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大家好，今天介紹的文章題目為Myel oid-specific KDM6B inhib ition sensitizes gliobla stoma to PD1 blockade（髓系特異性KDM6B抑制使膠質(zhì)母細(xì)胞瘤對(duì)PD1阻斷敏感）膠質(zhì)母細(xì)胞瘤（GBM）富含免疫抑制骨髓細(xì)胞，對(duì)免疫檢查點(diǎn)療法（ICT）無效。通過表觀遺傳途徑調(diào)整免疫抑制骨髓細(xì)胞功能表型以克服ICT耐藥性尚待研究。 01 研究背景 膠質(zhì)母細(xì)胞瘤 （GBM） 腫瘤富含免疫抑制性骨髓細(xì)胞，并且對(duì)免疫檢查點(diǎn)治療 （ICT） 無效。靶向表觀遺傳途徑以重新編程免疫抑制性骨髓細(xì)胞的功能表型以克服對(duì)ICT的抗性仍未探索。 人GBM腫瘤的單細(xì)胞和空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析顯示，表觀遺傳酶組蛋白3賴氨酸27脫甲基酶（KDM6B）在腫瘤內(nèi)免疫抑制性骨髓細(xì)胞亞群中的高表達(dá)。 重要的是，骨髓細(xì)胞特異性Kdm6b缺失增強(qiáng)了GBM荷瘤小鼠的促炎途徑并提高了存活率。機(jī)制研究表明，Kdm6b的缺失通過抑制免疫抑制介質(zhì)（包括Mafb，Socs3和Sirpa）來增強(qiáng)骨髓細(xì)胞中的抗原呈遞，干擾素反應(yīng)和吞噬作用。 見圖一 KDM6B富集在人GBM的瘤內(nèi)骨髓細(xì)胞中。  圖一 a，scRNA seq數(shù)據(jù)的特征圖，顯示了編碼表觀遺傳酶的指示基因在腫瘤內(nèi)骨髓細(xì)胞簇中的表達(dá)，如圖所示。1c. b，scRNA seq 數(shù)據(jù)的 UMAP 圖，顯示來自 GBM 患者（n = 45 名患者）的 GBM TME 中的 CD4+ 免疫細(xì)胞亞群。 c，小提琴圖顯示指示基因在不同免疫細(xì)胞簇中的表達(dá)水平。 d，scRNA seq 數(shù)據(jù)的 UMAP 圖，描繪了來自 GBM 患者的 GBM TME 中的 CD45+ 免疫細(xì)胞亞群（n = 20 名患者）。 e，小提琴圖表示指示基因在不同免疫細(xì)胞簇中的表達(dá)水平。 f，小提琴圖顯示了KDM6B在GBM（n = 5例患者）TME中不同骨髓細(xì)胞簇中的表達(dá)水平，請(qǐng)參見圖。1c. 虛線表示用于定義 KDM6B 的截止 KDM6B 表達(dá)式值高和 KDM6B低細(xì)胞。 g，h， 代表KDM6B間差異表達(dá)基因的火山圖高和 KDM6B低GBM （g） n = 4 例患者 （h） n = 13 例患者的 TME 中的髓系細(xì)胞?；鹕綀D顯示褶皺變化（對(duì)數(shù)2FC）與絕對(duì)置信度log10調(diào)整后的p值（-log10（p））相對(duì)立。雙尾泊松測(cè)試是使用修拉R包進(jìn)行的。 見圖二 KDM6B高 富含骨髓細(xì)胞的區(qū)域在人GBM腫瘤中缺乏CD8 T細(xì)胞。  圖二 a，蘇木精和伊紅染色GBM腫瘤切片（n = 3例患者）。每個(gè)部分代表一名患者。圖像中包含的比例。 b，代表性圖顯示GBM組織樣本中KDM6B的免疫組織化學(xué)染色（n = 3例患者）。 c，d，多重免疫熒光染色顯示 GBM 腫瘤樣本中 CD3（白色）、KDM6B（藍(lán)色）、CD68（綠色）、GFAP（黃色）和 CD163（紅色）的分布。箭頭標(biāo)記顯示KDM6B蛋白表達(dá)與CD68和CD163的共定位。數(shù)據(jù)代表兩個(gè)獨(dú)立實(shí)驗(yàn)。 e，i，UMAP圖匹配的scRNA序列數(shù)據(jù)顯示GBM TME中的CD45 +免疫細(xì)胞亞群，用于通過應(yīng)用CellTrek將單個(gè)細(xì)胞嵌入到組織切片中的空間坐標(biāo)中。 f，j， 在空間坐標(biāo)上繪制的來自匹配患者的所有不同免疫細(xì)胞簇的基因表達(dá)數(shù)據(jù)。 g，h，k，l，Visium空間基因表達(dá)評(píng)分圖，用于表達(dá)CD68 + KDM6B + CD163 + KLF2 + CXCL8表達(dá)骨髓細(xì)胞簇（以藍(lán)綠色突出顯示）和CD3E + CD8A + GZMB + GZMK + ICOS T細(xì)胞簇（以紅色突出顯示）在人GBM腫瘤中的空間分布表達(dá)骨髓細(xì)胞和活化的CD6 T細(xì)胞。 見圖三 表達(dá)KDM6B的免疫細(xì)胞簇富含免疫抑制標(biāo)志物。  圖三 a-c，點(diǎn)圖顯示感興趣基因的平均基因活性評(píng)分以及簇中表達(dá)指定簇中基因的細(xì)胞的百分比（如圖所示）。2e，以及擴(kuò)展數(shù)據(jù)圖中所示的b和c。2e， i）。 見圖四 Kdm6b的髓細(xì)胞特異性缺失不影響髓系細(xì)胞豐度。  圖四 a，演示LysM生成的示意圖克雷KDM6B佛羅里達(dá)州/佛羅里達(dá)州遺傳鼠模型。 b，瓊脂糖凝膠的代表性圖像，顯示描述來自Kdm6b刪除純合小鼠（單個(gè)400 bp條帶），Kdm6b刪除雜合子小鼠（368和400 bp條帶）和對(duì)照純合子小鼠（單個(gè)368 bp條帶）的PCR擴(kuò)增DNA的條帶。數(shù)據(jù)代表兩個(gè)獨(dú)立實(shí)驗(yàn)。 c，t-SNE圖和箱須圖，描繪了對(duì)照和LysM中指示解剖位置中存在的不同免疫細(xì)胞群的身份和豐度克雷KDM6B佛羅里達(dá)州/佛羅里達(dá)州通過CyTOF分析確定的小鼠。n = 3只雌性小鼠/組。進(jìn)行雙尾學(xué)生t檢驗(yàn)（ns=不顯著）。晶須表示最小值到最大值。 見圖五 Kdm6b的骨髓特異性缺失改變了腫瘤內(nèi)免疫細(xì)胞的豐度。  圖五 a，熱圖顯示了目標(biāo)基因在不同Cd45+免疫細(xì)胞簇中的表達(dá)（如圖所示）。 b，條形圖，描繪對(duì)照和LysM中不同腫瘤內(nèi)免疫細(xì)胞亞群的頻率克雷KDM6B佛羅里達(dá)州/佛羅里達(dá)州小 鼠。 c，條形圖表示腫瘤內(nèi)CTL和Tregs在對(duì)照和LysM中的比率克雷KDM6B佛羅里達(dá)州/佛羅里達(dá)州根據(jù)scRNA序列。 d，確定的小鼠，小提琴圖描繪了對(duì)照和LysM中不同免疫細(xì)胞簇中Lyz2的表達(dá)水平克雷KDM6B佛羅里達(dá)州/佛羅里達(dá)州小 鼠。兩個(gè)獨(dú)立的scRNA序列實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)代表。 e–g，箱形和晶須圖，代表流式細(xì)胞術(shù)分析來自對(duì)照和 LysM 的 PBMC （e）、淋巴結(jié) （f） 和脾臟 （g） 中存在的不同免疫細(xì)胞群的豐度克雷KDM6B佛羅里達(dá)州/佛羅里達(dá)州攜帶GBM腫瘤的雌性小鼠（n = 3個(gè)生物學(xué)獨(dú)立的樣品/組對(duì)于（E），n = 4個(gè)生物學(xué)獨(dú)立的樣品/組對(duì)于f和g。進(jìn)行雙尾學(xué)生t檢驗(yàn)。晶須表示最小值到最大值。 見圖六 Kdm6b的髓系特異性缺失使TME偏向促炎表型。  圖六 a，熱圖顯示了圖中所示免疫細(xì)胞簇中感興趣的蛋白質(zhì)標(biāo)記物的表達(dá)。3g通過質(zhì)控細(xì)胞術(shù)測(cè)定。 b，熱圖顯示了不同骨髓細(xì)胞簇中目的基因的表達(dá)（如圖所示。四右面板）。 c，代表對(duì)照組和LysM的腫瘤內(nèi)骨髓簇頻率的條形圖克雷KDM6B佛羅里達(dá)州/佛羅里達(dá)州小 鼠。兩個(gè)獨(dú)立實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)代表。 見圖七 Kdm6b缺失改變了腫瘤內(nèi)骨髓細(xì)胞的染色質(zhì)景觀。  圖七 a， UMAP展示了GBM（GL261）TME控制和LysM中的CTL和Treg簇克雷KDM6B佛羅里達(dá)州/佛羅里達(dá)州通過scATAC序列測(cè)定小鼠（如圖所示。第5a、b段）。 b，條形圖描繪了對(duì)照和LysM中腫瘤內(nèi)CTL和Treg的頻率和比率克雷KDM6B佛羅里達(dá)州/佛羅里達(dá)州根據(jù)scATAC序列b確定的小鼠，描述CTL和Treg簇中指定基因的染色質(zhì)可及性的覆蓋圖。 c，熱圖顯示了感興趣的基因在指示的骨髓細(xì)胞簇中的表達(dá)（如圖所示。5d）。 d，e， 覆蓋圖描繪了感興趣基因中指示染色質(zhì)區(qū)域（峰）的可及性。 02 研究結(jié)論 此外，KDM6B的藥理學(xué)抑制反映了Kdm6b缺失髓系細(xì)胞的功能表型，并增強(qiáng)了抗PD1功效。因此，本研究將KDM6B確定為骨髓細(xì)胞亞群功能表型的表觀遺傳調(diào)節(jié)因子，以及增強(qiáng)ICT反應(yīng)的潛在治療靶點(diǎn)。 好了，今天的文獻(xiàn)解讀就到這兒來，我們下期再見！如果你正在開展臨床研究.需要方案設(shè)計(jì).數(shù)據(jù)管理. 數(shù)據(jù)分析等支持.也隨時(shí)可以聯(lián)系我們。 |
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