我叫骨頭，我最近也有一個(gè)基因可以研究了。神師兄用數(shù)據(jù)挖掘，搞到了一個(gè)基因，說(shuō)是研究的又少，表達(dá)量又高。于是我查了一下，乖乖，68篇文獻(xiàn)。雖然這個(gè)已經(jīng)是很少了，但是，這我要怎么去下手研究呢！

殺姐姐：說(shuō)實(shí)話也不是很難咯，就把所有的摘要看一遍，就能知道這個(gè)基因研究的大概了。

骨頭：?，說(shuō)得輕松……

殺姐姐：給你個(gè)投機(jī)取巧的辦法，知道你肯定是想要投機(jī)取巧的。首先，我們要去GoPubMed，搜一下這個(gè)基因。雖然GoPubMed的MeSH查詢比較好，但是這些MeSH詞量又大，涉及的面又廣，不太好把握基因具體是和什么信號(hào)通路相關(guān)或者參與什么樣的細(xì)胞學(xué)進(jìn)程。

那我們要怎么辦呢？首先我們要把這六十八篇的摘要先整下來(lái)，從GoPubMed就可以直接導(dǎo)出，就像這樣。

導(dǎo)出后，就是一個(gè)TXT格式的文件，內(nèi)容就像這樣：

然后我們就需要打開(kāi)這個(gè)“W工具”了，感覺(jué)還是賣(mài)一下關(guān)子才會(huì)有人在意哈，寫(xiě)下來(lái)帖子丟了就再也找不到了。點(diǎn)進(jìn)去之后，將文本信息bia進(jìn)去，然后就能選擇，需要分析什么樣的關(guān)鍵詞了。比如GO分組，也就是對(duì)于這個(gè)基因的位置，基因的功能，基因的細(xì)胞學(xué)意義的定義。通過(guò)這些基因GO分析相關(guān)的關(guān)鍵詞，我們可以了解具體我們找到的這個(gè)基因周邊研究都是在什么方向。同樣還可以選擇顯示其中的基因和蛋白，這樣你就能分析所謂的文本互作了。也就是在文獻(xiàn)中，這個(gè)基因和什么別的基因同時(shí)出現(xiàn)過(guò)，可能這兩者就有一定的聯(lián)系。當(dāng)然還包括了一些疾病和藥物相關(guān)的內(nèi)容，大家可以自己去了解。

點(diǎn)擊Tag Text之后，就可以直接分析了，會(huì)出現(xiàn)這樣的顯示方式，你會(huì)在里面找到：

所有相關(guān)的關(guān)鍵詞，都會(huì)被顏色標(biāo)記出來(lái)。把這些文本都過(guò)一遍，你就會(huì)發(fā)現(xiàn)，你已經(jīng)大概了解這個(gè)基因會(huì)涉及到什么可能的功能和作用了，甚至連相關(guān)的基因都已經(jīng)可以看到了。把這些關(guān)鍵詞挑出來(lái)，繼續(xù)研究分析吧。

…華麗麗的分割線…

李莫愁博士：從文本中整理出基因功能相關(guān)，信號(hào)通路相關(guān)的信息，對(duì)于快速掌握基因研究方向，是很有價(jià)值的。文本相關(guān)的基因也一樣有一定參考價(jià)值的，把這些基因整理出來(lái)之后，可以繼續(xù)拿去做GO分析，和Pathway分析，或者再回到芯片挖掘數(shù)據(jù)中驗(yàn)證。這樣的二次數(shù)據(jù)挖掘，可以給我們的研究方向帶來(lái)更多提示。好了，要看這個(gè)“W工具”是什么，就回復(fù)“W工具”吧。好了，今天就策到這里吧。

如果你們?cè)侔裌工具回復(fù)到評(píng)論區(qū)，我就去上吊。PS，每天帖子的最下面會(huì)有一些逗比留言，那里叫評(píng)論區(qū)，每天接收萬(wàn)事屋帖子的界面，會(huì)有個(gè)自定義菜單有木有？自定義菜單可以切換到打字功能很神奇有木有？打字區(qū)還能打字很吃驚有木有？給我們發(fā)送W工具三個(gè)字還會(huì)收到自動(dòng)回復(fù)科技這么先進(jìn)有木有？收到的自動(dòng)回復(fù)還能超鏈接嚇?biāo)缹殞毩擞心居?？溫馨提示，不要回?fù)錯(cuò)誤，電腦君看不懂。