今天是第2317期日報。

部分肝切除術后肝再生的腸-肝軸機制

Hepatology[IF:17.298]

① 與正常（WT）小鼠相比，IL-33或其受體ST2缺陷的小鼠接受部分肝切除術（PHx）后，其肝再生發(fā)生延遲；② PHx后12小時，WT小鼠門脈血和肝臟5-羥色胺（5HT）水平高于IL-33-/-和ST2-/-小鼠，表明5HT可能介導了IL-33的促肝再生作用；③ 特異性敲除腸嗜鉻細胞的ST2后，可降低其5HT分泌，延遲PHx后的肝再生；④ 使用5HT受體2A激動劑可使IL-33-/-和ST2-/-小鼠的肝再生恢復至正常水平；⑤ 5HT通過激活p70核糖體蛋白S6激酶（p70S6K）促進肝細胞增殖。

Interleukin-33 facilitates liver regeneration through serotonin-involved gut-liver axis
09-21, doi: 10.1002/hep.32744

【主編評語】肝再生不足會導致肝切除術后肝功能衰竭和小肝綜合征。確定新的治療靶點以增強肝臟再生能力仍然是當務之急。發(fā)表在Hepatology上的一項研究發(fā)現(xiàn)，白介素-33（IL-33）在部分肝切除術的肝再生中發(fā)揮重要作用，并闡明了其潛在的機制，表明靶向IL-33/ST2/5-羥色胺通路有可能降低肝切除術后肝衰竭和小肝綜合征的風險。（@EADGBE）

原發(fā)性硬化性膽管炎的腸道黏膜菌群特征

Hepatology[IF:17.298]

① 對84名原發(fā)性硬化性膽管炎（PSC）和51名肝移植PSC患者（PSC-LT），及40名健康對照（HC）的回結腸活檢進行16S測序；② 與HC相比，PSC和PSC-LT體內的微生物多樣性減少；③ 與PSC和HC相比，PSC-LT中變形菌的擴增更為明顯；④ 比較LT前PSC（PSC vs. HC）和LT后的PSC（對比有無PSC復發(fā)），發(fā)現(xiàn)PSC組的變異性增加；⑤ LT前后，5個屬與PSC相關，計算出生物失調指數(shù)，發(fā)現(xiàn)克雷伯氏菌的存在與無LT生存率降低相關；⑥ 伴發(fā)的IBD與Akkermansia減少相關。

A shared mucosal gut microbiota signature in primary sclerosing cholangitis before and after liver transplantation
09-03, doi: 10.1002/hep.32773

【主編評語】Hepatology近期發(fā)表的文章，發(fā)現(xiàn)無論是否進行肝移植（LT），原發(fā)性硬化性膽管炎（PSC）、PSC-IBD和疾病嚴重程度相關的回結腸黏膜菌群都保持一致。（@章臺柳）

膽管腸球菌定植與原發(fā)性硬化性膽管炎疾病進展有關

Clinical Gastroenterology and Hepatology[IF:13.576]

① 納入189例原發(fā)性硬化性膽管炎（PSC）患者，對他們的591次經內鏡逆行膽管造影術（ERCP）取得的膽汁樣本進行微生物培養(yǎng)；② 74.6%的患者膽汁中檢出細菌，多變量模型顯示，腸球菌在膽管的定植（而非其他細菌）與更高的失代償性肝硬化和/或肝移植或死亡風險相關（HR=3.61）；③ 19.6%的患者膽汁中檢出真菌，多為白色念珠菌，真菌感染與PSC疾病進展相關（HR=3.25）；④ 年齡、ERCP手術次數(shù)、肝外膽管受累、膽囊切除病史或與膽汁微生物陽性相關。

Bile duct colonization with Enterococcus sp. associates with disease progression in Primary Sclerosing Cholangitis
09-16, doi: 10.1016/j.cgh.2022.09.006

【主編評語】原發(fā)性硬化膽管炎（PSC）是一種罕見的，慢性膽管炎癥和硬化疾病，最終會導致膽管狹窄或擴張。PSC常常會導致肝硬化，顯著增加肝臟惡性腫瘤的風險。然而，目前對于PSC的發(fā)病機理尚不明確。但需要注意的是，PSC經常會與炎癥性腸?。↖BD）伴隨發(fā)生，PSC患者也表現(xiàn)有腸道菌群紊亂的表型。這些研究提示PSC與菌群的變化存在一定的關系，但是目前缺乏對于PSC患者膽管微生物的系統(tǒng)性研究。近期一篇發(fā)表在Clinical Gastroenterology and Hepatology的研究，通過對臨床獲得的189例PSC患者的591份膽汁中菌群的分析發(fā)現(xiàn)，PSC患者中腸球菌在膽管的定植與更高的肝硬化、肝移植或死亡發(fā)生的風險相關，白色念珠菌的定植則顯著升高PSC的疾病進展風險。這些研究成果為進一步探究PSC的發(fā)病機理以及臨床治療提供了重要的科學依據。（@Zhonghua）

腸道菌群宏基因組特征可預測肝硬化疾病進展

Alimentary Pharmacology and Therapeutics[IF:9.524]

① 納入25例非酒精性脂肪性肝病相關肝硬化患者，研究糞便宏基因組特征與肝硬化疾病進展間的關系；② 與代償期患者相比，失代償期患者糞菌α多樣性降低，β多樣性差異顯著；③ 13種細菌的宏基因組特征組合可用于區(qū)分代償期與非代償期患者，訓練隊列和外部驗證隊列的AUROC分別為0.97、0.95，區(qū)分能力優(yōu)于終末期肝病模型評分；④ 該組合也可預測肝硬化患者的全因死亡率，HR可達1.54；⑤ 血清與糞便中各有32種、15種代謝物與上述13種細菌相關。

Gut metagenome-derived signature predicts hepatic decompensation and mortality in NAFLD-related cirrhosis
09-26, doi: 10.1111/apt.17236

【主編評語】非酒精性脂肪性肝?。∟ALFD）進展到終末階段常表現(xiàn)為失代償期肝硬化，與肝癌和較高的死亡率有關。腸-肝軸與NALFD、肝硬化發(fā)病相關。腸道菌群是肝病分期、預后及干預的非侵入性生物標志物的潛在來源。近期，Alimentary Pharmacology and Therapeutics發(fā)表研究文章，鑒定出糞便中13種細菌的宏基因組特征可用于NALFD相關肝硬化的失代償期診斷，具有較高的準確性，并可預測NALFD相關肝硬化的死亡風險。（@芥末）

國內團隊：膽囊切除術會誘導膽汁酸代謝調節(jié)免疫細胞改善IBD

Gut Microbes[IF:9.434]

① 通過膽囊切除術（PC）探究其對IBD小鼠的影響及其病理機制，還評估了PC患者糞便膽汁酸（BAs）、粘膜菌群和免疫細胞間的關聯(lián)；② PC處理可改善DSS誘導的小鼠結腸炎，加速粘膜修復，通過增加BAs代謝種類的豐度提升次級BAs濃度；③ PC引起的次級BAs（如LCA、DCA和HDCA）積累通過抑制單核細胞/巨噬細胞的招募改善IBD，這可能通過激活LXRα相關通路發(fā)揮作用；④ 在PC患者中發(fā)現(xiàn)調節(jié)免疫作用的物種和次級BAs濃度增加，且與外周單核細胞水平負相關。

Cholecystectomy-induced secondary bile acids accumulation ameliorates colitis through inhibiting monocyte/macrophage recruitment
09-01, doi: 10.1080/19490976.2022.2107387

【主編評語】膽囊切除術（PC）是膽道外科常用的手術，部分患者術后會伴有胃腸道并發(fā)癥和較高患結直腸癌的風險，但患炎癥性腸病的風險并沒有顯著增加。近日，北京大學人民醫(yī)院劉玉蘭及團隊在Gut Microbes發(fā)表最新研究，探究膽囊切除后對結腸炎小鼠的影響，以及PC患者糞便膽汁酸、粘膜菌群和免疫細胞間的關聯(lián)，發(fā)現(xiàn)PC引起的次級膽汁酸積累通過抑制單核細胞/巨噬細胞的招募改善結腸炎，可能與激活LXRα相關通路有關。未來仍需進一步驗證膽囊切除術與緩解結腸炎的潛在機制，值得關注。（@九卿臣）

西北農林：褪黑素通過腸道菌群緩解衰老引發(fā)的肝臟脂代謝異常

Cellular and Molecular Life Sciences[IF:9.207]

① 與年輕小鼠相比，衰老小鼠血清褪黑素水平下降，肝臟脂肪積累增加；② 衰老小鼠腸道內空腸彎曲桿菌（C. jejuni）增加，介導更多的?；切苋パ跄懰幔═UDCA）降解為?；蛆Z去氧膽酸（TCDCA）；③ TCDCA作用于肝臟的FXR受體而增加氧化三甲胺（TMAO）生成，TMAO通過PERK/ATF4通路促進SREBP1轉錄，引起肝臟脂肪積累；④ 口服補充褪黑素可減少衰老小鼠腸道內的C. jejuni，抑制TUDCA降解，阻止TCDCA激活肝臟FXR而抑制SREBP1轉錄，緩解肝臟脂肪積累。

Melatonin relieves hepatic lipid dysmetabolism caused by aging via modifying the secondary bile acid pattern of gut microbes
09-23, doi: 10.1007/s00018-022-04412-0

【主編評語】由研究表明，衰老個體的腸道菌群對腸道內次級膽汁酸成分的影響可能與導致肝臟脂質代謝異常的原因之一。褪黑素被認為具有抗衰老作用，那么它是否能夠通過塑造腸道菌群結構來改善衰老引起的脂代謝異常呢 ？近日，西北農林科技大學孫超團隊在Cellular and Molecular Life Sciences發(fā)表研究文章，報道了口服褪黑素通過降低空腸彎曲桿菌豐度調節(jié)腸道膽汁酸譜并改善衰老引起的肝臟脂肪積累的現(xiàn)象及其分子機制。（@芥末）

國內團隊：人參皂苷Rg1如何緩解酒精性肝損傷？

Oxidative Medicine and Cellular Longevity[IF:7.31]

① 網絡分析發(fā)現(xiàn)人參皂苷Rg1（GRg1）與酒精性肝病存在11個共同靶點，與TLR和NF-κB信號通路密切相關；② 構建動物模型，發(fā)現(xiàn)GRg1對酒精肝損傷有保護作用，可減輕小鼠肝臟病理損傷和抗氧化水平；③ GRg1通過抑制LPS/TLR/NF-κB通路改善肝臟炎癥，促進緊密連接蛋白和lgA表達增強腸道屏障；④ GRg1可調節(jié)腸道菌群紊亂，阿克曼菌屬、毛螺菌科等菌群與腸屏障指標正相關，與肝臟炎癥標志物負相關；⑤ GRg1可能是一種有前途的保護酒精誘導肝損傷的策略。

Hepatoprotective Mechanism of Ginsenoside Rg1 against Alcoholic Liver Damage Based on Gut Microbiota and Network Pharmacology
08-23, doi: 10.1155/2022/5025237

【主編評語】人參皂苷Rg1（GRg1）作為中國傳統(tǒng)中藥材人參和三七中的主要活性成分，具有抗炎癥、抗氧化、抗凋亡、脂質調節(jié)和降低血糖等作用，先前研究發(fā)現(xiàn)，人參皂苷Rg1對糖尿病、腎病、脂肪肝等有一定緩解作用，但對酒精性肝病的保護作用仍未被充分探究。近日，天津科技大學王敏、江蘇大學特肖建波及團隊在Oxidative Medicine and Cellular Longevity發(fā)表最新研究，發(fā)現(xiàn)GRg1緩解酒精性肝病有益作用和調節(jié)腸道菌群結構及NF-κB信號通路密切相關?？傊?，該研究為未來開發(fā)中藥材活性成分干預酒精性肝病奠定了基礎。（@九卿臣）

辛鳳姣團隊：多形擬桿菌谷氨酸脫羧酶的pH調控機制

Food Chemistry[IF:9.231]

① 重組多形擬桿菌谷氨酸脫羧酶（BTGAD）的最適反應條件為60°C和pH 3.6，且僅在酸性條件下有活性；② BTGAD包含N端域、磷酸吡哆醛結合域（PBD）和C端域，PBD中包含一個β發(fā)夾結構的催化基序；③ 中性條件下，C末端序列（CTS）成環(huán)并伸入活性中心，同時催化基序呈“敞開”構象，且其上的H471占據底物結合位置；④ 酸性條件下BTGAD以六聚體存在，N末端序列成環(huán)而CTS無序，底物結合抑制解除，且催化基序呈利于底物進入和產物釋放的“閉合”構象。

Coordinated regulation of Bacteroides thetaiotaomicron glutamate decarboxylase activity by multiple elements under different pH
09-28, doi: 10.1016/j.foodchem.2022.134436

【主編評語】谷氨酸脫羧酶（GAD）是一種磷酸吡哆醛（PLP）依賴性酶，廣泛存在于自然界的動植物和微生物中。GAD在酸性環(huán)境下發(fā)生結構變化，不可逆地催化L-谷氨酸或谷氨酸鹽α-脫羧生成γ-氨基丁酸（GABA）。GABA作為中樞神經系統(tǒng)的主要抑制性神經遞質，在大腦和行為中起著至關重要的作用。目前，腸道細菌中僅大腸桿菌來源GAD（EcGAD）的活性調控機制進行了較為全面的研究。鑒于腸道細菌的多樣性及對宿主的重要性，探究不同來源腸道微生物GAD的活性調控機制對進一步了解腸道微生物的谷氨酸代謝在腸-腦軸及調節(jié)宿主穩(wěn)態(tài)中的作用具有重要意義。來自中國農業(yè)科學院農產品加工研究所的辛鳳姣團隊發(fā)表在Food Chemistry上的一項研究首次闡明了多形擬桿菌來源GAD酶學特征和不同于其他腸道細菌來源GAD的pH調控機制，為研究腸道細菌GAD在腸-腦軸的生理重要性提供了理論基礎。（@EADGBE）

王煒等：如何有效評估芽孢活力？新方法助力洞察萌芽過程

Gut Microbes[IF:9.434]

① 利用熒光染料FITC和馬來酰亞胺標記細菌芽孢，并實現(xiàn)腸道產芽孢菌群生孢過程的體內檢測；② 基于FDAA標記定量和成像分析枯草芽孢桿菌和腸道菌群芽孢體內和體外萌芽；③ 用于評估不同萌芽劑對腸道內芽孢萌芽的刺激作用；④ 通過流式分選術（FACS）篩選腸道萌芽芽孢，并結合16S測序和熒光原位雜交技術進行菌群鑒定。

Visualizing germination of microbiota endospores in the mammalian gut
09-29, doi: 10.1080/19490976.2022.2125737

【主編評語】細菌芽孢是一種特殊的生命形態(tài)，能夠耐受高溫、紫外線及多種化學物質殺滅。芽孢在宿主及宿主與環(huán)境之間的傳播對于致病菌感染（如艱難梭菌）和維持腸道穩(wěn)態(tài)(如枯草芽孢桿菌)至關重要，但是目前缺少有效手段檢測芽孢在體萌芽過程。上海交通大學醫(yī)學院分子醫(yī)學研究院的楊朝勇、王煒團隊在Gut Microbes發(fā)表了最新研究，基于序貫標記策略開發(fā)了直接評估芽孢體內萌芽的新方法。（@熱心腸小伙伴們）

王煒等：共聚焦成像聯(lián)手單細胞測序，如何解析復雜的微生物樣品？

mLife[IF:N/A]

① 提出一種FLCiSS策略，將熒光探針標記、共聚焦成像與單細胞分選和測序相結合，允許在單細胞基礎上綜合獲取腸道細菌的生長/分裂模式和基因組信息；② 首先通過共聚焦顯微鏡對小鼠體內由兩個熒光D-氨基酸探針依次標記的腸道細菌成像，可視化其生長模式；③ 然后使用激光噴射設備對載玻片上感興趣的細菌分類，通過單獨測序識別其分類群，根據細菌標記模式和形態(tài)共挑選出210個細菌（鑒定出59個）；④ FLCiSS也可用于獲得較高質量的單細菌基因組。

Integrated identification of growth pattern and taxon of bacterium in gut microbiota via confocal fluorescence imaging-oriented single-cell sequencing
09-26, doi: 10.1002/mlf2.12041

【主編評語】單細胞測序技術已被用于腸道菌群等復雜微生物樣本的研究，但目前，仍很難將細菌的基因組信息與顯微成像觀察到的細菌表型信息有機結合，深入揭示其生物學機制。近日，上海交通大學楊朝勇、王煒及團隊在mLife發(fā)表最新研究，開發(fā)了一種FLCiSS策略。該策略基于共聚焦熒光成像和單細菌挑選測序方法，通過共聚焦特異熒光信息可對復雜樣本中的細菌直接挑選和測序，獲取其分類學信息。總之，該策略的開發(fā)普適性較好，有利于促進各類復雜細菌樣本的深入挖掘，值得關注。（@九卿臣）