一区二区三区日韩精品-日韩经典一区二区三区-五月激情综合丁香婷婷-欧美精品中文字幕专区

分享

廣州實(shí)驗(yàn)室廖礦標(biāo)課題組ACS Catal.:基于人工智能與高通量實(shí)驗(yàn)技術(shù)開發(fā)鎳催化的不對(duì)稱交叉偶聯(lián)反應(yīng)

 CBG資訊公眾號(hào) 2024-12-10 發(fā)布于江蘇


導(dǎo)語

傳統(tǒng)的不對(duì)稱合成方法開發(fā)很大程度上依賴于化學(xué)經(jīng)驗(yàn),人工智能(AI)與高通量實(shí)驗(yàn)(HTE)技術(shù)的有機(jī)結(jié)合,為發(fā)現(xiàn)和優(yōu)化不對(duì)稱反應(yīng)提供了一種新的模式,具有革新這一領(lǐng)域的巨大潛力。廣州國(guó)家實(shí)驗(yàn)室廖礦標(biāo)課題組近期開發(fā)了一套高效的工作流程,利用AI和HTE技術(shù)開發(fā)了一系列鎳催化的不對(duì)稱交叉偶聯(lián)反應(yīng),以高產(chǎn)率和高對(duì)映選擇性地構(gòu)建了一系列手性sp3碳碳鍵。相關(guān)研究成果在線發(fā)表于ACS Catal.(DOI: 10.1021/acscatal.4c04277)。



前沿科研成果

天然豐富的sp3碳立體中心在多種天然產(chǎn)物、藥物和材料中普遍存在。因此,開發(fā)能夠同時(shí)構(gòu)建sp3碳中心和控制立體化學(xué)的方法至關(guān)重要,盡管這一過程充滿挑戰(zhàn)。在過去的二十年中,過渡金屬催化的不對(duì)稱交叉偶聯(lián)反應(yīng)取得了顯著進(jìn)展,特別是鎳催化劑因其獨(dú)特的催化活性而受到廣泛關(guān)注。目前已經(jīng)開發(fā)出多種用于構(gòu)建手性sp3碳雜化中心的高效方法,如鎳催化的不對(duì)稱交叉偶聯(lián)和親電交叉偶聯(lián)、鎳/光氧化還原催化的不對(duì)稱偶聯(lián),以及鎳氫化物催化的烯烴不對(duì)稱氫碳化反應(yīng)等(圖1a)。這些轉(zhuǎn)化通常在偶聯(lián)產(chǎn)物生成之前經(jīng)歷共同的Ni(III)中間體,這個(gè)關(guān)鍵的中間體是含有手性配體和偶聯(lián)片段的Ni(III)復(fù)合物,通過手性配體和底物片段共同創(chuàng)造了一個(gè)特定的手性環(huán)境,從而決定了偶聯(lián)產(chǎn)物的對(duì)映選擇性(圖1a)。鎳催化劑常用含氮配體,如惡唑啉配體(例如Box, Biox, Pyox, Pybox)、咪唑啉配體和手性二胺配體等(圖1b)。作者認(rèn)為可能存在一個(gè)普遍適用的規(guī)則控制著鎳催化偶聯(lián)反應(yīng)的對(duì)映選擇性,這一規(guī)則可以通過AI闡明,并幫助化學(xué)家開發(fā)新的不對(duì)稱反應(yīng)。基于這一機(jī)理見解,作者開發(fā)了一個(gè)簡(jiǎn)明的AI預(yù)測(cè)模型,闡明了控制鎳催化不對(duì)稱偶聯(lián)反應(yīng)對(duì)映選擇性的一般規(guī)則,利用AI輔助的手性配體篩選和HTE輔助的條件優(yōu)化,成功地開發(fā)了多種類型的鎳催化不對(duì)稱交叉偶聯(lián)反應(yīng)(圖1c)。

圖1(來源:ACS Catal.
作者收集了2023年之前發(fā)表的117篇文獻(xiàn)中記錄的4219個(gè)鎳催化的不對(duì)稱反應(yīng)數(shù)據(jù),并通過高通量實(shí)驗(yàn)平臺(tái)獲得了2371個(gè)鎳催化不對(duì)稱交叉偶聯(lián)的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),共同建立了包含6590條數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)集,使用基于機(jī)器學(xué)習(xí)的預(yù)測(cè)模型來確定手性配體對(duì)偶聯(lián)產(chǎn)物的影響。由文獻(xiàn)數(shù)據(jù)可知,鎳催化的不對(duì)稱交叉偶聯(lián)反應(yīng)中控制產(chǎn)物對(duì)映選擇性的關(guān)鍵因素是手性配體,因此作者僅以關(guān)鍵的手性配體、手性產(chǎn)物以及反應(yīng)溫度參數(shù)作為模型輸入,過渡態(tài)自由能差ΔΔG?作為輸出,利用課題組開發(fā)的分子加和性指紋(MAF)作為分子描述符,利用亞馬遜公司開發(fā)的自動(dòng)機(jī)器學(xué)習(xí)平臺(tái)AutoGluon進(jìn)行建模,經(jīng)過優(yōu)化后得到了一個(gè)良好的預(yù)測(cè)模型,其R2為0.880,平均絕對(duì)誤差(MAE)為0.173 kcal/mol
作者使用2023年之后報(bào)道的鎳催化不對(duì)稱交叉偶聯(lián)反應(yīng)數(shù)據(jù)作為實(shí)際外部驗(yàn)證集,以驗(yàn)證AutoGluon模型的性能。如表2所示,文獻(xiàn)中的實(shí)驗(yàn)ee值與模型預(yù)測(cè)ee值之間的絕對(duì)誤差大部分在10%以內(nèi),甚至有些誤差在5%以內(nèi)。此外,這些文獻(xiàn)中的最優(yōu)配體大多數(shù)在模型預(yù)測(cè)的配體排名的前10位(表1)。也就是說,機(jī)器學(xué)習(xí)模型可以應(yīng)用于手性配體的虛擬優(yōu)化,只需要進(jìn)行少量嘗試即可獲得最優(yōu)配體。
表1(來源:ACS Catal.
作者繼續(xù)嘗試將模型應(yīng)用于新的鎳催化不對(duì)稱反應(yīng)的發(fā)現(xiàn)和優(yōu)化過程。該模型不僅可以應(yīng)用于對(duì)已知反應(yīng)的進(jìn)一步開發(fā)與優(yōu)化(圖2a, b),還可以基于高通量實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)的一系列新反應(yīng)快速進(jìn)行不對(duì)稱偶聯(lián)反應(yīng)手性配體的開發(fā)(圖2c, d)。作者將HTE實(shí)驗(yàn)隨機(jī)選擇的47個(gè)手性配體、AI預(yù)測(cè)的最優(yōu)Top 5手性配體、基于人工經(jīng)驗(yàn)挑選的數(shù)據(jù)庫(kù)中的高頻出現(xiàn)的Top 7手性配體以及平均結(jié)果最優(yōu)的Top 7手性配體,對(duì)這些新發(fā)現(xiàn)的偶聯(lián)反應(yīng)進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,AI預(yù)測(cè)的最優(yōu)配體表現(xiàn)明顯優(yōu)于隨機(jī)篩選的配體,以及基于人工經(jīng)驗(yàn)挑選的手性配體(圖2e)。充分證明了模型能夠高效地進(jìn)行手性配體的虛擬篩選,并最大限度地減少隨機(jī)的篩選工作。
圖2(來源:ACS Catal.
然后作者利用AI預(yù)測(cè)的最優(yōu)配體針對(duì)典型的交叉偶聯(lián)反應(yīng)反應(yīng)條件進(jìn)行了高通量實(shí)驗(yàn)篩選,通過結(jié)合AI輔助的手性配體篩選和HTE輔助的條件優(yōu)化,快速開發(fā)了一系列鎳催化不對(duì)稱交叉偶聯(lián)反應(yīng),并對(duì)其中一種類型的不對(duì)稱交叉偶聯(lián)反應(yīng)進(jìn)行了底物普適性考察,以良好的收率和ee值得到了一系列含氮手性化合物(圖3)。
圖3(來源:ACS Catal.
作者提出了一個(gè)結(jié)合高通量實(shí)驗(yàn)(HTE)和人工智能(AI)的高效工作流程,用于開發(fā)新型的鎳催化不對(duì)稱交叉偶聯(lián)反應(yīng)。基于分子加和性指紋(MAF)描述符的AutoGluon模型被用來指導(dǎo)手性配體的高效篩選,而HTE則被用作反應(yīng)參數(shù)優(yōu)化的強(qiáng)大工具。基于反應(yīng)機(jī)理,特別是關(guān)鍵的Ni(III)中間體的理解,準(zhǔn)確建立了反應(yīng)對(duì)映選擇性的回歸模型。這個(gè)機(jī)器學(xué)習(xí)模型不僅能夠準(zhǔn)確預(yù)測(cè)最近文獻(xiàn)中報(bào)道的最優(yōu)配體,而且可以應(yīng)用于新的鎳催化不對(duì)稱交叉偶聯(lián)反應(yīng)的手性配體優(yōu)化,從而成功合成了一系列具有良好產(chǎn)率和對(duì)映選擇性的手性sp3碳碳鍵。這種創(chuàng)新的工作流程將作為不對(duì)稱方法開發(fā)的一個(gè)新模式,并激勵(lì)研究人員進(jìn)一步探索HTE和AI在這一領(lǐng)域的發(fā)展?jié)摿Α?/span>
該工作近期發(fā)表在ACS Catal.,論文第一作者是廣州國(guó)家實(shí)驗(yàn)室博士后高亞東以及中山大學(xué)聯(lián)合培養(yǎng)2023級(jí)博士研究生胡坤軍,廖礦標(biāo)研究員為該論文的通訊作者。廣州國(guó)家實(shí)驗(yàn)室饒建行、中國(guó)科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院朱強(qiáng)研究員參與了該工作。上述研究工作得到了國(guó)家自然科學(xué)基金((22071249和 22393892)的資助。


課題組簡(jiǎn)介

課題組長(zhǎng)期致力于利用自動(dòng)化、高通量、人工智能等現(xiàn)代化學(xué)技術(shù),開發(fā)新型合成方法學(xué),建立人工智能反應(yīng)預(yù)測(cè)模型,聚焦呼吸系統(tǒng)疾病開展新藥研發(fā)。具體的研究方向包括:1. 合成方法學(xué):圍繞惰性化學(xué)鍵(碳?xì)滏I、碳碳鍵等)精準(zhǔn)轉(zhuǎn)化開發(fā)方法學(xué);2. 反應(yīng)預(yù)測(cè)模型:利用自動(dòng)化高通量技術(shù),收集標(biāo)準(zhǔn)化的反應(yīng)數(shù)據(jù),建立人工智能反應(yīng)預(yù)測(cè)模型,實(shí)現(xiàn)合成路徑、反應(yīng)條件或反應(yīng)結(jié)果的精準(zhǔn)預(yù)測(cè),目前在研項(xiàng)目包括惰性碳?xì)洹⑻继兼I活化、不對(duì)稱催化、光催化等類型的反應(yīng)或反應(yīng)體系;3. 呼吸系統(tǒng)疾病新藥研發(fā):開發(fā)新型化合物庫(kù)合成以及活性篩選工具,研發(fā)抗冠狀病毒的小分子藥物。



作者簡(jiǎn)介

通訊作者

廖礦標(biāo),廣州實(shí)驗(yàn)室研究員,博士生導(dǎo)師,國(guó)家高層次青年人才,廣東青年五四獎(jiǎng)?wù)芦@得者。課題組長(zhǎng)期致力于利用自動(dòng)化、高通量、人工智能等現(xiàn)代化學(xué)技術(shù),開發(fā)新型合成方法學(xué),建立人工智能反應(yīng)預(yù)測(cè)模型,聚焦呼吸系統(tǒng)疾病開展新藥研發(fā)。具體的研究方向包括:1. 合成方法學(xué):圍繞惰性化學(xué)鍵精準(zhǔn)轉(zhuǎn)化開發(fā)方法學(xué);2. 反應(yīng)預(yù)測(cè)模型:利用自動(dòng)化高通量技術(shù),收集標(biāo)準(zhǔn)化的反應(yīng)數(shù)據(jù),建立人工智能反應(yīng)預(yù)測(cè)模型,實(shí)現(xiàn)合成路徑、反應(yīng)條件或反應(yīng)結(jié)果的精準(zhǔn)預(yù)測(cè);3. 呼吸系統(tǒng)疾病新藥研發(fā):開發(fā)新型化合物庫(kù)合成以及活性篩選工具,研發(fā)抗冠狀病毒的小分子藥物。至今,已以通訊作者或第一作者在Nature(2篇)、Nat. Chem.、Chem、Angew. Chem.、Sci. China Chem.、ACS Catal.等期刊發(fā)表系列論文。

第一作者

高亞東博士,2020年畢業(yè)于南京理工大學(xué)與北京生命科學(xué)研究所,隨后在廣州國(guó)家實(shí)驗(yàn)室廖礦標(biāo)課題組進(jìn)行博士后研究,現(xiàn)為中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥物研究所助理研究員。以第一作者在Chem, Angew. Chem. Int. Ed., ACS Catal., Org. Chem. Front.等期刊發(fā)表系列論文。
胡坤軍,2019~2022于上海師范大學(xué)與中科院上海有機(jī)所進(jìn)行官方聯(lián)合培養(yǎng),2022年獲得有機(jī)化學(xué)碩士學(xué)位,隨后在廣州國(guó)家實(shí)驗(yàn)室廖礦標(biāo)課題組工作并于2023年轉(zhuǎn)為中山大學(xué)同廣州國(guó)家實(shí)驗(yàn)室聯(lián)合培養(yǎng)博士研究生。以第一作者在ACS Catal., Organometallics等期刊發(fā)表研究論文。

論文信息

Artificial Intelligence-Driven Development of Nickel-Catalyzed Enantioselective Cross-Coupling Reactions

Yadong Gao,# Kunjun Hu,# Jianhang Rao, Qiang Zhu, Kuangbiao Liao*

ACS Catal. 2024, DOI: 10.1021/acscatal.4c04277

    轉(zhuǎn)藏 分享 獻(xiàn)花(0

    0條評(píng)論

    發(fā)表

    請(qǐng)遵守用戶 評(píng)論公約

    類似文章

    在线视频免费看你懂的| 欧美午夜性刺激在线观看| 色丁香一区二区黑人巨大| 国产又粗又猛又大爽又黄| 草草夜色精品国产噜噜竹菊| 高清亚洲精品中文字幕乱码| 午夜小视频成人免费看| 色狠狠一区二区三区香蕉蜜桃| 激情偷拍一区二区三区视频| 正在播放玩弄漂亮少妇高潮| 久久国内午夜福利直播| 女人高潮被爽到呻吟在线观看| 91人妻人人精品人人爽| 欧美日韩综合免费视频| 午夜精品一区二区av| a久久天堂国产毛片精品| 成人精品视频一区二区在线观看| 亚洲欧美日韩综合在线成成| 久久经典一区二区三区| 91免费一区二区三区| 黄片在线观看一区二区三区| 欧美不卡一区二区在线视频| 最近中文字幕高清中文字幕无 | 99久久精品国产日本| 91福利视频日本免费看看| 中文字幕日韩欧美亚洲午夜 | 欧美极品欧美精品欧美| 黄色美女日本的美女日人| 久久精品亚洲精品一区| 日本亚洲精品在线观看| 亚洲最新中文字幕在线视频| 中文字幕人妻一区二区免费| 亚洲欧美中文字幕精品| 欧美精品在线观看国产| 亚洲国产性生活高潮免费视频 | 在线免费不卡亚洲国产| 中文字幕一区二区熟女| 99久久国产精品亚洲| 可以在线看的欧美黄片| 亚洲性生活一区二区三区| 亚洲国产av精品一区二区|