今天是第1935期日?qǐng)?bào)。

Cell子刊：食道微生物組——新焦點(diǎn)還是炒作？（觀點(diǎn)）

Trends in Microbiology[IF:17.079]

① 微生物組研究是當(dāng)下焦點(diǎn)，但話題過熱也會(huì)帶來“炒作”風(fēng)險(xiǎn)，在探索食道微生物組這類我們還知之甚少的領(lǐng)域時(shí)，尤需謹(jǐn)慎；② 食道具有豐富的微生物群落，有研究表明食道微生物組與食管反流疾病、食道癌相關(guān)；③ 但由于技術(shù)限制、食道樣品易受口腔污染等，食道微生物組詳細(xì)圖譜尚不清晰，缺乏直接的細(xì)菌與食道病理間聯(lián)系的研究；④ 高通量培養(yǎng)組技術(shù)、宏基因組組裝基因組的應(yīng)用等，使食道微生物組在生理病理中的研究得到了進(jìn)一步發(fā)展。

The oesophageal microbiome and cancer: hope or hype?
09-04, doi: 10.1016/j.tim.2021.08.007

【主編評(píng)語】Trends in Microbiology近期發(fā)表的觀點(diǎn)性文章，討論了食道微生物組潛在的重要性和新的方法論，包括培養(yǎng)組學(xué)、宏基因組學(xué)和全基因組序列的恢復(fù)等。文章結(jié)尾提了12個(gè)關(guān)于食道微生物組如何研究，研究什么的Outstanding questions，非常值得思考。（@solo）

Nature子刊：靶向抑制腸道鐘基因Bmal1抑制肥胖

Nature Communications[IF:14.919]

① 腸道特異性缺失Bmal1基因的小鼠（Bmal1iKO 小鼠）在普通飼料喂養(yǎng)中具有正常表型，而在高脂飲食中，Bmal1iKO小鼠可免受肥胖和相關(guān)代謝異常的發(fā)展如高脂血癥和脂肪肝；② 一致地，在野生型小鼠中，與隨時(shí)進(jìn)食小鼠相比，在夜間（BMAL1表達(dá)較低）喂養(yǎng)高脂飲食的小鼠肥胖有所減輕，靶向抑制BMAL1也可改善高脂誘導(dǎo)的肥胖；③ 機(jī)制上，BMAL1通過直接結(jié)合啟動(dòng)子中的E-box 反式激活Dgat2基因（編碼三酰甘油合成酶 DGAT2），從而促進(jìn)膳食脂肪吸收。

Deficiency of intestinal Bmal1 prevents obesity induced by high-fat feeding
09-07, doi: 10.1038/s41467-021-25674-5

【主編評(píng)語】近期廣州中醫(yī)藥大學(xué)中藥學(xué)院分子節(jié)律與代謝研究所吳寶劍與深圳市人民醫(yī)院劉凱勝作為共同通訊作者在Nature Communications發(fā)表的一項(xiàng)研究表明腸道鐘基因 Bmal1通過調(diào)節(jié)Dgat2轉(zhuǎn)錄和表達(dá)促進(jìn)膳食脂肪吸收，靶向抑制腸道Bmal1可保護(hù)小鼠免受高脂飲食誘導(dǎo)的肥胖，這些發(fā)現(xiàn)表明腸道BMAL1可作為治療過量脂肪攝入引起的代謝性疾病的藥物靶點(diǎn)。（@臨床營養(yǎng)Dr.Chen）

Lancet：一文讀懂慢性腎病的管理（綜述）

Lancet[IF:79.321]

① 慢性腎病保守治療和保腎護(hù)理目的是減緩慢性腎病進(jìn)展，延長無透析時(shí)間，提高生活質(zhì)量和生存率；② 低蛋白低鹽的植物性飲食可減輕腎小球過度濾過、保護(hù)腎功能、維持酸堿穩(wěn)態(tài)并調(diào)節(jié)腸道菌群；③ 藥物治療可通過降低腎小球內(nèi)壓、抗炎或抗纖維化等機(jī)制保護(hù)腎功能；④ 管理慢性腎臟病的心血管風(fēng)險(xiǎn)，降低感染風(fēng)險(xiǎn)和預(yù)防急性腎損傷是慢性腎病的關(guān)鍵干預(yù)措施；⑤ 當(dāng)腎臟替代治療不可避免時(shí)，可以考慮逐漸過渡到透析，并盡可能延長殘余腎功能的保留。

Chronic kidney disease
06-24, doi: 10.1016/S0140-6736(21)00519-5

【主編評(píng)語】來自Lancet上發(fā)表的一篇綜述文章，詳細(xì)介紹了慢性腎病的管理方式，包括非藥物干預(yù)（飲食及生活方式干預(yù)）及藥物治療。（@aluba）

香港大學(xué)張彤 Nature子刊：基于組學(xué)的抗生素耐藥基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估框架

Nature Communications[IF:14.919]

① 依據(jù)抗生素耐藥基因（ARGs）在人類相關(guān)環(huán)境的富集度、基因移動(dòng)性和宿主致病性為主要因素開發(fā)了ARGs風(fēng)險(xiǎn)等級(jí)的評(píng)估框架，將ARGs分為四個(gè)風(fēng)險(xiǎn)等級(jí)；② ARGs廣泛存在，與環(huán)境無關(guān)，僅有30%ARGs與抗生素使用相關(guān)；③ 3.6%的ARGs屬于當(dāng)前或未來威脅的高風(fēng)險(xiǎn)（一、二級(jí)）ARGs；④ 鑒定了73個(gè)一級(jí)ARGs，35個(gè)為已知高風(fēng)險(xiǎn)ARGs，另外新發(fā)現(xiàn)的38個(gè)ARGs具有顯著的臨床相關(guān)性；⑤ ARGs廣泛存在于正常人的腸道菌群中，但僅有8.9%的基因組中包含高風(fēng)險(xiǎn)ARGs。

An omics-based framework for assessing the health risk of antimicrobial resistance genes
08-06, doi: 10.1038/s41467-021-25096-3

【主編評(píng)語】病原微生物的抗生素耐藥性已經(jīng)成為威脅人類健康的關(guān)鍵因素。抗生素耐藥基因（ARGs）是微生物耐藥的主要機(jī)制，ARGs廣泛存在于自然界中，然而并不是所有的ARGs都會(huì)威脅公共健康。因此，如何有效識(shí)別和評(píng)價(jià)潛在的高風(fēng)險(xiǎn)ARGs對(duì)于人類有針對(duì)性的開展主動(dòng)預(yù)防具有重要的意義。近期國內(nèi)香港大學(xué)張彤團(tuán)隊(duì)在Nature子刊，Nature Communications上發(fā)表了他課題組最新的研究成果，他們基于組學(xué)的信息成功開發(fā)一套嶄新的ARGs評(píng)估框架，該框架以抗性基因是否高度集中于與人類相關(guān)的環(huán)境中、在微生物種間的可轉(zhuǎn)移性，以及在宿主（人類）內(nèi)的可致病性為主要因素，將ARGs按照風(fēng)險(xiǎn)程度分成了四個(gè)級(jí)別，系統(tǒng)地評(píng)估了ARGs對(duì)人類所構(gòu)成的風(fēng)險(xiǎn)。（@Zhonghua）

在不同種族中，腸道菌群與NAFLD的關(guān)聯(lián)

Gut Microbes[IF:10.245]

① 納入1544名60-77歲的受試者，其中511名NAFLD患者，對(duì)腸道菌群進(jìn)行分析；② NAFLD與腸道菌群α-多樣性的關(guān)聯(lián)受到種族影響，在黑人、白人及拉丁美洲人中，NAFLD患者的腸道菌群α-多樣性顯著降低；③ 鑒定出62個(gè)菌屬與NAFLD相關(guān)，鑒定出69個(gè)菌屬至少在一個(gè)種族中與NAFLD相關(guān)，未鑒定出任何一個(gè)菌屬在所有種族中均與NAFLD相關(guān)；④ 在所有種族中，均可觀察到次級(jí)膽汁酸及碳水化合物相關(guān)通路與NAFLD相關(guān)。

Associations of the gut microbiome with hepatic adiposity in the Multiethnic Cohort Adiposity Phenotype Study
09-07, doi: 10.1080/19490976.2021.1965463

【主編評(píng)語】腸道菌群可能促進(jìn)非酒精性脂肪性肝?。∟AFLD）的發(fā)生發(fā)展。Gut Microbes上發(fā)表的一項(xiàng)最新研究，納入了1544名不同種族（黑人、白人、拉丁美洲裔、日裔、夏威夷原住民）的老年受試者（其中511名NAFLD患者），發(fā)現(xiàn)NAFLD與腸道菌群多樣性、組成及功能相關(guān)，而這種關(guān)聯(lián)受到了種族因素的影響。（@aluba）

芳香烴受體介導(dǎo)了腸道菌群對(duì)小鼠行為的影響

Brain Behavior and Immunity[IF:7.217]

① 抗生素處理增加小鼠的盲腸重量，在高架十字迷宮 (EPM)、露天試驗(yàn)（OFT）和三室實(shí)驗(yàn)（3CT）中，對(duì)焦慮樣行為、運(yùn)動(dòng)或社交偏好并無顯著影響；② 在懸尾測試（TST）及強(qiáng)迫游泳測試（FST）中，抗生素處理可減少雄性小鼠的靜止時(shí)間，停用抗生素后該表型可逆轉(zhuǎn)；③ 在芳香烴受體敲除小鼠中，也可觀察到相似的絕望行為的增加；④ β-萘黃酮激活肝臟和海馬體中的芳香烴受體表達(dá)，并改善抗生素處理后的雄性小鼠的絕望行為。

Behavioural adaptations after antibiotic treatment in male mice are reversed by activation of the aryl hydrocarbon receptor
08-27, doi: 10.1016/j.bbi.2021.08.228

【主編評(píng)語】Brain Behavior and Immunity上發(fā)表的一項(xiàng)最新研究，發(fā)現(xiàn)抗生素處理或敲除芳香烴受體，均可在懸尾實(shí)驗(yàn)及強(qiáng)迫游泳實(shí)驗(yàn)中，增加雄性小鼠的絕望行為，而激活芳香烴受體可逆轉(zhuǎn)這一表型。（@aluba）

地中海飲食踐行者認(rèn)知與體重降低的關(guān)聯(lián)性

Clinical Nutrition[IF:7.324]

① 將在基線時(shí)存在超重/肥胖，但認(rèn)知功能正常的487人（平均65.2±4.7歲）分配至能量限制性地中海飲食+運(yùn)動(dòng)促進(jìn)的干預(yù)組和非能量限制地中海飲食對(duì)照組；② 干預(yù)組在基線時(shí)言語記憶、反應(yīng)時(shí)間和決策能力方面表現(xiàn)較好的個(gè)體，達(dá)到8%減重目標(biāo)的幾率更高，而對(duì)干預(yù)方案依從性更高者與記憶力改善更多有關(guān)；③ 認(rèn)知的更多提升與BMI的更大降低以及身體活動(dòng)和生活質(zhì)量的更好改善相關(guān)；④ 認(rèn)知改善的個(gè)體差異與對(duì)干預(yù)依從性、性別年齡及基礎(chǔ)病等因素有關(guān)。

Interplay between cognition and weight reduction in individuals following a Mediterranean Diet: Three-year follow-up of the PREDIMED-Plus trial
08-05, doi: 10.1016/j.clnu.2021.07.020

【主編評(píng)語】近期發(fā)表于Clinical Nutrition的一項(xiàng)研究表明更好的遵循限制能量性地中海飲食（限制30%能量）＋運(yùn)動(dòng)促進(jìn)的生活方式干預(yù)方案與更好的認(rèn)知改善有關(guān)。（@臨床營養(yǎng)Dr.Chen）

武漢協(xié)和醫(yī)院：低FODMAP飲食可改善IBS患者的總體癥狀及排便習(xí)慣

Frontiers in Nutrition[IF:6.576]

① 納入10項(xiàng)隨機(jī)對(duì)照試驗(yàn)（共涉及511名IBS患者）進(jìn)行薈萃分析，總結(jié)低FODMAP飲食對(duì)IBS患者的作用；② 與對(duì)照干預(yù)相比，低FODMAP飲食與IBS患者的總體癥狀改善（n=420）、排便習(xí)慣改善（n=434）、排便頻率降低（n=434）相關(guān)，證據(jù)質(zhì)量中等；③ 低FODMAP飲食對(duì)IBS患者的生活質(zhì)量（n=484）、焦慮（n=150）、抑郁（n=150）及BMI（n=110）無顯著改善作用，證據(jù)質(zhì)量低或極低。

A Low-FODMAP Diet Improves the Global Symptoms and Bowel Habits of Adult IBS Patients: A Systematic Review and Meta-Analysis
08-19, doi: 10.3389/fnut.2021.683191

【主編評(píng)語】華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院附屬協(xié)和醫(yī)院的侯曉華團(tuán)隊(duì)與Lei Zhang團(tuán)隊(duì)在Frontiers in Nutrition上發(fā)表的一項(xiàng)薈萃分析結(jié)果，總結(jié)了10項(xiàng)隨機(jī)對(duì)照試驗(yàn)（共包含511名受試者）的數(shù)據(jù)后發(fā)現(xiàn)，低FODMAP飲食可顯著改善IBS患者的總體癥狀、排便習(xí)慣及排便頻率。（@aluba）

人體腸道菌如何轉(zhuǎn)化膽汁酸？

mSystems[IF:6.496]

① 評(píng)估72株人類腸道細(xì)菌，表明不同菌株轉(zhuǎn)化初級(jí)膽汁酸（膽酸、鵝脫氧膽酸）和次級(jí)膽汁酸（脫氧膽酸）的效率不同；② 表現(xiàn)出3a-、7a-或12a-羥基類固醇脫氫酶（HSD）相對(duì)活性和特異性的膽汁酸轉(zhuǎn)化菌，分別有25株、38株、12株；③ 其中7a-去羥基化活性分布在多個(gè)細(xì)菌屬，同時(shí)也發(fā)現(xiàn)了C-6和C-7的羥基轉(zhuǎn)化；④ 結(jié)合初級(jí)和次級(jí)膽汁酸的氨基酸在腸道微生物中廣泛存在，同時(shí)發(fā)現(xiàn)了44種新的微生物共軛膽汁酸。

Dominant Bacterial Phyla from the Human Gut Show Widespread Ability To Transform and Conjugate Bile Acids
08-31, doi: 10.1128/mSystems.00805-21

【主編評(píng)語】腸道細(xì)菌通過化學(xué)修飾宿主合成的初級(jí)膽汁酸，即次級(jí)膽汁酸，可作為信號(hào)分子，調(diào)節(jié)宿主的脂質(zhì)、葡萄糖和能量代謝，并通過選擇性抗菌特性影響腸道微生物組成。然而，目前還不足以預(yù)測某一特定微生物如何影響膽汁酸代謝，從而影響宿主生理。mSystems最近發(fā)表的文章，對(duì)人體腸道中常見的72種細(xì)菌的膽汁酸轉(zhuǎn)化能力進(jìn)行了系統(tǒng)的體外研究。結(jié)果發(fā)現(xiàn)腸道細(xì)菌具有廣泛的轉(zhuǎn)化和結(jié)合膽汁酸的能力，同時(shí)也確定了新的結(jié)合次級(jí)膽汁酸。本研究結(jié)果或可有助于更好地了解腸道微生物群是如何影響膽汁酸池的。（@nana）