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發(fā)酵應(yīng)用:合成生物學(xué)的應(yīng)用領(lǐng)域及展望

 liuherotao007 2023-05-16 發(fā)布于安徽

1. 概述

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在高科技迅猛發(fā)展的時(shí)代,合成生物技術(shù)是各領(lǐng)域中最無(wú)法忽視的一項(xiàng)新興技術(shù)。自其誕生以來(lái),其發(fā)展的速度使越來(lái)越多的科學(xué)家對(duì)其產(chǎn)生極大的研究興趣?,F(xiàn)階段合成生物技術(shù)的研究正處于較為基礎(chǔ)的階段,但是在生物科學(xué)、生物燃料、生物醫(yī)療、生態(tài)環(huán)境、生物能源等領(lǐng)域仍起到了重要的作用。
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2. 合成生物學(xué)的技術(shù)路徑

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合成生物學(xué)是生物化工產(chǎn)業(yè)鏈的底層核心技術(shù)之一。完整的生物化工全產(chǎn)業(yè)鏈有6大環(huán)節(jié),包括基因工程、菌種培育、發(fā)酵過(guò)程分離純化、改性合成和開(kāi)發(fā)應(yīng)用。因此,一個(gè)細(xì)胞就像是一個(gè)工廠。
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細(xì)胞工廠的構(gòu)建首先需要?jiǎng)?chuàng)建微生物的基因組代謝網(wǎng)絡(luò)和調(diào)控網(wǎng)絡(luò)模型,然后在此基礎(chǔ)上設(shè)計(jì)出目標(biāo)化學(xué)品的最優(yōu)合成途徑,避免其他副產(chǎn)物的競(jìng)爭(zhēng),使目標(biāo)化學(xué)品的合成途徑在熱力學(xué)上可行,合成過(guò)程能量供給充足。自然狀態(tài)下,如不摻雜人為因素,微生物合成途徑中各個(gè)酶的催化效率幾乎不可能達(dá)到非常協(xié)調(diào)的狀態(tài),催化效率慢會(huì)限制合成的速度,催化效率快會(huì)導(dǎo)致中間代謝物累積使細(xì)胞“中毒”。這些都會(huì)制約細(xì)胞工廠的生產(chǎn)速率。

因此,優(yōu)化合成途徑使其達(dá)到平衡協(xié)調(diào)的狀態(tài)這一環(huán)節(jié)至關(guān)重要。目前主要通過(guò)多基因調(diào)控技術(shù)及蛋白骨架技術(shù)來(lái)調(diào)整基因序列或者酶的順序來(lái)提升催化效率。
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DFTC2023發(fā)酵領(lǐng)域
應(yīng)用工程技術(shù)全流程分享大會(huì)

胡博士 分享內(nèi)容見(jiàn)本期次條

3. 合成生物學(xué)的主要研究領(lǐng)域

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3.1. 基因元件

基因(生物)元件 (Genetic Element)是指具有某種特定的生物學(xué)功能的DNA 或 RNA,是設(shè)計(jì)合成生物的的基本單位。其主要的特性是信號(hào)接收與輸入,信號(hào)發(fā)出和產(chǎn)物輸出功能,調(diào)節(jié)信息流、代謝與生物合成功能,與其他元件相互作用,具有特定的工作環(huán)境。它可以是功能元件也可以是界面調(diào)控元件。其中包括功能基因轉(zhuǎn)錄、蛋白質(zhì)翻譯與修飾、功能酶反應(yīng)等基因的調(diào)控。標(biāo)準(zhǔn)化的基因元件被稱為“生物磚”,是具有可連接性末端的基因元件。


3.2. 生物模塊
生物模塊 (Biological Module) 是指一組細(xì)胞內(nèi)區(qū)域化的生物器件(Biological Device),它們由內(nèi)在功能聯(lián)系在一起,執(zhí)行特定的復(fù)雜功能。細(xì)胞內(nèi)模塊往往是具有特定功能的途徑,如代謝途徑、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑、調(diào)控途徑等。其中模塊可以由“生物磚”通過(guò)某種邏輯關(guān)系構(gòu)建而成,但功能必須完全清楚。

3.3. 基因定向突變合成技術(shù)
基因突變是指 DNA 序列中堿基排列順序的變化,包括點(diǎn)突變、易位、倒置、插入、缺失等。在合成生物學(xué)的研究中,采用 PCR 技術(shù),通過(guò)序列的定向突變,可以實(shí)現(xiàn)對(duì)原始基因序列優(yōu)化,合成新的基因功能、基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)等,從而滿足生物元件的設(shè)計(jì)要求。
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 4. 合成生物生物學(xué)的應(yīng)用

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4.1. 探索生命奧秘

對(duì)于生命本質(zhì)的探索科學(xué)家們從來(lái)都是樂(lè)此不疲。合成生物技術(shù),尤其是人工合成生命的出現(xiàn),使我們對(duì)探索生命的奧秘有了突破性的進(jìn)展。現(xiàn)階段我們對(duì)生命與自然規(guī)律的了解只是九牛一毛,合成生物技術(shù)能夠由人類親自設(shè)計(jì)與組建生命,這種自下而上的研究方法與傳統(tǒng)的生物學(xué)技術(shù)研究方法是完全相反的。

4.2. 生物新能源

當(dāng)今世界不可再生能源急劇減少,“石油之戰(zhàn)”屢見(jiàn)不鮮,合成生物技術(shù)的出現(xiàn)緩解了能源短缺的情況。生物酒精(生物乙醇),是通過(guò)糧食作為原材料經(jīng)過(guò)發(fā)酵轉(zhuǎn)化為燃料。這項(xiàng)技術(shù)的出現(xiàn)使人們看到了石油可被取代的希望,生物酒精比石油的成本低出很多并且更加環(huán)保。光合藻類,是將藻類細(xì)胞通過(guò)合成生物技術(shù)提煉或分泌出油脂,從而制造柴油或者其他燃料。如果這項(xiàng)技術(shù)能夠大規(guī)模地應(yīng)用到工業(yè)生產(chǎn)當(dāng)中,那么其商業(yè)價(jià)值前景不可估量。

4.3. 醫(yī)療衛(wèi)生

合成生物技術(shù)在藥物方面最著名的就是生物合成青蒿素從而提高抗瘧疾藥物的產(chǎn)量,并且降低了成本。此前青蒿素曾被化學(xué)合成,但化學(xué)合成的成本較高,導(dǎo)致產(chǎn)量很低,很多人仍死于瘧疾,其中大部分為兒童。直到生物合成青蒿素的出現(xiàn),研究人員利用工業(yè)微生物發(fā)酵生產(chǎn)青蒿素。至此之后青蒿素的產(chǎn)量有了顯著提高。合成生物技術(shù)也有利于醫(yī)療疫苗以及醫(yī)療器械的研發(fā)與生產(chǎn)。目前主要是流感病的疫苗的研發(fā),利用合成生物技術(shù)可以快速建立病毒模型,提高病毒疫苗產(chǎn)量。

4.4. 農(nóng)業(yè)生產(chǎn)

合成生物技術(shù)在緩解全球糧食短缺方面也有著突出貢獻(xiàn)??茖W(xué)家利用合成生物技術(shù)設(shè)計(jì)出抗病害強(qiáng)的優(yōu)質(zhì)作物以及工業(yè)原料,從而提高農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的經(jīng)濟(jì)效益和環(huán)境效益。
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5. 展望

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生物合成學(xué)在材料領(lǐng)域的拓展是傳統(tǒng)觀念發(fā)酵技術(shù)的一種革新。相對(duì)于傳統(tǒng)的化學(xué)合成技術(shù),其碳排放更低,生產(chǎn)流程更短,但同時(shí)也面臨著產(chǎn)物提純和產(chǎn)業(yè)化生產(chǎn)的挑戰(zhàn)。未來(lái)新的提純技術(shù)是合成生物學(xué)興起的重要制約技術(shù),同時(shí)隨著新的基因代謝路徑的設(shè)計(jì)更多的材料將能夠通過(guò)生物合成的方式生產(chǎn)。
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