(shì)是什么

   

       FISH技術(shù)一般用于了解基因或染色體發(fā)生擴(kuò)增、缺失、融合或斷裂,只需分析間期細(xì)胞,每次可分析間期細(xì)胞500-1000個(gè),不受細(xì)胞是否分裂的影響,能更好地全面判斷患者某種染色體異常比例。由于使用的是特異的探針,使人為的判斷誤差大大減小。根據(jù)熒光信號(hào)判斷結(jié)果,比染色體分析獲得結(jié)果更加快速,重復(fù)性好。


 5.送檢標(biāo)本要求是什么

 

        樣本來(lái)源廣泛:組織、脫落細(xì)胞、羊水、血液、骨髓都可以檢測(cè),且不僅局限于新鮮樣本,石蠟包埋樣本也可以檢測(cè)

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