OpenBabel和RDKit作為常用的化學(xué)信息學(xué)工具很受青睞,為了防止和其他項(xiàng)目的沖突,將他們單獨(dú)創(chuàng)建在同一個(gè)Python環(huán)境。 一、安裝Anaconda或Miniconda Win或者Linux系統(tǒng)下Anaconda或Miniconda安裝,不贅述,網(wǎng)上很多教程。 二、創(chuàng)建Python3.x虛擬環(huán)境 #創(chuàng)建虛擬環(huán)境 conda create -n pydd36 python=3.6 conda #激活虛擬環(huán)境 source activate pydd36 #包安裝命令 conda install ipython (其他包安裝,激活環(huán)境后安裝) 三、測(cè)試環(huán)境#激活環(huán)境運(yùn)行IPython source activate pydd36 ipython #導(dǎo)入openbabel和RDKit import openbabel, pybel from rdkit import Chem from rdkit.Chem import AllChem |
|
來(lái)自: DrugAI > 《待分類(lèi)》