第一，關(guān)于行政管理體制改革的目標(biāo)模式問題。
學(xué)術(shù)界認(rèn)為，建立社會(huì)主義公共行政體制是我國(guó)行政管理體制改革的目標(biāo)。公共行政體制是與市場(chǎng)經(jīng)濟(jì)體制相對(duì)應(yīng)的、關(guān)于行政體制本質(zhì)描述的概念。“公共行政體制”概念比傳統(tǒng)的“行政管理體制”概念更準(zhǔn)確地概括了市場(chǎng)經(jīng)濟(jì)條件下行政體制的基本特征。公共行政體制揭示了市場(chǎng)經(jīng)濟(jì)條件下政府的公共性、服務(wù)性、公正性與有限性，因而反映了社會(huì)主義市場(chǎng)經(jīng)濟(jì)體制對(duì)行政體制的根本要求。而“行政管理體制”則主要是在計(jì)劃經(jīng)濟(jì)條件下形成的表示政府的控制、管理、計(jì)劃特征的概念，這一概念只揭示了政府管理的“管理屬性”，而沒有揭示政府管理的公共屬性。
第二，關(guān)于服務(wù)型政府建設(shè)的理論問題。
學(xué)術(shù)界對(duì)服務(wù)型政府的本質(zhì)與主要內(nèi)容、服務(wù)型政府建設(shè)與投資環(huán)境改善之間的關(guān)系進(jìn)行了深入的探討。服務(wù)型政府是從政府的本質(zhì)屬性方面對(duì)政府所下的定義，政府只有通過提供充足優(yōu)質(zhì)的公共服務(wù)，才能證明自己存在的價(jià)值與合法性。服務(wù)型政府主要包括兩個(gè)方面的內(nèi)容：從政府職能方面來講，社會(huì)性公共服務(wù)是政府職能的主體部分；從政府管理方式來講，政府是為市場(chǎng)、社會(huì)和公民提供公共服務(wù)的，應(yīng)該將服務(wù)融入管理之中，要提高為民服務(wù)的效率與速度。服務(wù)型政府建設(shè)對(duì)投資環(huán)境改善具有明顯的促進(jìn)作用，我國(guó)南京市、重慶市、成都市等地整體推進(jìn)了服務(wù)型政府建設(shè)，經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展的速度明顯加快。
第三，關(guān)于政府全面履行公共管理職能的理論問題。
在完善的市場(chǎng)經(jīng)濟(jì)條件下，政府要均衡、有效地全面履行經(jīng)濟(jì)調(diào)節(jié)、市場(chǎng)監(jiān)管、社會(huì)管理和公共服務(wù)職能。在政府的這四種職能中，都有薄弱環(huán)節(jié)，都需要重點(diǎn)加強(qiáng)。經(jīng)濟(jì)調(diào)節(jié)職能的重點(diǎn)是促進(jìn)經(jīng)濟(jì)又好又快發(fā)展，通過政府職能轉(zhuǎn)變促進(jìn)經(jīng)濟(jì)增長(zhǎng)方式的根本轉(zhuǎn)變。市場(chǎng)監(jiān)管職能的重點(diǎn)是打破各種形式的市場(chǎng)壟斷與行政壟斷，加強(qiáng)對(duì)企業(yè)的社會(huì)規(guī)制與經(jīng)濟(jì)規(guī)制，確保產(chǎn)品質(zhì)量與安全。社會(huì)管理職能的重點(diǎn)是加大社會(huì)矛盾糾紛排查調(diào)處的力度，完善社會(huì)利益協(xié)調(diào)機(jī)制。公共服務(wù)職能的重點(diǎn)是加大政府對(duì)公共服務(wù)領(lǐng)域的投入，切實(shí)履行公共服務(wù)提供的主要責(zé)任。
第四，關(guān)于政府職能與機(jī)構(gòu)配套改革的問題。
以往歷次政府機(jī)構(gòu)改革中，我國(guó)較為注重政府與市場(chǎng)邊界的劃分，這是政府職能與作用范圍的第一次界定。但卻相對(duì)忽視了政府職能在機(jī)構(gòu)間的配置，造成了政府部門設(shè)置過細(xì)、綜合協(xié)調(diào)困難、管理成本過高等問題，實(shí)際上阻礙了政府職能轉(zhuǎn)變。深化政府機(jī)構(gòu)改革，要遵循政府職能與機(jī)構(gòu)配套改革的原則，注重政府職能在政府間與政府部門間的二次配置，將政府的經(jīng)濟(jì)調(diào)節(jié)、市場(chǎng)監(jiān)管、社會(huì)管理和公共服務(wù)職能合理、科學(xué)地配置到政府部門。要按照職能統(tǒng)一與機(jī)構(gòu)統(tǒng)一的原則，加快推進(jìn)政府事務(wù)綜合管理，加大機(jī)構(gòu)整合力度，推行“寬職能、少機(jī)構(gòu)”的大部門體制。重點(diǎn)研究衛(wèi)生、社會(huì)保障、市場(chǎng)監(jiān)管、電信監(jiān)管等領(lǐng)域的專業(yè)管理體制，研究相應(yīng)職能在政府部門間配置的科學(xué)方式。
第五，關(guān)于中央與地方權(quán)責(zé)劃分的理論問題。
中央與地方各級(jí)政府的“職責(zé)同構(gòu)”與“上下一般粗”的問題是我國(guó)政府管理中的一個(gè)老大難問題。全面履行政府職能，迫切需要在中央與地方各級(jí)政府之間科學(xué)劃分財(cái)稅、金融、投資、社會(huì)保障、義務(wù)教育、市場(chǎng)監(jiān)管等政府職責(zé)。中央政府職能重點(diǎn)是制定國(guó)家發(fā)展戰(zhàn)略、發(fā)展規(guī)劃和經(jīng)濟(jì)社會(huì)政策，統(tǒng)籌全國(guó)經(jīng)濟(jì)社會(huì)協(xié)調(diào)發(fā)展和城鄉(xiāng)、區(qū)域協(xié)調(diào)發(fā)展；改進(jìn)和完善宏觀調(diào)控，維護(hù)全國(guó)市場(chǎng)統(tǒng)一，并組織實(shí)施金融、鐵道、民航、通信、海關(guān)等特定領(lǐng)域的市場(chǎng)監(jiān)管；管理全國(guó)性和跨省際的社會(huì)事務(wù)；制定公共服務(wù)的基本標(biāo)準(zhǔn)，履行應(yīng)由中央政府承擔(dān)的公共服務(wù)財(cái)政保障責(zé)任。省級(jí)政府職能重點(diǎn)是統(tǒng)籌本地區(qū)域、城鄉(xiāng)發(fā)展，促進(jìn)社會(huì)就業(yè)，保護(hù)自然資源；指導(dǎo)和監(jiān)督檢查本地區(qū)市場(chǎng)監(jiān)管工作，并根據(jù)國(guó)家規(guī)定負(fù)責(zé)部分重點(diǎn)領(lǐng)域的市場(chǎng)監(jiān)管；管理和協(xié)調(diào)本地區(qū)重要社會(huì)事務(wù)；負(fù)責(zé)本地區(qū)教育、科技、文化、衛(wèi)生、社會(huì)保障等公共服務(wù)的統(tǒng)籌、協(xié)調(diào)和指導(dǎo)，并對(duì)基本公共服務(wù)提供必要的財(cái)政保障。市、縣政府的職能重點(diǎn)是貫徹執(zhí)行國(guó)家政策和上級(jí)政府的政策措施，促進(jìn)本地經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展；根據(jù)國(guó)家規(guī)定履行相應(yīng)的市場(chǎng)執(zhí)法職責(zé)；努力擴(kuò)大就業(yè)，解決好低收入群眾的生產(chǎn)生活問題，維護(hù)本地公共安全、生產(chǎn)安全和社會(huì)治安；負(fù)責(zé)本地基礎(chǔ)設(shè)施和城鄉(xiāng)居民公用生活設(shè)施建設(shè)和維護(hù)，保護(hù)生態(tài)環(huán)境，為城鄉(xiāng)居民提供教育、科技、文化、衛(wèi)生、社會(huì)保障等方面的服務(wù)，努力搞好基本公共服務(wù)。鄉(xiāng)鎮(zhèn)政府重點(diǎn)是為“三農(nóng)”提供服務(wù)，管理鄉(xiāng)鎮(zhèn)公共事務(wù)，促進(jìn)鄉(xiāng)鎮(zhèn)經(jīng)濟(jì)發(fā)展，維護(hù)基層穩(wěn)定。要在明確劃分中央與地方各級(jí)政府職責(zé)權(quán)限的基礎(chǔ)上，逐步實(shí)現(xiàn)中央與地方關(guān)系的法治化。
第六，關(guān)于完善公共服務(wù)體系的理論問題。
學(xué)術(shù)界對(duì)公共服務(wù)與經(jīng)濟(jì)增長(zhǎng)的關(guān)系、中國(guó)公共服務(wù)模式、公共服務(wù)標(biāo)準(zhǔn)與公共服務(wù)資源配置等問題進(jìn)行了深入的探索。學(xué)術(shù)界認(rèn)為，要深刻認(rèn)識(shí)公共服務(wù)促進(jìn)經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展的規(guī)律，認(rèn)識(shí)到公共服務(wù)對(duì)于經(jīng)濟(jì)持續(xù)增長(zhǎng)和社會(huì)發(fā)展的重要作用。完善公共服務(wù)體系，要根據(jù)中國(guó)的國(guó)情與財(cái)政狀況，做到可持續(xù)發(fā)展。中國(guó)特色公共服務(wù)模式主要是：“社會(huì)性公共服務(wù)支出為主”的公共服務(wù)支出模式、“覆蓋廣泛、水平適度、可持續(xù)發(fā)展、兼顧公平與效率”的公共服務(wù)消費(fèi)模式、“科教優(yōu)先”的公共服務(wù)增長(zhǎng)模式、“多元化、社會(huì)化、多中心治理”的公共服務(wù)供給模式。當(dāng)前，重點(diǎn)是要制定基本的公共服務(wù)標(biāo)準(zhǔn)，合理配置公共服務(wù)資源，逐步實(shí)現(xiàn)地區(qū)間基本公共服務(wù)均等化；提高公共服務(wù)的可及性和公平性，公共服務(wù)重點(diǎn)向農(nóng)村、中西部、基層、社會(huì)弱勢(shì)群體和公共服務(wù)薄弱領(lǐng)域傾斜。
第七，關(guān)于完善行政運(yùn)行機(jī)制的問題。
建立科學(xué)的政府運(yùn)行機(jī)制是實(shí)現(xiàn)政府管理科學(xué)化的前提。行政運(yùn)行機(jī)制包括決策、執(zhí)行、監(jiān)督制約、績(jī)效考核等方面。完善行政決策機(jī)制，關(guān)鍵是依法規(guī)定和合理劃分各類行政決策主體的決策權(quán)限，用嚴(yán)格規(guī)范的決策程序和決策責(zé)任制度來形成具有約束力的科學(xué)民主決策機(jī)制。完善行政執(zhí)行機(jī)制，關(guān)鍵是要解決決策職能與執(zhí)行職能適度分離的問題，借鑒國(guó)外決策與執(zhí)行分開的經(jīng)驗(yàn)，解決長(zhǎng)期以來決策與執(zhí)行不分、監(jiān)督不力的問題。健全行政監(jiān)督制約機(jī)制的重點(diǎn)是加強(qiáng)各種監(jiān)督機(jī)制之間的相互分工與制約、耦合與協(xié)調(diào)，形成人大監(jiān)督、政協(xié)監(jiān)督、政黨監(jiān)督、行政系統(tǒng)內(nèi)部監(jiān)督、專門機(jī)構(gòu)監(jiān)督、新聞與論監(jiān)督、人民群眾監(jiān)督相結(jié)合的監(jiān)督體系?？?jī)效考核的重點(diǎn)是科學(xué)確定政府、政府部門、行政項(xiàng)目的績(jī)效考核指標(biāo)體系，建立績(jī)效評(píng)估與績(jī)效報(bào)告、績(jī)效公開制度。
第八，關(guān)于法治政府建設(shè)的理論問題。
當(dāng)前重點(diǎn)是全面推進(jìn)依法行政，規(guī)范政府立法行為，完善行政執(zhí)行體制、機(jī)制與制度。特別要加快完善社會(huì)管理與公共服務(wù)方面的立法，做好應(yīng)對(duì)各種突發(fā)事件、保障農(nóng)民權(quán)益、促進(jìn)就業(yè)和完善社會(huì)保障，以及科技、教育、文化、衛(wèi)生等社會(huì)事業(yè)發(fā)展方面的立法。從長(zhǎng)遠(yuǎn)來看，要建立立法機(jī)關(guān)、司法機(jī)關(guān)對(duì)政府依法行政的權(quán)力制約機(jī)制。要建立司法審查制度，通過司法審查控制違法行政行為。為維護(hù)憲法的權(quán)威性，也要相應(yīng)完善憲法訴訟機(jī)制和違憲審查制度。
第九，關(guān)于責(zé)任政府建設(shè)的理論問題。
責(zé)任政府與各國(guó)的政體緊密相關(guān)，政體決定責(zé)任政府的具體形式。社會(huì)主義民主政治是民主政治的高級(jí)形態(tài)，其本質(zhì)是人民的統(tǒng)治，必然要求建立責(zé)任政府體制。中國(guó)責(zé)任政府是“真正的負(fù)責(zé)制”與“人民管理制”，它建立在人民代表大會(huì)制度的基礎(chǔ)之上，行政機(jī)關(guān)對(duì)權(quán)力機(jī)關(guān)的政治責(zé)任比責(zé)任內(nèi)閣制下的政府責(zé)任更為嚴(yán)格。我國(guó)責(zé)任政府體制包括兩個(gè)組成部分：一是政治問責(zé)制。在我國(guó)，國(guó)家行政機(jī)關(guān)要對(duì)國(guó)家權(quán)力機(jī)關(guān)負(fù)責(zé)，國(guó)家行政機(jī)關(guān)首長(zhǎng)要對(duì)自己機(jī)關(guān)的全面工作向國(guó)家權(quán)力機(jī)關(guān)負(fù)政治責(zé)任。如果國(guó)家權(quán)力機(jī)關(guān)對(duì)行政機(jī)關(guān)的政策、工作不滿意，可以采取質(zhì)詢、罷免等各種責(zé)任方式追究行政機(jī)關(guān)首長(zhǎng)的責(zé)任。二是行政問責(zé)制。我國(guó)一切國(guó)家機(jī)關(guān)都實(shí)行工作責(zé)任制，國(guó)家行政機(jī)關(guān)實(shí)行行政首長(zhǎng)負(fù)責(zé)制。這就決定了行政首長(zhǎng)要對(duì)整個(gè)行政機(jī)關(guān)的工作負(fù)全面責(zé)任，因而，行政首長(zhǎng)具有對(duì)政府組成部門及其首長(zhǎng)、下級(jí)行政機(jī)關(guān)及其首長(zhǎng)、公務(wù)員的行政問責(zé)權(quán)力。目前，我國(guó)長(zhǎng)沙、海南、重慶、深圳等地實(shí)行的行政問責(zé)制，主要是行政首長(zhǎng)問責(zé)制。隨著我國(guó)民主政治制度的不斷完善，要逐步實(shí)施政治問責(zé)制。