根據(jù)現(xiàn)有的circRNA研究現(xiàn)狀，做的工作可以有以下幾個部分：

a）. circRNA的定位

類似于lncRNA，circRNA的定位與其功能行使有著非常密切的關系。因此，需要通過FISH等實驗手段來看下circRNA是主要定位與細胞核，還是細胞質(zhì)的。定位的結果會后面從轉錄調(diào)控還是轉錄后調(diào)控研究circRNA的功能有一定的指導意義。

Nat Commun. 2016 Apr 6;7:11215.

b)．circRNA成環(huán)研究

circRNA的成環(huán)過程是一個非常復雜的調(diào)控過程，特別是外顯子來源的circRNA，很多情況下是需要側翼ALU原件的重復序列 。因此，可以通過實驗來驗證circRNA的成環(huán)。通過截取側翼序列和保留構建，看哪種情況下能形成成熟環(huán)狀結構。而這樣的成環(huán)實驗，一方面對circRNA是怎么來的有了了解，另一方面也對circRNA的過表達實驗順利開展提供了條件。

Nat Commun. 2016 Apr 6;7:11215.

c). circRNA編碼潛能分析。

現(xiàn)在從circRNA的編碼多肽入手研究circRNA的生物學功能也是比較好的方向，發(fā)表的文章檔次也都很高。因此，如果在文章對circRNA的特性分析中加上對其編碼能力的預測，可以豐富研究內(nèi)容。CircRNA具有編碼潛能需要符合幾個條件：（1）局有開放閱讀框（ORF）；（2）包含核糖體進入位點（IRES）序列，且具有活性，能引到5’帽子非依賴性翻譯能力；（3）通過載體構建能檢測到編碼的蛋白；（4）能用質(zhì)譜技術檢測到體內(nèi)翻譯出來的蛋白。當然，能從上面幾個過程入手，找到陽性結果，那就是很好的circRNA翻譯蛋白研究了。如果沒有陽性結果，那也是能證明該circRNA為非編碼RNA，也是可以作為非編碼證據(jù)。

JNCI J Natl Cancer Inst (2018) 110(3): djx166

d）. circRNA與其他研究熱點間的關聯(lián)

circRNA的研究相對來說還是一個新的領域，因此，在circRNA的研究過程中，如果把其他的特點能聯(lián)系起來，對整體的研究提升還都是非常有幫助的。目前可以結合的熱點研究，可以有以下幾種：

（1）circRNA與外泌體結合。外泌體是細胞分泌囊泡結構，可通過運送母細胞中的RNAs調(diào)控受體細胞的生物學功能。因此，可以分析和研究外泌體在不同條件下內(nèi)部circRNA的表達變化，以及這種變化對受體細胞的影響，這里可以借用lncRNA研究用到的共培養(yǎng)等實驗進行驗證。

Cancer Cell. 2016 May 9;29(5):653-68.

（2）circRNA與單細胞研究結合。單細胞轉錄組學研究是基于單細胞測序的發(fā)展和運用。通過單細胞研究，可以對特性細胞的特性生物學過程有更加清晰的認識。如果能在單細胞的角度去發(fā)現(xiàn)circRNA在不同細胞中的特性，如神經(jīng)細胞中，胚胎發(fā)育過程中，特定腫瘤細胞中的功能，無論對于circRNA的功能理解，還是對特定的疾病發(fā)生或者是特定腫瘤藥物開發(fā)等都有幫助。

以上的研究內(nèi)容，應該來說是circRNA研究所需要，但又是非常重要的研究方向。如果大家已經(jīng)有了基本的circRNA研究結果，可以看看上面的內(nèi)容中有哪些可以再去嘗試一下，說不定，你再通過幾個非常有效的實驗，就能使自己的研究成果提升一個檔次。