Western blot免疫印跡(以下簡稱WB)實驗作為檢測蛋白表達(dá)相對定量的技術(shù),在完成Western blot實驗后,得到的是蛋白條帶,還需要再對Western blot條帶進行結(jié)果處理。對于WB結(jié)果處理的過程,主要分為3個部分: 1. 用PS軟件進行排版; 2. 用image J進行灰度值分析; 3. 用prism軟件進行作圖分析。 一、 用PS對WB圖片排版 1. 打開PS軟件,如下圖需要處理β-actin蛋白和Xprotein蛋白,將WB灰度圖一起拉到PS中 :
2. 有一些條帶會出現(xiàn)傾斜的情況,會影響美觀,因此我們需要將條帶拉直至在在同一水平線上。選擇【標(biāo)尺工具】,對著WB條帶的首尾畫一條直線,接著點擊【拉直圖層】,圖片即可呈現(xiàn)水平狀態(tài)。 拉直后的wb條帶圖 拉直后的wb條帶圖 3. 在不改變臺條帶趨勢的情況下,可以對條帶進行曝光度調(diào)整(圖像-調(diào)整-曝光度);
4. 新建畫布,點擊文件-新建畫布即可新建。新建大小可以根據(jù)PS的默認(rèn)大小來新建,也可以自己自定義畫布大小。
5. 點擊【矩形選擇框工具】-選中條帶,點擊【移動工具】,點擊選中的條帶,將條帶拖至新建的畫布中(或者復(fù)制選中的條帶后,再到新建畫布中粘貼也可以)。
6. 同樣的方法,我們可以將第二個條帶或第三個條帶拖新建的畫布中,快捷方式ctrl+t可以調(diào)整圖片大小,拖動圖片使圖片條帶對齊即可。下圖的圖層1和圖層2對應(yīng)的是拉進來的2個蛋白圖。
7. 描邊。選擇對應(yīng)的蛋白條帶圖后,點擊編輯-描邊,這里選擇1像素,選擇太高像素邊框會加粗。
8. 最后標(biāo)注就可以了。點擊文字工具,可以選擇選擇橫排文具工具或者豎排文字工具,選擇合適的字體大小,再在需要標(biāo)注的單擊即可進行文字編輯。
9. 調(diào)整圖片大小,保存圖片。如圖畫布太大,可以通過裁剪工具裁掉一部分的畫布,最后通過“文件“-”儲存為“,選擇對應(yīng)的圖片格式保存圖片。
二、 灰度值分析 1. 打開image J軟件,打開以上排版好的WB圖; 2. 轉(zhuǎn)為灰度圖片:點擊image- type-8 bit 3. 設(shè)計參數(shù):點擊analysis-set measurments
4. 設(shè)計單位:點擊analysis-set scale ,選擇pixel單位
5. 分析條帶:選擇矩形選框工具,框住條帶,點擊Analysis-Gels-Selecit First Lane(或快捷鍵control +1)
6. 再次點擊Analysis-Gels-Plot Lanes(或快捷鍵control +3)
7. 封閉開口:選擇直線工具,畫下直線,將開口封住
10. 得出數(shù)據(jù):選擇魔棒工具,依次點擊各個框,即可得到相對應(yīng)的灰度值數(shù)據(jù)
11. 復(fù)制數(shù)值至excel 表格。 三、 數(shù)據(jù)分析 1. 對于我們得到的數(shù)據(jù),可以將目的蛋白的條帶數(shù)值/內(nèi)參條帶的數(shù)值,再將得出的數(shù)值以對照組數(shù)據(jù)為參考做均一化處理,即可得到表達(dá)趨勢值。 2. 我們可以將得到的數(shù)值標(biāo)注在wb條帶的下方,如果進行了3次重復(fù)實驗,也可以通過prism軟件進行數(shù)據(jù)處理,做成柱狀圖并進行統(tǒng)計學(xué)分析。對于分析方法,可以參考紐萬生物發(fā)表的《運用Graphpad prism軟件繪制柱狀圖》文章,即可做出對應(yīng)的柱狀圖和進行統(tǒng)計學(xué)分析。 |
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