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你想干啥?讓「TBtools」猜一猜

 生信藥丸 2022-01-13

寫在前面

今天是學(xué)校放假的第一天,原本我應(yīng)該是在回家?guī)薜穆飞?,但之前訂票時沒考慮到原來寒假已經(jīng)到了,于是定的是周五晚上的票。Emmm,最近或者出差,或者趕趕項目,或者寫寫論文。尤其今天,工作狀態(tài)一般,總之就是摸魚的一天。
看了看時間,也快晚上了,老鐵說還是要推一個新稿子。想了下子,那就推之前已經(jīng)出來的特性。

應(yīng)用場景

很多時候,我們大概知道自己想干啥,比如用 TBtools 提取 Fasta 序列,或者用 TBtools 提取表格信息,或者用 TBtools 繪制熱圖等。于是我們手上往往會有輸入文件,比如一個 Fasta 文件。那么正常的步驟是:

  1. 打開 TBtools

  2. 找到 TBtools Fasta 序列提取功能

  3. 點擊進去

  4. 開始分析

其中,尤其是第2步,在我們不斷使用 TBtools 的過程中就會發(fā)現(xiàn),高頻的功能就那么多。于是我突然想到一個有趣的事情,讓 TBtools 依據(jù)你的輸入文件格式,自動判斷你到底想干啥,然后給你幾個候選功能,直接點擊就行。

具體使用

(當(dāng)然,你需要更新到 TBtools 最新版本),上述步驟簡化為:

  1. 打開 TBtools

  2. 拖拽放置文件到 About Panel

  3. 在彈出的菜單中選擇 Fasta Extract

  4. 開始分析

換句話說,你都不用找菜單功能,TBtools 直接推薦給你了。

數(shù)個實例

如果你拖拽放置的是 Fasta 序列格式文件,那么可以 提取、統(tǒng)計、簡化、預(yù)覽等

如果你拖拽放置的是 GFF3或者GTF文件,那么可以 提取、統(tǒng)計、基因結(jié)構(gòu)可視化等

如果你拖拽放置的是表格信息文件,如注釋信息,那么可以提取,合并,追加等

如果你拖拽放置的是數(shù)值矩陣,如基因表達量等,那么可以 PCA分析 或 繪制熱圖 等

寫在最后

Emmm,小小改進,更加便利。

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