問 腫瘤突變負荷(TMB)與免疫治療的關系? 答 大多數(shù)腫瘤細胞中TMB越高,產(chǎn)生新抗原越多,腫瘤免疫原性也就越高。因此從PD-1/PD-L1免疫檢查點抑制劑ICIs治療中的獲益越明顯。 2017年,約翰·霍普金斯大學Elizabeth Marion Jaffee教授在分析了多個臨床研究數(shù)據(jù)后,在新英格蘭醫(yī)學雜志發(fā)表了繪制了27種腫瘤的中ICIs與TMB治療的客觀緩解率(ORR)之間的線性圖,經(jīng)過研究發(fā)現(xiàn)了TMB與ORR存在顯著的正相關性(P<0.001),相關系數(shù)為0.74。說一結果說明了這27種腫瘤中,TMB能夠預測ICIs的治療療效。基于這一研究成果,目前TMB指標也成為國內(nèi)外多個指南推薦的免疫治療預測指標。 問 TMB-H患者未經(jīng)免疫抑制劑治療預后? 答 多種癌癥類型中,接受ICIs治療的患者,高TMB與較高TMB的治療應答率和較長的生存期相關。經(jīng)過MSK上發(fā)表的一組IMPACT數(shù)據(jù)分析,該項研究分析了17個癌種的10233名未經(jīng)ICIs治療的患者,然后發(fā)現(xiàn)高TMB的患者在不同癌種中與患者生存預后關系有區(qū)別。針對MSI-H概率高的子宮內(nèi)膜癌、結直腸癌和膀胱癌患者,不論是否接受ICIs治療,高TMB始終都和更長的總生存期相關聯(lián),危險幾率(HR)相對較低,預后也良好。其他未經(jīng)ICIs治療的癌癥類型中(如非小細胞肺癌、皮膚黑色素瘤、乳腺癌、頭頸癌和胃食管癌等),高TMB與預后呈負相關,TMB越高的患者生存期較短。 問 血液樣本檢測TMB(bTMB)的準確性? 答 為了評估臨床樣本血液檢測TMB(bTMB)的檢測性能,2018年Nature Medicine上發(fā)表了基于POPLAR(NCT01903993)和OAK(NCT02008227)兩個臨床試驗的回顧性研究。該項研究從上述臨床試驗中收集了1000例晚期患者治療前血液樣本,采用FoundationOne CDx測序產(chǎn)品檢測 TMB(bTMB)?;赽TMB≥16組能夠獲得更優(yōu)的免疫療效,設置bTMB cut-point=16。將所得檢測bTMB結果與前期tTMB結果比較分析。 最終發(fā)現(xiàn)血液和組織樣本中檢測一致的突變占59%,血液僅有的突變比例為26%,組織僅有的突變比例為25%,因此推測這種特異性突變可能與腫瘤的異質性及變異類型統(tǒng)計差異相關。配對分析表明,來源于同一患者的tTMB和bTMB呈顯著正相關,陰性一致率(NPA)為88%,陽性一致率(NPA)為64%。 并且血漿中bTMB與免疫檢查點抑制劑療效總體呈正相關。 bTMB檢測,由于血液中ctDNA的檢測來源于腫瘤組織的釋放,ctDNA的釋放與腫瘤的分期相關,患者的分期越高,ctDNA的突變檢出率越高。所以,早期腫瘤患者用血液檢測TMB的效果不及晚期患者,bTMB檢測優(yōu)先用于晚期(IIIB-IV期)的腫瘤患者。 《腫瘤突變負荷檢測及臨床應用中國專家共識(2020 年版)》指出,bTMB 與 tTMB兩者存在相關性,但是檢出的突變大部分不一致,且組織與血液樣本收集時間間隔越大,其異質性越高。根據(jù)多項研究發(fā)現(xiàn)高bTMB與NSCLC患者接受單藥 ICIs 治療獲益顯著相關,但bTMB仍然處于探索階段,檢測準確性有待進一步驗證。因此推薦使用滿足病理質控的近期石蠟包埋腫瘤組織樣本進行 tTMB 檢測。而且TMB檢測需要采用超過300基因或覆蓋率大于1Mb的NGS大panel產(chǎn)品進行,以保證數(shù)據(jù)的全面性、準確性。 問 為什么要采用“五分位法”確定TMB閾值? 答 《腫瘤突變負荷檢測及臨床應用中國專家共識(2020年版)》中明確指出,針對各個癌種在使用相同的篩選策略時,“五分位法”選擇排序在20%以上的病例則定義為TMB-H組。 MSKCC分析了涉及10個癌種的7033名患者數(shù)據(jù),證實了TMB高與接受ICIs治療患者更好的總體存活率相關。該研究還發(fā)現(xiàn),TMB值最高的20%的患者,與剩下的80%的患者相比,經(jīng)過ICIs治療后的總生存率更高。結果表明,如果TMB的閾值增加,則死亡風險比(HR)在20%閾值前后差異化明顯。這說明不同癌種中,預測ICIs治療效果的TMB閾值用前20%來確定比較合理,所以采用“五分位法”。 問 大panel檢測TMB,為什么有時TMB=0? 答 根據(jù)MSKCC發(fā)表的數(shù)據(jù),MSK-IMPACT在對包含腎癌、肺癌、胃食管癌、黑色素瘤等癌種在內(nèi)的1662例組織樣本進行TMB檢測,并且絕大多數(shù)為IV期患者,而在這些晚期患者組織樣本中仍有50例樣本TMB=0,約占比例為3%,其中腎細胞癌占5.3%(8/151),頭頸癌占7.3%(10/138)。 《腫瘤突變負荷檢測及臨床應用中國專家共識》中明確TMB的計算納入標準為影響蛋白編碼的且突變頻率≥5%體細胞突變,保證了TMB檢測結果的準確性和穩(wěn)定性。報告檢測下限低于5%且融合、擴增等變異不計入TMB計算,因此多種原因會導致部分陽性樣本的TMB依然為0。 問 哪些癌種檢出TMB-H的概率比較高? 答 根據(jù)調(diào)研TCGA數(shù)據(jù)庫,15個癌種的WES檢測TMB結果,分析發(fā)現(xiàn)6624例樣本中,其中有530 例樣本為TMB-H,占比7.2%。而且以下癌種中檢出TMB-H的幾率會更高:COAD,結腸腺癌;LUSC,肺鱗癌;BLCA,膀胱尿路上皮癌;SKCM,皮膚黑色素瘤;LUAD,肺腺癌;STAD,胃腺癌;UCEC,子宮內(nèi)膜癌。 Chalmers教授對分別來自167種癌癥的10萬份腫瘤組織標本的數(shù)據(jù)進行分析,黑色素瘤、子宮內(nèi)膜癌、皮膚癌、胃腸道腫瘤、非小細胞肺癌、頭頸部腫瘤及膀胱癌等涉及8個組織的 20種腫瘤類型的TMB-H的概率超過10%。 因此,膀胱癌、黑色素瘤、子宮內(nèi)膜癌、頭頸部腫瘤等多種癌癥的TMB-H檢出率相對較高,考慮ICIs治療機會TMB檢測的價值較大。 問 哪些癌種中TMB-H的患者免疫治療療效比較好? 答 Keynote-158研究評估了帕博利珠單抗在10個癌種(宮頸癌、子宮內(nèi)膜癌、肛門癌、小細胞肺癌、唾液腺癌、甲狀腺癌、分化型神經(jīng)內(nèi)分泌癌、膽道癌、間皮瘤、外陰癌),在不同癌種的ORR數(shù)據(jù)中,帕博利珠單抗對低TMB、高TMB(MSI-低)和的緩解率為7%、27%。而且小細胞肺癌、宮頸癌、子宮內(nèi)膜癌、陰道癌以及神經(jīng)內(nèi)分泌瘤在TMB-H人群中均達到較高的ORR(17%-47%),預示ICIs治療效果相對較好。 結合Keynote-158研究結果,考慮到PDL1抗體在子宮內(nèi)膜癌和SCLC中的適應證較廣,因此,歐洲ESMO指南推薦TMB應在宮頸癌、分化型神經(jīng)內(nèi)分泌癌、唾液腺癌、外陰癌、甲狀腺癌中進行檢測。 國內(nèi)專家共識推薦既往標準治療后疾病進展且沒有更好替代療法的實體瘤患者,尤其是高TMB的患者應進行TMB檢測,有助于擴大ICIs治療獲益人群。 問 PDL1/MSI/TMB/免疫正負基因,這些指標的關系如何? 答 ESMO指南基于4187例患者的泛癌種統(tǒng)計,同時存在高TMB、高MSI和PD-L1表達的腫瘤為2.9%,其中食管腺癌(14.6%)和結直腸癌(12.8%)的比例最高,同時存在高TMB和PD-L1表達或高MSI和PD-L1表達的腫瘤比例更高。最需要進行MSI檢測的腫瘤類型為:子宮內(nèi)膜癌、結直腸癌、胃食管(腺癌)。由于微衛(wèi)星不穩(wěn)定型(MSI-H)通常會導致更高的DNA移碼突變水平,間接導致TMB的升高。因此,一般MS-H的患者,會出現(xiàn)TMB-H;但是反過來,TMB-H的患者,卻不一定都是MSI-H。因此對于MSI-H型腫瘤,推薦無需進一步分析TMB或PD-1/PD-L1表達檢測。另外,特定的突變特征可獨立于MSI-H而導致TMB-H,這些基因包括BRCA1/2、TP53和POLE等基因的突變,因此攜帶這些基因突變的患者檢測TMB意義較大。 問 面對多種ICIs療效指標,檢測時該如何排序? 答 當前獲得國內(nèi)外臨床指南推薦的ICIs治療指標是PD-L1,MSI和TMB檢測。 如非小細胞肺癌患者,指南指出攜帶驅動基因突變的患者免疫藥物治療療效較差,若選擇免疫治療,首先應檢測EGFR/ALK/ROS1等驅動基因是否突變。若驅動基因為陰性,依據(jù)《中國非小細胞肺癌PD-L1表達檢測臨床病理專家共識》推薦,依次檢測PD-L1、TMB和MSI。(肺癌免疫指標檢測:驅動基因>PDL1>TMB>MSI>免疫正負相關基因)如果上述指南推薦指標均為陰性,可再檢測TP53、POLE等免疫正負相關基因,但值得說明的是,目前專家指南并未推薦免疫正負相關基因對于ICIs治療的指導,其臨床研究證據(jù)等級相對有限,僅供科研探索,隨著后續(xù)研究深入,不同癌種中所占權重可能會有變化。 有研究發(fā)現(xiàn):腸癌患者中MSI-H患者約為5%,MSS的腸癌患者約占95%,99.7%的MSI-H患者均表現(xiàn)為TMB-H,根據(jù)指南推薦,腸癌優(yōu)先檢測MSI指標,指導ICIs治療,遺傳性篩查和II期患者術后治療。但該研究同時發(fā)現(xiàn),MSS型腸癌患者中也有2.9%為TMB-H。這也進一步將TMB-H的患者由302名提高到466名,比例也相應的提高了54.3%,而這部分表現(xiàn)MSS/TMB-H的患者仍然是潛在ICIs治療有效人群,因此MSS的腸癌患者也能檢測TMB評估ICIs的治療療效,另外有研究報道PDL1的表達水平與結直腸癌患者ICI治療無相關性,且與TMB和MSI狀態(tài)相對獨立。 |
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