木蘭縣由縣境內(nèi)的木蘭達河而得名?！澳咎m達”為蒙古語，是“牧馬場”或“圍場”的意思。

先秦時，木蘭縣境內(nèi)為濊貊族活動區(qū)域。秦漢年間，境內(nèi)為北夫余屬地。漢末，挹婁族興起，境內(nèi)屬挹婁西境。魏晉時期，北夫余之裔在夫余國故地建寇漫汗國，境內(nèi)遂屬其轄。南北朝，勿吉族建國，境內(nèi)受勿吉黑水部轄。隋代，勿吉演變?yōu)?/span>靺鞨，境內(nèi)遂為靺鞨黑水部轄。唐代，黑龍江地區(qū)納入唐朝版圖，改治黑水都督府，境內(nèi)遂為其轄地。五代，耶律阿保機于建立遼朝，原黑水鞨靺歸遼，境內(nèi)歸東京道術(shù)甲部所轄。宋，完顏阿骨打建金滅遼，境內(nèi)屬金國上京會寧府(阿城)所轄。金轄地被韃靼占領(lǐng)后，境內(nèi)便成為成吉思汗幼弟帖木格斡赤斤的封地。元，改行省制，境內(nèi)初屬遼陽行中書省開元路，后為合蘭府水達達路所轄。明，東北實行都司衛(wèi)所制，境內(nèi)屬奴兒干都指揮使司所轄。永樂五年(1408年)，設(shè)置木蘭河衛(wèi)，亦稱哈夫衛(wèi)。清，初為盛京將軍(昂邦章京)管轄。順治十年(1653年)為寧古塔昂邦章京管轄?？滴踉?1662年)改為寧古塔將軍統(tǒng)領(lǐng)境內(nèi)軍政事宜?？滴醵?1683年)十月，曾設(shè)黑龍江將軍衙門，境內(nèi)遂屬其轄。雍正十二年(1734年)歸呼蘭城守尉直轄。同治元年(1862年)呼蘭城守尉下設(shè)呼蘭廳(巴彥縣)，境內(nèi)遂為其屬地。光緒五年(1879年)改呼蘭城守尉為呼蘭副都統(tǒng)，境內(nèi)仍歸其轄治。光緒二十八年(1902年)，建東興鎮(zhèn)。光緒三十二年(1906年)巴彥蘇蘇旗營協(xié)領(lǐng)遷至東興鎮(zhèn)，置協(xié)領(lǐng)公署，歸呼蘭副都統(tǒng)管轄。光緒三十一年(1905年)，副都統(tǒng)升呼蘭廳為呼蘭府，移治呼蘭，而于原呼蘭廳治設(shè)巴彥州，隸屬呼蘭府，將蒙古爾山(蒙古山)以東大、小木蘭達、白楊木河一帶從巴彥州劃出，置木蘭縣，與東興鎮(zhèn)均隸屬巴彥州。光緒三十三年(1907年)廢將軍，改行省制，木蘭為黑龍江轄境。

民國元年(1912年)，撤東興鎮(zhèn)協(xié)領(lǐng)公署，劃歸木蘭縣管轄。民國2年(1913年)，成立木蘭縣公署，歸黑龍江省綏蘭道管轄。民國16年(1927年)，置東興設(shè)治局，脫離木蘭縣，歸綏蘭道直轄。民國18年(1929年)，設(shè)木蘭縣、東興設(shè)治局直屬黑龍江轄治。民國二十一年(1932年)9月，日軍占領(lǐng)木蘭，建立偽縣公署，為偽黑龍江省公署管轄。1933年(偽滿大同2年)8月，撤東興設(shè)治局，建東興縣(丁等縣)。民國二十三年(1934年)木蘭、東興兩縣均劃歸濱江省轄治。1945年"八·一五"東北光復(fù)。9月6日，李兆麟將軍派抗聯(lián)將士陳德山、趙連升、何有才抵木蘭，進行建黨、建軍、建政工作。1946年2月，木蘭、東興兩縣相繼解放，分別建立民主政府。兩縣歸松江省哈北專區(qū)管轄。1947年11月，東興縣并入木蘭縣，歸松江省哈北專區(qū)管轄。

1949年，成立木蘭縣人民政府，為松江省政府直轄。1954年8月，松江省與黑龍江省合并為黑龍江省，木蘭由黑龍江省直轄。1955年，為木蘭縣人民委員會。1956年3月，木蘭縣劃歸綏化地區(qū)管轄。1958年8月，木蘭縣改屬松花江地區(qū)管轄。1960年5月，木蘭縣劃歸哈爾濱市轄。1965年6月歸松花江地區(qū)管轄。1967年7月，成立木蘭縣革命委員會成立，為松花江地區(qū)革命委員會領(lǐng)導(dǎo)。1978年11月，木蘭縣改屬松花江地區(qū)行政公署管轄。1980年9月，恢復(fù)木蘭縣人民政府。1997年，松花江地區(qū)行政公署與哈爾濱市合并，劃歸哈爾濱市管轄。

木蘭縣有"六點一線"(六點：香磨山景區(qū)、雞冠山景區(qū)、蒙古山景區(qū)、駱駝峰景區(qū)、白楊木景區(qū)、木蘭鎮(zhèn)休閑游；一線：金蘭公園沿江景觀帶)旅游發(fā)展格局。其中香磨山景區(qū)在2001年被評為國家AA級景區(qū)，駱駝砬子被定為省級森林公園。駱駝峰景區(qū)位于木蘭縣龍江鄉(xiāng)西部、石河鄉(xiāng)北部，西與巴彥龍泉鎮(zhèn)毗鄰，距縣城55公里。主峰海拔540米，東西兩峰相距1000余米，因遠望如駱駝背上的駝峰而得名。山中風(fēng)景四季各異，其古樸典雅的自然風(fēng)光和人文景觀各具特色。黑龍江省林業(yè)廳1993年正式立項，在此建立森林公園。