第一、第二集團(tuán)軍在山東的勝利沉重地打擊了安國軍。5月9日，閻錫山統(tǒng)率的第三集團(tuán)軍東進(jìn)占領(lǐng)石家莊、正定。11日，馮玉祥統(tǒng)率的第二集團(tuán)軍韓復(fù)榘部也北上抵達(dá)石家莊，兩軍會(huì)師。5月13日，蔣介石致電閻錫山，聲稱“今日唯一方略在速占北京”，要求閻督率所部，努力前進(jìn)。5月19日，蔣介石從徐州抵達(dá)鄭州，與馮玉祥會(huì)商進(jìn)軍京津的方略。雙方擬定：第一集團(tuán)軍沿津浦線北進(jìn)；第二集團(tuán)軍由津浦線以西、京漢線以東地區(qū)向北推進(jìn)；第三集團(tuán)軍兵分兩路，北面由京綏線向東，南面由正太線向東，轉(zhuǎn)京漢線北進(jìn)。各軍主力于5月25日之前集結(jié)待命。但是，馮玉祥認(rèn)為閻錫山曾關(guān)照過他：彰德以北的事不須管，因此，命令所部停留于石家莊、阜城、武強(qiáng)一線待命。25日，張作霖下總攻擊令，調(diào)動(dòng)兵力圍攻第三集團(tuán)軍，使孤軍深入的晉軍在定縣、清風(fēng)店一線受挫。閻錫山要求前線部隊(duì)堅(jiān)韌抵抗，并調(diào)兵增援，才轉(zhuǎn)危為安。28日，第二集團(tuán)軍攻克方順橋，迫近保定。

二次北伐開始前，桂系一直忙于征湘軍事，和程潛矛盾日深。征湘軍事結(jié)束后，桂系的部隊(duì)一直滯留在武漢及河南南部。為了動(dòng)員桂系加入北伐，5月21日，蔣介石再赴新鄉(xiāng)，同馮玉祥及北上的白崇禧會(huì)商。蔣介石當(dāng)面向白崇禧允諾，第四集團(tuán)軍的糧餉與其他各軍同等待遇，兩湖北伐部隊(duì)由白崇禧指揮。同日，李宗仁在武漢突然扣押奉命前來開會(huì)的程潛，并即致電南京國民政府，聲稱“程潛素行暴戾，好亂成性。西征后更跋扈飛揚(yáng)，把持湘政”，要求免去程潛本兼各職。桂系的這一舉動(dòng)本是為了排除異己，獨(dú)霸武漢政治分會(huì)，但蔣介石竟采取容忍態(tài)度。23日，國民黨中央政治會(huì)議作出決議，免除程潛本兼各職，著其聽候查辦。其后，李宗仁便立即宣布就任第四集團(tuán)軍總司令，并正式任命白崇禧為北伐前敵總指揮，指揮部隊(duì)北進(jìn)。26日，第四集團(tuán)軍葉琪等部抵達(dá)石家莊，加入北伐。

蔣介石在命令閻錫山加速進(jìn)軍的同時(shí)，力圖用政治手段實(shí)現(xiàn)京津易幟。

張作霖發(fā)表“停戰(zhàn)息爭”通電后，蔣介石即于5月12日密電譚延闿表示：“北方宣布停戰(zhàn)，如其果確，則中正以為可允其全部集結(jié)關(guān)外，以固?hào)|北國防。至一切國是，當(dāng)俟國民會(huì)議解決，并允奉方參加國民會(huì)議。即唯一條件，要求奉魯軍退出關(guān)外?！?/p>

同日，蔣介石又指令吳忠信和孫世偉磋商。22日，蔣介石將其擬定的“奉軍退出關(guān)外，京津由晉和平接收”的方案，電告譚延闿，在取得譚的同意后，隨即電令閻錫山進(jìn)行，限奉軍一星期內(nèi)全部退出關(guān)外。同時(shí)，又致電馮玉祥，聲稱“我方如對(duì)京津力戰(zhàn)，日必強(qiáng)加干涉”，希望馮表示贊成由閻錫山接受京津，聽候政府處置，以使敵人無從離間，加強(qiáng)內(nèi)部團(tuán)結(jié)。在北伐軍的四個(gè)集團(tuán)軍首領(lǐng)中，晉系閻錫山與日本和奉系的關(guān)系都較好，由閻執(zhí)行和平接收京津的使命，可望得到日本及奉方的諒解與合作。

為使這一方案得到北伐軍各路將領(lǐng)的贊同，蔣介石不辭辛苦，四處游說。5月27日，他與北上徐州的譚延闿進(jìn)一步敲定實(shí)施方略。29日，奔赴新鄉(xiāng)，與馮玉祥會(huì)商。兩天前，馮玉祥剛剛以第二集團(tuán)軍特別黨部的名義通電全國，聲明：“討伐張逆”，“無絲毫妥協(xié)之余地”，“如有敢持異議者，愿與國人亟起攻之?！?/p>

但是，面對(duì)以蔣介石為首的政治解決的主流，馮玉祥只得附議。二人當(dāng)即商定了進(jìn)軍部署。30日，蔣介石又馬不停蹄地趕到石家莊，與閻錫山面議。他當(dāng)面允諾，將由晉系推薦京津及河北省的行政長官。閻錫山欣然接受使命。6月2日，蔣介石風(fēng)塵仆仆地折回新鄉(xiāng)，向馮玉祥通報(bào)閻錫山?jīng)Q定受命的消息。馮玉祥眼見木已成舟，致電閻錫山稱：“萬懇以黨國為重，幸勿稍事謙抑?！?/p>

于是，閻錫山興高采烈地忙碌起來。與奉方的和平談判也由地下轉(zhuǎn)為公開。

5月28日，北伐軍根據(jù)蔣介石部署開始總攻。29日，蔣介石電令各集團(tuán)軍“于擊破當(dāng)面之?dāng)常M(jìn)抵靜海、勝芳、永清、固安、長辛店之線后，停止待命”。30日，奉軍下令總退卻。次日，蔣介石發(fā)布追擊令，敦促各軍乘機(jī)推進(jìn)。6月初，北伐各集團(tuán)軍相繼抵達(dá)京、津市郊。第一集團(tuán)軍經(jīng)滄州進(jìn)抵靜海。第二集團(tuán)軍攻克肅寧、永清、固安，進(jìn)據(jù)南苑。第三集團(tuán)軍占領(lǐng)保定后，沿京漢線開進(jìn)長辛店。各軍沿途雖與奉軍有小規(guī)模的軍事沖突，但沒有發(fā)生激烈的惡戰(zhàn)。

隨著軍事上的緩慢推進(jìn)，和平移交北京的談判進(jìn)入最后階段，閻錫山委派的國民政府代表孔繁蔚，在北京與奉方代表張學(xué)良、楊宇霆頻頻接洽。雙方議定：一、奉軍撤離北京，退往榆關(guān)，北伐軍不進(jìn)行追擊；二、成立以北洋元老王士珍為首的北京臨時(shí)治安會(huì)，主持過渡時(shí)期的政局；三、奉軍暫留鮑毓麟旅在京執(zhí)行勤務(wù)，待北伐軍入城后即行撤退，國民政府負(fù)責(zé)擔(dān)保鮑旅完璧歸奉。6月1日，譚延闿復(fù)電孔繁蔚表示：“國府議決，贊成張意”，批準(zhǔn)了雙方議定的條件。3日，譚延闿致電北京方面，內(nèi)稱：“該將領(lǐng)等深明大義，殊堪嘉尚。仰該將領(lǐng)等退出津、榆一帶，不得擾亂治安，有妨民生，一切聽候后命。至京、榆一帶，已令第三集團(tuán)總司令閻錫山辦理。”

同時(shí)，譚延闿專電楊宇霆，表示慰勉。奉方首領(lǐng)接電后，決定組織撤退。

6月4日，國奉談判再次舉行。張學(xué)良提出，請(qǐng)第三集團(tuán)軍先行入城，雙方舉行和平交接儀式，然后奉軍冠冕堂皇地撤離北京。張并要求保留河北永清、遵化等10個(gè)縣為張宗昌、褚玉璞、孫傳芳屯兵區(qū)域?？追蔽诞?dāng)然不能輕易允諾這些優(yōu)惠條件。他針鋒相對(duì)地提出：一、東三省必須懸掛青天白日旗；二、服從國民政府命令；三、直魯聯(lián)軍及孫傳芳?xì)埐勘仨毥邮芨木帯?/span>雙方相持不下，談判出現(xiàn)僵局。當(dāng)天夜晚，這一僵局便被意外的轉(zhuǎn)機(jī)打破了。張學(xué)良獲悉其父在皇姑屯遇害的消息，連夜出京，同時(shí)下令長辛店、盧溝橋一線第三、第四軍團(tuán)主力火速向?yàn)春映吠恕Ｆ浜?，北伐軍第二、第三集團(tuán)軍順利進(jìn)入京郊。

同日，京師臨時(shí)治安維持會(huì)通電各方宣告成立。6月5日，治安維持會(huì)與孔繁蔚商定，派專人赴保定歡迎閻錫山入京主持政務(wù)。8日上午，鮑毓麟旅自朝陽門撤出。稍后，第三集團(tuán)軍在前敵總指揮商震指揮下，以孫楚部為先導(dǎo)，自廣安門魚貫入城。全市高懸青天白日旗，各界均派代表前往歡迎。當(dāng)晚，維持會(huì)議決，將警廳及憲兵移交警備司令部節(jié)制。次日，該會(huì)通電宣告“解散”。

就在和平移交北京的工作即將順利完成之際，卻發(fā)生了一起意外的風(fēng)波。8日，奉軍鮑毓麟旅按照協(xié)議撤退出京，各界名流及列強(qiáng)使節(jié)均送至朝陽門外。不料，該旅行至通州，卻遭到第二集團(tuán)軍馮治安部的阻攔，被迫折回。當(dāng)日深夜，第二集團(tuán)軍以重兵包圍鮑旅。次日清晨，該集團(tuán)軍前敵總指揮韓復(fù)榘親自出馬，將鮑旅繳械。治安會(huì)聞?dòng)嵑?，派汪大燮等人前往說項(xiàng)，韓復(fù)榘僅將鮑毓麟一人放出，其他人員全部俘送南苑。

治安會(huì)再請(qǐng)商震出面斡旋，韓復(fù)榘答稱，此舉系“奉馮總司令命令”而行。消息傳到東交民巷，領(lǐng)袖公使歐登科立即偕同英、美、日三國公使，前往南苑與韓復(fù)榘當(dāng)面交涉。韓復(fù)榘矢口否認(rèn)曾接到準(zhǔn)許鮑旅安全撤退的命令。事情迅速反映到南京和閻錫山處。10日，馮玉祥電令所部開抵京津近郊的各軍，撤至固安、靜海待命。韓復(fù)榘在撤軍之前，僅將鮑旅中東北籍官兵遣返歸奉，其余則予以收編。

在二次北伐中，第二集團(tuán)軍屢經(jīng)鏖戰(zhàn)，戰(zhàn)功居各集團(tuán)軍之首，但蔣介石卻將京、津分配給閻錫山，這自然會(huì)引起第二集團(tuán)軍官兵的不滿。鮑旅事件不過是一次小小發(fā)泄的而已。

除鮑旅事件外，和平接受北京的工作大體平順。相形之下，北伐軍進(jìn)占天津要棘手得多。

盤踞在天津的殘余軍閥各懷異志，戰(zhàn)和不一。孫傳芳見大勢(shì)已去，早與閻錫山的代表南桂馨暗通聲氣，屢次公開言和。6月3日，孫通電宣布辭去安國軍副司令兼第一方面軍團(tuán)長之職，一切聽?wèi){“國民公決”。其部將李寶章、于學(xué)忠等五軍長也聯(lián)名通電罷兵；只有張宗昌依然主戰(zhàn)。6日，張宗昌登門拜訪在天津作寓公的段祺瑞，請(qǐng)其出山為首領(lǐng)，藉以號(hào)召殘兵敗將，遭到婉言“謝絕”。于是，張?jiān)僭L天津日本華北駐屯軍司令新井龜太郎，揚(yáng)言要據(jù)守天津，作最后一戰(zhàn)。

蔣介石為迅速瓦解天津殘敵，于6月8日密電馮玉祥，力促其北上一線，指揮各軍，加強(qiáng)軍事壓力。電稱：“兄如不進(jìn)，軍隊(duì)散漫，進(jìn)退不一，危險(xiǎn)萬分，弟惟有告罪，以謝黨國。”

同時(shí)，他又指令在津人員加緊策反工作。當(dāng)時(shí)，各集團(tuán)軍紛紛向天津派遣特工人員。蔣介石系統(tǒng)的盧和生、張璧，閻錫山的全權(quán)代表南桂馨，馮玉祥的特派員丁春膏均是活躍一時(shí)的人物。

在強(qiáng)大的策反攻勢(shì)下，孫傳芳?xì)埐繝幭雀膿Q門庭。鄭俊彥向第三集團(tuán)軍代表南桂馨接洽投降。閻錫山曾計(jì)劃以該部兵力接管天津，但遭到各方反對(duì)。該部又派馬寶珩為代表，赴京與閻錫山直接面洽，達(dá)成協(xié)議，將該部改編為四個(gè)軍，任命鄭俊彥為第三集團(tuán)軍第五軍團(tuán)總指揮。

與此同時(shí)，直魯聯(lián)軍內(nèi)部也發(fā)生分化。6月7日深夜，盧和生以直隸軍事特派員的身份，密見徐源泉，徐源泉同意聯(lián)合鄭俊彥等通電息爭。蔣系另一位特派員張璧與天津著名紳商聯(lián)絡(luò)，合謀推薦徐源泉擔(dān)任過渡性的保安司令，然后將政權(quán)移交晉方。張璧將此議轉(zhuǎn)告南桂馨，南表示贊同。6月10日，第六軍軍長徐源泉通電辭去直隸軍務(wù)幫辦一職，宣布就任“國民革命軍天津臨時(shí)保衛(wèi)總司令”，“暫維持天津治安”。

張宗昌自知天津難以再守，企圖以主動(dòng)讓城換取優(yōu)惠的撤軍條件。11日，張宗昌、褚玉璞派賈濟(jì)川、關(guān)麟書為代表，與晉方代表南桂馨談判。經(jīng)過激烈的討價(jià)還價(jià)，雙方終于達(dá)成直魯軍撤出天津的協(xié)議。隨后，南桂馨請(qǐng)出原安福系親日派政客姚震等人，爭取新井龜太郎贊同。南桂馨表示，主要依靠當(dāng)?shù)貞椌庸埽瑫x軍不會(huì)大批開進(jìn)天津。新井見無可挑剔，只好表示同意。次日，閻錫山將雙方協(xié)議條款，電告南京，請(qǐng)求核準(zhǔn)。該項(xiàng)協(xié)議要旨為：一、直魯軍自動(dòng)退出天津，交晉軍維持治安；二、該軍撤軍時(shí)，無論何方，不許追擊、抄襲；三、如有違約追剿者，晉方負(fù)責(zé)阻止；四、過渡時(shí)期的治安，留直魯軍一部維持，以地方民意團(tuán)體主持之。

6月12日晨，張宗昌、褚玉璞率直魯聯(lián)軍殘部撤離天津，退往蘆臺(tái)、寧河。徐源泉也通電辭職，命令所部全數(shù)撤出。同日，傅作義宣布就任天津警備司令，布告安民。不久，徐源泉接受了閻錫山改編，被任命為第三集團(tuán)軍第十一軍團(tuán)總指揮。

雖然將領(lǐng)們已協(xié)議言和，但結(jié)局仍出現(xiàn)動(dòng)亂。傅作義上任第一天，直魯殘兵持槍荷彈，四處搶劫。警察廳長常之英倉皇出逃。閻錫山應(yīng)傅作義的請(qǐng)求，命孫傳芳舊部陸殿臣、何紹南兩個(gè)旅開抵天津增援。14日，暴亂的殘兵被擊潰，退往西郊。15日，第三集團(tuán)軍第十五軍分派一個(gè)團(tuán)兵力，由北京馳赴天津，協(xié)同維持治安。16日，天津城內(nèi)秩序漸趨安定。

國民革命軍平定京津，實(shí)現(xiàn)第二期北伐的最終目標(biāo)。國民政府以勝利者的姿態(tài)向海內(nèi)外宣告北伐成功。6月12日，國民政府發(fā)表“對(duì)內(nèi)宣言”，宣布“結(jié)束軍事”，“開始訓(xùn)政”，公布“勵(lì)行法治”、“澄清吏治”、“肅清盜匪”、“蠲免苛稅”、“裁減兵額”等五大施政方針。15日，國民政府又發(fā)表“對(duì)外宣言”，宣布：“中國統(tǒng)一告成”，為“建設(shè)新國家”，對(duì)外關(guān)系應(yīng)另辟“新紀(jì)元”，解除八十余年所受的“不平等條約之束縛”，簽訂“相互尊重主權(quán)”的平等新約。

隨著京、津地區(qū)的易幟，長達(dá)十六年的北洋軍閥統(tǒng)治終于結(jié)束，南京國民政府成為全國的政治中樞，開始了國民黨一黨專政，統(tǒng)治中國的新時(shí)期。