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Worthington:氨基酸氧化酶,D-:從代謝物測(cè)定到生物傳感器的開發(fā)

 艾美捷科技 2024-12-13

D-氨基酸氧化酶(DAAO)是一種氧化還原酶,它將D-氨基酸氧化脫氨基為相應(yīng)的α-酮酸。DAAO是一種黃酶,每單體含有1摩爾FAD。

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特異性

D-型脯氨酸、蛋氨酸、異亮氨酸、丙氨酸、纈氨酸和苯丙氨酸是良好的底物(Scannone等人1964年,Dixon和Kleppe 1965b年)。據(jù)報(bào)道,該酶作用于L-脯氨酸(Wellner和Scannone 1964年)和D-乳酸(Yagi和Ozawa 1964b年)。pkDAOO的最佳底物是D-脯氨酸,而DAAOs對(duì)D-天冬氨酸表現(xiàn)出非常低或沒有活性(Tishkov和Khoronenkova 2005年)。

不同物種的DAAOs一級(jí)結(jié)構(gòu)中的底物結(jié)合域沒有顯示出高度同源性。這可能反映了不同來源的DAAOs在特異性上的廣泛變化(Tishkov和Khoronenkova 2005年)。

組成

活性pkDAAO全酶是一個(gè)由347個(gè)氨基酸組成的單體,可以發(fā)生二聚化。單體比二聚體更具活性,并且每個(gè)單體含有1摩爾非共價(jià)結(jié)合的FAD。截至2000年,所有已表征的DAAOs都含有非共價(jià)結(jié)合的FAD作為它們的輔助基團(tuán)(Pilone 2000年)。

分子特征

編碼哺乳動(dòng)物DAAO的基因在基因組中只有一個(gè)副本。一個(gè)1041 bp的開放閱讀框架編碼了酶的所有347個(gè)氨基酸。這表明沒有發(fā)生由蛋白酶催化的翻譯后加工(Fukui 1987年)。

豬D-氨基酸氧化酶的一級(jí)結(jié)構(gòu)由Ronchi等人(Ronchi等人1982年)確定,基因由Momoi等人(Momoi等人1988年)克隆。在不同來源的DAAOs中,一級(jí)結(jié)構(gòu)中有六個(gè)區(qū)域高度保守(Faotto等人1995年)。區(qū)域I包含共識(shí)序列GXGXXG,區(qū)域I和III已被發(fā)現(xiàn)涉及輔酶結(jié)合(Wierenga等人1983年)。區(qū)域II、IV和V包含活性位點(diǎn)殘基。Ser-Lys/His-Leu末端序列是過氧化物酶體靶向信號(hào)序列(Subramani 1993年,Pilone 2000年)。

哺乳動(dòng)物DAAOs顯示出63%的同一性,而三種已知的微生物DAAOs(R. gracilis、T. variabilis和Fusarium solanii)顯示出18%的同一性。酵母和哺乳動(dòng)物DAAOs之間觀察到30%的同一性(Pilone 2000年)。

Worthington氨基酸氧化酶,D-(9000-88-8)的應(yīng)用:

酮酸制備

氧化還原研究

從外消旋混合物中分離L-氨基酸

FAD測(cè)定

D-丙氨酸測(cè)定

生物傳感器(Inaba等人2003年)

D-氨基酸氧化酶的特性:

CATH分類

類別:Alpha Beta

架構(gòu):2層三明治和3層(aba)三明治

拓?fù)洌篋-氨基酸氧化酶;鏈A,第2個(gè)結(jié)構(gòu)域和Rossmann折疊

分子量:78.7 kDa(理論)

單體:38.0-39.0 kDa(Curti等人1973年,Tu等人1973年)

最佳pH值:

取決于底物:D-丙氨酸約為9(Dixon和Kleppe 1965c年)。

等電點(diǎn):7.0,7.2(Tishkov和Khoronenkova 2005年)

消光系數(shù):

75,420 cm-1 M-1(理論)

E1%,280 = 19.17(理論)

活性位點(diǎn)殘基:

酪氨酸(Y224)

天冬氨酸(D228)

精氨酸(R283)

(Pilone 2000年)

抑制劑:

2-羥酸,2-酮酸和2-氧丁酸(Dixon 1965b年)

代謝產(chǎn)物和藥物(Hamilton和Buckthal 1982年)

腺苷5'-單磷酸和苯胺(Yagi等人1972c年)

苯甲酸(Pollegioni等人2007年)

苯甲酸鈉(Nguyen等人2009年)

文獻(xiàn)參考:

Aki, K. , Tagagi, T. , Isemura, T. and Yamano, T.

Optical Rotatory Dispersion and Circular Dichroism of D-Amino Acid Oxidase , Biochim Biophys Acta 122 , 193 , 1966

Alston, T. , Porter, D. and Bright, H.

Suicide Inactivation of D-Amino Acid Oxidase by 1-Chloro-1-Nitroethane , J Biol Chem 258 , 1136 , 1983

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