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細(xì)胞圖譜合集

 健明 2021-07-15

男,

一個(gè)長(zhǎng)大了才會(huì)遇到的帥哥,

穩(wěn)健,瀟灑,大方,靠譜。

一段生信緣,一棵技能樹,

一枚大型測(cè)序工廠的螺絲釘,

一個(gè)隨機(jī)森林中提燈覓食的津門旅客。


隨著單細(xì)胞技術(shù)的成熟,單細(xì)胞數(shù)據(jù)也在日益增長(zhǎng),這將為單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)奠定數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。在不遠(yuǎn)的將來(lái),單細(xì)胞數(shù)據(jù)挖掘也將成為生命科學(xué)的基礎(chǔ)設(shè)施。只是在2020年的今天,大量的細(xì)胞圖譜還處在原始的數(shù)據(jù)積累階段,還沒有像TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)那樣成熟。這就像遠(yuǎn)處的晨曦閃著的微光,早起的人總會(huì)不由自主地駐足觀望。

要做數(shù)據(jù)挖掘,第一條肯定是要有數(shù)據(jù),好在這些圖譜的數(shù)據(jù)都是比較方便下載的。一般是csv,loom, cellranger 輸出矩陣格式的,下載來(lái)直接用我們熟悉的單細(xì)胞工具就可以做了。

今天,你們家運(yùn)來(lái)哥哥就帶你看看現(xiàn)階段人類已經(jīng)構(gòu)建的細(xì)胞圖譜,走吧~

人類細(xì)胞圖譜計(jì)劃:

https://www./



人類肺細(xì)胞圖譜

https://hlca.ds./



人類細(xì)胞圖譜(Human Cell Landscape)

https://db./HCL/



人類蛋白質(zhì)圖譜

https://www./



小鼠細(xì)胞圖譜

http://bis./MCA/index.html



腸道細(xì)胞圖譜

https://www.gutcellatlas./
https://www./


人類腎臟細(xì)胞圖譜

https://www./


COVID-19 Cell Atlas

https://www./


看了這么多細(xì)胞圖譜,我們也許會(huì)反問自己:到底什么是細(xì)胞圖譜?

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