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每日TIPS | 97.宏基因組測序(mNGS)中檢出序列數(shù)和相對豐度的意義分別是什么?

 火炎森林 2022-10-30 發(fā)布于湖北
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問:

宏基因組測序(mNGS)中檢出序列數(shù)和相對豐度的意義分別是什么?

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答:

檢出序列數(shù)(reads)是真實測到的微生物的序列條數(shù),是一個絕對值的指標,因此是檢測到該微生物最直接的體現(xiàn),更適合作為報告解讀的主要指標。

相對豐度代表該微生物在檢出的同類所有微生物中的占比,是一個相對值的指標,占比數(shù)值會受到標本中背景菌因素的影響,比如同一種微生物在不同背景菌標本中相對豐度可能會出現(xiàn)很大差別,因此建議可做報告解讀的參考但不作為主要指標。

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