由于清王朝有意實施的“民族分治”政策，無論外蒙古對清王朝的忠誠，始終只限于清朝皇室，而對于中原內(nèi)陸少有認(rèn)同感，其和漢族的融合程度也非常之低。

就以喀爾喀蒙古為例，康熙時分34旗，雍正、乾隆兩朝又加以細(xì)分，多達(dá)86旗，各旗之間都劃定牧場，嚴(yán)禁越境游牧，即所謂“內(nèi)外札薩克之游牧，各限以界”。對于內(nèi)陸遷往外蒙地區(qū)的漢族游民，清政府采取設(shè)置府州縣廳的方法，與蒙古各旗分別治理，“分疆別界，各有定制”。對于蒙漢之間的通婚也實行嚴(yán)格限制，漢人娶蒙古婦女要被官判離異，還要處以罰款。蒙古人學(xué)習(xí)漢語、取漢族名字也要遭到處罰。蒙古王公臺吉等不準(zhǔn)請內(nèi)陸書吏教讀，或充書吏，其公文用詞也不能擅用漢文。蒙古人進(jìn)入內(nèi)陸只能從山海關(guān)、喜峰口、古北口、獨石口、張家口、殺虎口等六處入關(guān)。入關(guān)時登記人數(shù)，出關(guān)時仍照原數(shù)放出。擅自從其他地方進(jìn)入內(nèi)陸，也要遭到嚴(yán)懲。

在內(nèi)外蒙之間，民族隔閡的政策在外蒙執(zhí)行得更加嚴(yán)厲。對于內(nèi)蒙貴族，清王朝較為注重推廣漢族的儒家文化，強調(diào)所謂的“忠孝之義”。同時，內(nèi)蒙貴族多有至內(nèi)陸為官者，而且大都官高爵顯、深得清王朝信任，比如出身于科爾沁蒙古的僧格林沁。這些使得內(nèi)蒙對于中原地區(qū)的認(rèn)同感，比外蒙更強烈一些。