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攻克生物演化領(lǐng)域百年難題,北大團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)枯葉蛺蝶的演化秘密,為生物多樣性研究提供新視角

 江海博覽 2022-09-03 發(fā)布于浙江

詩人楊萬里眼中的蝴蝶,是“飛入菜花無處尋”;畫家梵高眼中的蝴蝶,是一副后印象派風(fēng)景畫。


圖片圖 | 梵高畫作《兩只白蝴蝶》(來源:資料圖)


而在科學(xué)家眼里,蝴蝶則是數(shù)十萬年演化所留下痕跡的載體。近日,北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院&北大-清華生命科學(xué)聯(lián)合中心張蔚研究員,揭示了枯葉蛺蝶的演化史、以及相關(guān)遺傳基礎(chǔ)。


這給生物多樣性的研究提供了新理論和新范式,為理解地理變化和自然驅(qū)動(dòng)的演化帶來了全新視角,拓展了人類的知識(shí)邊界。近日,相關(guān)論文以封面文章的形式發(fā)表在 Cell 上。


圖片圖 | 張蔚(來源:張蔚


談及初心,張蔚表示:“想要研究枯葉蛺蝶,也是我回到中國建立獨(dú)立實(shí)驗(yàn)室和開展研究的重要原因之一?!?/span>


此次研究里,她建立了一個(gè)聚焦枯葉蛺蝶的新型研究體系,可用于探索和研究關(guān)于生物演化的問題,包括物種多樣性、遺傳多樣性、適應(yīng)性演化等。


圖片(來源:張蔚實(shí)驗(yàn)室)


枯葉蛺蝶是一類著名的擬葉偽裝的生物,很早之前就被人們認(rèn)識(shí)和發(fā)現(xiàn)。

例如,與達(dá)爾文共同提出自然選擇理論的英國演化生物學(xué)先驅(qū)阿爾弗雷德·拉塞爾·華萊士(Alfred Russel Wallace),就評(píng)價(jià)它們是“蝴蝶中最美妙和毫無疑問的保護(hù)性偽裝”。


如果把蝶翅分為背腹兩面,這類蝴蝶的翅背面具有對(duì)比明顯的斑塊花紋。張蔚推測這可能是為了便于求偶,也可能是用于警示天敵,但還有待于進(jìn)一步研究。

而根據(jù)它們的習(xí)性,多數(shù)時(shí)候其蝶翅呈現(xiàn)閉合狀態(tài),翅腹面具備擬葉形的表型。其上的花紋結(jié)構(gòu)非常精細(xì),具備葉柄、中脈、次脈、甚至是霉斑,這些表型可能受到了自然選擇的驅(qū)動(dòng)。


需要注意的是,精妙的花紋結(jié)構(gòu)并不是蝴蝶“主動(dòng)”形成的,而是被施加選擇壓力后的被動(dòng)演化結(jié)局。因此,采用該團(tuán)隊(duì)的體系,可分別用于研究翅背腹面受到不同選擇壓力下的表型演化。

圖片

圖丨Cell 當(dāng)期封面枯葉與蝶(來源:張蔚

研究中,其采用宏觀演化和微觀演化結(jié)合的研究視角,厘清了枯葉蛺蝶屬物種的演化歷史,這能給研究它們的適應(yīng)性演化、以及物種關(guān)系打下基礎(chǔ)。此外,張蔚還研究了蝶翅腹面的葉形擬態(tài)的遺傳機(jī)制。


期間,她和團(tuán)隊(duì)解析了枯葉蛺蝶屬的物種多樣性、以及遺傳多樣性的起源演化。結(jié)果發(fā)現(xiàn),喜馬拉雅東部這一山地的生物多樣性熱點(diǎn)地區(qū),是枯葉蛺蝶屬物種的分化中心。


而葉形擬態(tài)的多態(tài)性,受到單基因 
cortex 的控制。它是一個(gè)工具盒基因,在蝴蝶翅的發(fā)育過程中起著重要作用。

張蔚還發(fā)現(xiàn)在枯葉蛺蝶屬里,這種葉形多態(tài)性經(jīng)受過長期的平衡選擇。同時(shí),cortex 基因也是自然選擇施加壓力的一個(gè)熱點(diǎn),在以往多個(gè)著名的演化生物學(xué)研究體系發(fā)揮過作用。


例如,其參與控制了樺尺蠖的工業(yè)黑化、以及袖蝶的穆氏擬態(tài)的警戒色。而本次研究中,張蔚發(fā)現(xiàn) cortex 基因也能控制枯葉蛺蝶的葉形擬態(tài)多態(tài)性。


期間,她和團(tuán)隊(duì)一共發(fā)現(xiàn) cortex 基因的 5 種等位基因,并發(fā)現(xiàn)它們至少參與產(chǎn)生 10 種不同的擬葉表型。由于長期的平衡選擇,這些擬葉的表型被維持在枯葉蛺蝶屬內(nèi)的多個(gè)物種中。


值得注意的是,這是一個(gè)罕見的、長期平衡選擇的案例。一般來說,平衡選擇多見于物種以下水平,同時(shí)這可能會(huì)帶來遺傳負(fù)荷,進(jìn)而給種群造成壓力。


但對(duì)于枯葉蛺蝶來說,具有豐富的擬態(tài)表型可謂利大于弊,也能讓其“偽裝”得更自然。試想一下,如果葉形表型千篇一律,很容易拉高偽裝的“穿幫”風(fēng)險(xiǎn)。


總體而言,該研究揭示了枯葉蛺蝶屬的生物多樣性起源與演化、以及山地生物多樣性熱點(diǎn)地區(qū)在它們演化中扮演的角色。課題組還提出了如下創(chuàng)新理論:即地理變化和自然選擇共同驅(qū)動(dòng)著復(fù)雜的演化。同時(shí),該研究也揭示了發(fā)育保守性以及可演化性的耦合機(jī)制。

近日,相關(guān)論文以《枯葉蛺蝶的演化與分化》(The evolution and diversification of oakleaf butterflies)為題,發(fā)表在 Cell 上。北京大學(xué)前沿交叉學(xué)科研究院博士生王姝婷、北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院博士生滕德群、中科院昆明動(dòng)物研究所李學(xué)燕副研究員為共同第一作者,張蔚擔(dān)任通訊作者[1]。

圖片

(來源:Cell


審稿人表示,研究人員建立了一個(gè)以枯葉蛺蝶為模式的比較基因組學(xué)研究模型,該模型很有魅力、且令人信服,充分展示了自然選擇塑造精致的偽裝細(xì)節(jié)的力量。并稱贊該團(tuán)隊(duì)部署了一個(gè)令人印象深刻的基因組工具庫來探索演化歷史。

還有一位審稿人表示:“總的來說這篇論文給人感覺非常完整,講述了一個(gè)引人注目的故事,涉及到頻率依賴的負(fù)選擇、以及不同表型的演化和維持?!?/span>

在論文發(fā)表的當(dāng)天,張蔚收到一位英國同行的郵件(該同行曾領(lǐng)導(dǎo)過一項(xiàng)解析樺尺蠖工業(yè)黑化遺傳機(jī)制的研究)。他在郵件中說道:“感謝你的這一引人入勝的工作。一幅關(guān)于控制鱗翅目昆蟲翅型多態(tài)性的幾個(gè)主要遺傳開關(guān),在漫長和短暫的時(shí)間跨度中被反復(fù)招募的畫面正在逐漸出現(xiàn)。”

圖片

一個(gè)靈光乍現(xiàn)的想法成為現(xiàn)實(shí)

據(jù)介紹,該研究的萌芽可回溯到 2015 年。當(dāng)時(shí),張蔚在芝加哥大學(xué)生態(tài)與演化系做博后研究,其導(dǎo)師馬庫斯·克朗福斯特(Marcus Kronforst)教授是蝴蝶領(lǐng)域的專家。


當(dāng)時(shí),張蔚主要研究玉帶鳳蝶、及其相關(guān)的近緣鳳蝶物種,但更多聚焦在南美袖蝶屬。她對(duì)蝴蝶研究很感興趣,不僅會(huì)閱讀最新文獻(xiàn),也經(jīng)常閱讀經(jīng)典著作。


其表示:“有一天我在讀華萊士的一本書《Mimicry, and other protective resemblances among animals》,這本書介紹了他所見過的各種具備保護(hù)性偽裝能力的動(dòng)物及其特征。我讀到了他對(duì)枯葉蝶的一段描述:'但在我所見過的蝴蝶中,最奇妙、最無可置疑的保護(hù)性相似案例是常見的枯葉蛺蝶和與它同屬的爪哇枯葉蛺蝶”。


華萊士花費(fèi)很大篇幅,來記錄枯葉蛺蝶屬物種留給他的深刻印象。當(dāng)張蔚看到“從來沒有人看到它們棲息在花朵或綠葉上,但它們很多次在灌木叢或枯葉樹中消失不見”這段描述,她想起自己曾在枯葉蛺蝶中華亞種的產(chǎn)地之一——四川樂山,試圖尋找過它們的蹤跡,但卻并未找到。


后來,她終于找到枯葉蛺蝶的標(biāo)本。觀察之后,她確信自己找到了很好的研究體系,即使用枯葉蛺蝶的翅的兩面,來分別研究不同選擇壓力驅(qū)動(dòng)下的表型演化。


“我把這個(gè)想法分享給導(dǎo)師 Marcus、以及和我同系的著名華人演化生物學(xué)家龍漫遠(yuǎn)教授,他們都表示支持。我迫切地想要研究枯葉蛺蝶,但前提是得飼養(yǎng)和采集?!?a data-miniprogram-appid='wx99cc64e6169731cc' data-miniprogram-path='pages/professor-detail/index?personage_id=6117' data-miniprogram-nickname='絡(luò)繹科學(xué)' data-miniprogram-type='text' data-miniprogram-servicetype='' href=''>張蔚說。


由于蝴蝶是變態(tài)發(fā)育的昆蟲,幼蟲期的枯葉蛺蝶的食物,是特定的爵床科寄主植物。它們不像是張蔚當(dāng)時(shí)研究的玉帶鳳蝶,雖然這種蝴蝶棲息地也是在亞洲,但是它的寄主柑橘類植物,卻很容易在北美獲取。而要在北美地區(qū)飼養(yǎng)和研究枯葉蛺蝶,并獲取它們的寄主植物,可謂非常困難。


事實(shí)上,一直以來針對(duì)非模式生物開展研究,都面臨著諸多困難。由于很少有科研團(tuán)隊(duì)研究它,一些經(jīng)驗(yàn)和技術(shù)只能靠張蔚自己摸索。早期,到哪里采集枯葉蛺蝶和寄主植物?如何飼養(yǎng)?如何開展實(shí)驗(yàn)操作?都是她和團(tuán)隊(duì)經(jīng)常遇到的難題。


盡管如此,枯葉蛺蝶最讓張蔚著迷的地方,莫過于通過研究它們、來試圖回答科學(xué)問題的過程。


她說:“幸運(yùn)的是,有很多志同道合的合作者加入了我們,讓枯葉蛺蝶作為模式動(dòng)物成為可能。團(tuán)隊(duì)里,有具備幾十年豐富野外蝴蝶調(diào)查經(jīng)驗(yàn)的老師,有在蝴蝶中開展遺傳發(fā)育研究的老師,也有在野外和實(shí)驗(yàn)室堅(jiān)持工作數(shù)年如一日的同學(xué)們,大家毫無保留地交流,讓源于 8 年前的一個(gè)靈光乍現(xiàn)的想法成為現(xiàn)實(shí)?!?/span>


圖片(來源:Cell

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無限風(fēng)光在險(xiǎn)峰

研究期間,有三個(gè)讓張蔚印象深刻的故事。


其一是枯葉蛺蝶屬物種的故事。


枯葉蛺蝶屬里存在多個(gè)物種,有些物種里還存在亞種水平的分化。在樣本采集初期,張蔚并未完全掌握這些情況。她甚至發(fā)現(xiàn),同一個(gè)物種竟然具有不同的異名。究其原因,這是不同團(tuán)隊(duì)在不同地區(qū)采集到同一物種后,分別進(jìn)行研究和命名之后,所遺留的歷史問題。


對(duì)于該課題組的成員們來說,他們的知識(shí)體系并不完全相同,一開始大家用不同的名字稱呼同一物種,交流討論一度面臨困難。隨著對(duì)蝴蝶的深入了解,并在獲得更全面的遺傳信息后。他們才意識(shí)到該問題的存在,并將其予以糾正。


其二是野外工作的故事。


在采集枯葉蛺蝶屬物種的樣本時(shí),課題組去過多個(gè)采集地點(diǎn)。在大部分采集點(diǎn),都會(huì)采集到單個(gè)枯葉蛺蝶屬的物種。而這也是枯葉蛺蝶屬的物種留給他們的第一印象。


當(dāng)他們?cè)谖鞑刈灾螀^(qū)墨脫縣進(jìn)行采集時(shí),遇見一則“例外”。他們采集了多個(gè)枯葉蛺蝶屬物種的樣本,當(dāng)時(shí)以為是和其它地區(qū)的采集樣本弄混了。后來,通過基因組遺傳結(jié)構(gòu)分析,才弄清楚它們的種群結(jié)構(gòu),進(jìn)而確認(rèn)它們是來自墨脫的樣品。


“借此我們提出假設(shè),即墨脫縣所在的喜馬拉雅東部地區(qū),可能是枯葉蛺蝶屬物種的分化中心、亦或者是它們?cè)诒诘?避難所’。而我們后來的研究證據(jù),支持了前一個(gè)假設(shè)。這說明喜馬拉雅東部的山地生物多樣性熱點(diǎn)地區(qū),在生物多樣性中發(fā)揮了重要作用?!?a data-miniprogram-appid='wx99cc64e6169731cc' data-miniprogram-path='pages/professor-detail/index?personage_id=6117' data-miniprogram-nickname='絡(luò)繹科學(xué)' data-miniprogram-type='text' data-miniprogram-servicetype='' href=''>張蔚表示。


其三是在實(shí)驗(yàn)室發(fā)現(xiàn)葉形擬態(tài)多態(tài)性的故事。


研究非模式生物,必須充分地了解它們。不僅是到野外真實(shí)生境中采集,還要對(duì)其開展實(shí)驗(yàn)操作。


其間,偶然和必然共存,不僅得有耐心,還得保持觀察和發(fā)現(xiàn)。課題組發(fā)現(xiàn),北京的地上環(huán)境,并不利于蝴蝶的生長繁殖,而地下二層則能保持相對(duì)穩(wěn)定的溫度和濕度,更接近于蝴蝶的天然生境。


由于場地限制,該團(tuán)隊(duì)在實(shí)驗(yàn)樓的地下二層,改建出一個(gè)蝴蝶飼養(yǎng)室。他們頂著飼養(yǎng)室的悶熱難耐,在完全的人工環(huán)境下飼養(yǎng)出了枯葉蛺蝶的中華亞種,借此發(fā)現(xiàn)了多種葉形的表型。


接著,又選出具有特定表型的個(gè)體,以便進(jìn)行家系實(shí)驗(yàn)。后來,他們發(fā)現(xiàn)了枯葉蛺蝶子代中的性狀分離。


說到這里張蔚表示:“要養(yǎng)大這些個(gè)體絕非易事,枯葉蛺蝶的食量巨大,飼養(yǎng)的單只幼蟲,可能就要吃掉幾十株寄主植物的幼苗。因此,我們還得飼養(yǎng)大量的寄主植物,以便給枯葉蛺蝶作為食物?!?/span>


接下來,他們逐漸確認(rèn)了如下結(jié)論:即多態(tài)表型均由單個(gè)孟德爾基因座控制。借此其推斷認(rèn)為:有 5 種等位基因在控制著這 10 種表型。


再后來,通過全基因組的關(guān)聯(lián)分析、以及個(gè)體基因組的組裝,課題組將單基因和它的 5 種單倍型基因的存在,全部予以確認(rèn)。


而后,要進(jìn)行基因編輯的功能鑒定。在發(fā)育過程中,這一單基因承擔(dān)著重要作用,“出了名”地難以被敲除。因此,即便完成單個(gè)的實(shí)驗(yàn),也得耗時(shí)幾個(gè)月。


可以說,對(duì)非模式生物開展實(shí)驗(yàn)研究,要想獲得有意思的發(fā)現(xiàn),往往要付出更多“(而)我把它們作為故事講出來,希望能與大家在科學(xué)研究中共勉,這彷佛是一個(gè)攀登的過程,無限風(fēng)光在險(xiǎn)峰,充滿了挑戰(zhàn)和驚喜?!?a data-miniprogram-appid='wx99cc64e6169731cc' data-miniprogram-path='pages/professor-detail/index?personage_id=6117' data-miniprogram-nickname='絡(luò)繹科學(xué)' data-miniprogram-type='text' data-miniprogram-servicetype='' href=''>張蔚說。


盡管是基礎(chǔ)研究,但是張蔚還是列舉了一個(gè)直接應(yīng)用案例。她說:“我在博后階段參與的關(guān)于玉帶鳳蝶的研究論文于 2014 年發(fā)表,后來陸續(xù)被收錄在兩本經(jīng)典教科書里[2]。我希望這些關(guān)于蝴蝶的研究,可以作為生動(dòng)形象的載體,幫助學(xué)生們了解相關(guān)知識(shí)體系的框架,如果能激發(fā)他們的研究興趣就更好了?!?/span>


如上所述,此篇論文解鎖了新的研究體系。采用該研究體系,可以研究很多演化生物學(xué)問題。如果將枯葉蛺蝶作為一個(gè)研究體系,該研究只是一個(gè)開始,未來還需接受時(shí)間的檢驗(yàn),以及更多后續(xù)研究的互相支撐。


此外,組成擬態(tài)表型的機(jī)制也大有玄機(jī),不僅有已被解析到的色素色的可遺傳多態(tài)性,結(jié)構(gòu)色和表觀因素也會(huì)對(duì)葉形表型產(chǎn)生影響,而這些都只局限于枯葉蛺蝶的翅腹面。


目前,枯葉蛺蝶翅背面的花紋起源演化、翅背腹面不對(duì)稱的調(diào)控機(jī)制等,都是未知因素。而每一個(gè)科學(xué)問題都可能產(chǎn)生諸多分支,這也充分體現(xiàn)了枯葉蛺蝶作為研究體系的魅力。


因此,關(guān)于葉形擬態(tài)多態(tài)性的研究遠(yuǎn)未結(jié)束。這些多樣的擬葉表型,在不同枯葉蛺蝶屬物種的分布頻率各不相同,很可能是由于不同棲息地的植被特征導(dǎo)致的。關(guān)于此,張蔚目前仍在深入研究。

參考資料:
1.Wang, S., Teng, D., Li, X., Yang, P., Da, W., Zhang, Y., ... & Zhang, W. (2022). The evolution and diversification of oakleaf butterflies. Cell.
2.An Introduction to Molecular Evolution and Phylogenetics, Second Edition和Genetics: From Genes to Genomes (Hartwell), Sixth Edition

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