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【LorMe周刊】受入侵微生物群落穩(wěn)定性與裝配過程之間的關(guān)聯(lián)

 LorMe青年 2024-11-26 發(fā)布于江蘇

作者:張子茹,南京農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士在讀,主要研究資源調(diào)控微生物互作。

周刊主要展示LorMe團(tuán)隊(duì)成員優(yōu)秀周報(bào),每周定期為您奉上學(xué)術(shù)盛宴!本期周刊為您介紹被細(xì)菌入侵后,微生物群落穩(wěn)定性與裝配過程之間的關(guān)聯(lián),原文于2024年4月25日發(fā)表在ISME上。

     導(dǎo) 讀     

了解菌群穩(wěn)定性與裝配過程之間的關(guān)系在微生物生態(tài)學(xué)領(lǐng)域至關(guān)重要,本研究旨在解析生物擾動(dòng)對(duì)菌群的影響是否受群落裝配過程調(diào)控。結(jié)果表明,以隨機(jī)裝配過程為主導(dǎo)的土著菌群更易受入侵物種的定殖影響。具體而言,大腸桿菌的入侵作為生物選擇壓力引發(fā)了入侵物種和土著群落間的競(jìng)爭(zhēng),減弱了土著群落裝配的隨機(jī)性。本研究為闡明微生物群落穩(wěn)定性及其潛在生態(tài)系統(tǒng)功能提供了重要的理論依據(jù)。

實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)    

將新鮮的土壤懸浮液加入土壤,分別培養(yǎng)0天、5天、10天和20天(分別用C0,C5,C10,C20表示),以構(gòu)建4種不同土著菌群,培養(yǎng)時(shí)間的差異模擬了受不同群落裝配過程調(diào)控的種間相互作用強(qiáng)度變化。隨后,引入入侵物種-大腸桿菌,對(duì)上述4種不同土著菌群施加生物入侵壓力。入侵后,將各處理菌群繼續(xù)培養(yǎng)20天,同時(shí)設(shè)置未入侵的群落作為對(duì)照。

    主要結(jié)果    

1. 入侵物種生存及其與土著群落裝配過程之間的關(guān)聯(lián)

大腸桿菌入侵后20天,添加新鮮土壤懸浮液土壤(細(xì)菌密度較低)中存活率高于引入微生物群落的土壤C0-C20。大腸桿菌在4個(gè)土著群落中的存活率也有顯著差異,其中C20的存活率最高(圖1A)。發(fā)現(xiàn)大腸桿菌的存活率與土著群落中隨機(jī)性裝配過程的增加顯著相關(guān)(圖1B)。通過對(duì)細(xì)菌群落16SrRNA基因rrn拷貝數(shù)分析發(fā)現(xiàn),隨著菌群培養(yǎng)時(shí)間的延長(zhǎng),整個(gè)菌群逐漸由r-策略向k-策略轉(zhuǎn)變,這種生活策略的轉(zhuǎn)變與群落裝配過程中隨機(jī)性/確定性比例變化密切相關(guān)(圖1C。變異劃分分析(VPA)表明,群落生活策略的轉(zhuǎn)變(由rrn拷貝數(shù)估計(jì))群落隨機(jī)性裝配過程共同促進(jìn)了大腸桿菌的存活(圖1D)。

圖1.入侵物種生存及其與土著群落裝配過程之間的關(guān)聯(lián)

2. 大腸桿菌入侵削弱土著群落的隨機(jī)裝配過程比例

通過計(jì)算入侵處理和未入侵處理群落的加權(quán)UniFrac距離,評(píng)估入侵對(duì)土著群落結(jié)構(gòu)的影響(圖2)。觀察到與C10和C20相比,隨機(jī)裝配過程比例較少的C0和C5中的群落結(jié)構(gòu)變化更為顯著,這一現(xiàn)象表明入侵物種與土著群落之間的競(jìng)爭(zhēng)關(guān)系很大程度上決定入侵物種存活狀態(tài)和土著群落結(jié)構(gòu)的重塑。還發(fā)現(xiàn)與C10和C20相比,C0和C5有更多的ASV顯著變化,豐度下降的ASV在系統(tǒng)發(fā)育上接近大腸桿菌屬。

大腸桿菌的入侵顯著削弱了土著微生物群落中隨機(jī)裝配過程的相對(duì)重要性(圖2A),反映了土壤微生物群落所承受的生物脅迫。具體來說,C0和C5處理的隨機(jī)性裝配過程的減弱程較C10和C20更顯著,與前述群落結(jié)構(gòu)變化一致(圖2B)。大腸桿菌入侵對(duì)C0和C5的作用不僅強(qiáng)化了同質(zhì)選擇過程,還減弱了擴(kuò)散限制和隨機(jī)漂移的影響,進(jìn)一步證實(shí)了生物擾動(dòng)在塑造微生物群落裝配過程中的重要性。

圖2.大腸桿菌入侵削弱土著群落的隨機(jī)裝配過程比例

   結(jié) 論   

綜上所述研究將土壤微生物群落的裝配過程與其抵御外來入侵物種的生態(tài)競(jìng)爭(zhēng)力及群落結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性緊密聯(lián)系起來。研究結(jié)果不僅闡明了土壤微生物群落應(yīng)對(duì)外來物種入侵的動(dòng)態(tài)機(jī)制,也為理解微生物生態(tài)學(xué)中群落裝配與生態(tài)位競(jìng)爭(zhēng)的復(fù)雜互動(dòng)提供了重要依據(jù)。

論文信息

原名:Bridging ecological assembly process and community stability upon bacterial invasions

譯名:受入侵微生物群落穩(wěn)定性與裝配過程之間的關(guān)聯(lián)

期刊:ISME

DOI:10.1093/ismejo/wrae066

發(fā)表時(shí)間2024.4.25

通訊作者:Joana Falc?o Salles

通訊作者單位:格羅寧根大學(xué)

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