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新春臨近,又到了年底總結(jié)的時候。從下周開始到過年期間,公眾號就不再更新了。感謝過去一年粉絲們的支持,每一次閱讀和點贊,都是對我的鼓勵。在此,提前祝各位公眾號的粉絲們,闔家幸福,萬事如意!
推文合集,是本公眾號的特色欄目,以方面方面我記錄總結(jié),也方便粉絲們閱讀瀏覽。2020年發(fā)送的推文列表如下
引用2115次的ATAC經(jīng)典論文解讀
劃重點|ATAC的peak shift需要這樣做
給你bam文件,你會畫插入片段長度分布圖嗎?
跟著ENCODE學習ATAC文庫的質(zhì)控標準
解密ATAC中的測序飽和度分析
NGS測序中PCR重復序列的判定方法
從GTF文件中提取TSS上下游1kb的區(qū)間,要多少行代碼?
獲取參考基因組chrom.sizes文件的3種方式
使用ATACseqQC進行質(zhì)控
自己動手計算TSS Enrichment score
R語言也可以進行ATAC數(shù)據(jù)的完整分析啦!
引用2000多次的ATAC經(jīng)典文獻也在用的peak calling軟件-Genrich
衡量ATAC文庫復雜度的3個指標
又一個ATAC分析的pipeline:PEPATAC
巧用TagAlign格式來進行ATAC中的shift reads操作
手把手教你計算FRiP score的值
使用picard評估文庫復雜度
使用Preseq評估文庫復雜度
F-seq:一個古老的peak calling工具
強烈推薦!Encode官方的ATAC數(shù)據(jù)分析流程
使用IDR軟件處理生物學重復樣本的peak calling
沒有生物學重復怎么辦,pseudo replicates了解一下
想進行ATAC實戰(zhàn)分析卻苦于沒有實際數(shù)據(jù),看這里
peak差異分析的工具那么多,如何選擇?
使用MACS2進行差異peak分析
使用DiffBind進行peak 差異分析
表觀轉(zhuǎn)錄組學-m6A簡介
玩轉(zhuǎn)基因組瀏覽器之初識IGV
玩轉(zhuǎn)基因組瀏覽器之使用IGV查看基因結(jié)構(gòu)信息
玩轉(zhuǎn)基因組瀏覽器之自定義IGV的參考基因組
玩轉(zhuǎn)基因組瀏覽器之IGV展示bam文件
測序深度的計算,你真的掌握了嗎
玩轉(zhuǎn)基因組瀏覽器之tdf文件
玩轉(zhuǎn)基因組瀏覽器之分面操作
玩轉(zhuǎn)基因組瀏覽器之展示bed文件
玩轉(zhuǎn)基因組瀏覽器之VCF文件的可視化
玩轉(zhuǎn)基因組瀏覽器之查看MAF文件
玩轉(zhuǎn)基因組瀏覽器之查看gwas結(jié)果
玩轉(zhuǎn)基因組瀏覽器之查看CNV分析結(jié)果
玩轉(zhuǎn)基因組瀏覽器之展示RNA_seq中的基因表達量
玩轉(zhuǎn)基因組瀏覽器之IGV進行序列比對
玩轉(zhuǎn)基因組瀏覽器之利用IGV查找motif結(jié)合位點
一看就能學會的,不同基因組版本坐標轉(zhuǎn)換方法
人生苦短,我用python
windows上python開發(fā)環(huán)境的搭建
python語法基礎(chǔ)
python中數(shù)值相關(guān)的操作
python中的序列對象
python列表常見操作技巧匯總
python中集合set的使用場景概述
python中字典dict的操作技巧匯總
python中字符串的基本操作匯總
python中的字符串格式化
python中的正則表達式
python中函數(shù)的基礎(chǔ)用法
python中函數(shù)的進階用法
python中的文件讀寫
python中文件目錄操作的常見方法
python讀寫壓縮文件
python讀寫csv文件
python執(zhí)行系統(tǒng)命令
python讀寫json文件
python讀寫ini格式的配置文件
python讀取xml格式的文件
python sys模塊的常見用法匯總
python argparse處理命令行參數(shù)
python日期和時間的操作方法匯總
使用python collections模塊中提供的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)
python multiprocessing模塊進行多進程處理
python海量數(shù)據(jù)快速查詢的技巧
使用python urllib進行網(wǎng)頁爬取
python threading模塊進行多線程編程
python中的生成器和迭代器
python中的異常捕獲
python中的命名空間和變量作用域
python中的模塊與包
python代碼規(guī)范
使用jupyter notebook運行python和R
python numpy 初識
numpy中的索引技巧詳解
numpy中的掩碼數(shù)組
Broadcast: Numpy中的廣播機制
numpy中常用的數(shù)學運算和統(tǒng)計函數(shù)匯總
numpy中數(shù)組的遍歷技巧
numpy中數(shù)組操作的相關(guān)函數(shù)
numpy中生成隨機數(shù)的技巧匯總
numpy中的文件讀寫
初識pandas
使用pandas進行文件讀寫
訪問和提取DataFrame中的元素
pandas合并和連接多個數(shù)據(jù)框
pandas中數(shù)據(jù)框的reshape操作
pandas中的數(shù)據(jù)處理利器-groupby
pandas中的index對象詳解
pandas中的字符串處理函數(shù)
pandas中的缺失值處理
pandas中的窗口處理函數(shù)
pands中的日期和時間操作
numpy和pandas的參考手冊
matplotlib簡介
matplotlib基礎(chǔ)繪圖命令之plot
matplotlib基礎(chǔ)繪圖命令之bar
matplotlib基礎(chǔ)繪圖命令之pie
matplotlib基礎(chǔ)繪圖命令之scatter
matplotlib基礎(chǔ)繪圖命令之errorbar
一文搞懂matplotlib中的顏色設(shè)置
matplotlib基礎(chǔ)繪圖命令之hist
matplotlib基礎(chǔ)繪圖命令之boxplot
matplotlib基礎(chǔ)繪圖命令之violinplot
matplotlib基礎(chǔ)繪圖命令之imshow
給你的熱圖挑選一個合適的漸變色
掌握坐標軸的log轉(zhuǎn)換
點線圖和階梯圖的畫法
為你的數(shù)據(jù)添加置信區(qū)間
添加直線的兩種方式
用箭頭和文字來標記重要的點
繪制雙坐標軸圖
對圖標的坐標軸進行調(diào)整
個性化調(diào)整坐標軸的顏色和位置
matplotlib實現(xiàn)一頁多圖
用matplotlib實現(xiàn)畫中畫
為matplotlib設(shè)置不同的主題
通過cycler實現(xiàn)屬性的自動映射
為你的圖片添加圖例
matplotlib中的黑魔法:constrained和tight layout
用不同的坐標系統(tǒng)對圖形元素進行定位
使用matplotlib繪制3D圖表
在圖中添加多邊形
設(shè)置坐標軸刻度的位置和樣式
極坐標系在數(shù)據(jù)可視化中的巧妙運用
多張熱圖的排版技巧
seaborn更高效的統(tǒng)計圖表制作工具
seaborn關(guān)聯(lián)圖表之折線圖和散點圖
seaborn數(shù)據(jù)總體分布的可視化策略
seaborn分類變量的匯總展示
seaborn可視化數(shù)據(jù)框中的多個列元素
使用seaborn繪制熱圖
jointplot快速探究兩組變量的分布及關(guān)系
seaborn繪圖風格的設(shè)置
在seaborn中設(shè)置和選擇顏色梯度
python爬蟲開發(fā)的學習路徑
用戶代理在爬蟲中的應用
IP代理在網(wǎng)絡(luò)爬蟲中的應用
cookie在爬蟲中的應用
動態(tài)網(wǎng)頁常用的兩種數(shù)據(jù)加載方式ajax和js動態(tài)請求
使用selenium自動化操作瀏覽器
使用BeautifulSoup解析網(wǎng)頁內(nèi)容
xpath語法簡介
初識scrapy爬蟲框架
scrapy實踐之翻頁爬取
scrapy實踐之item pipeline的使用
獲取用戶代理的多種方式
scrapy實踐之中間件的使用
scrapy實踐之settings的配置
使用openpyxl讀寫excel文件
通過xlrd和xlwt模塊讀寫excel文件
使用python-docx模塊讀寫word文件
使用python將word文檔轉(zhuǎn)換為PDF文檔
使用pdfminer提取PDF文件中的文字
通過python-pptx模塊操作ppt文件
使用python自動化發(fā)送郵件
conda:基于python的軟件管理系統(tǒng)
解密conda channels
管理conda environments
conda之packages管理
使用pysam操作BAM文件
使用pyBigWig模塊查看bigwig文件中的內(nèi)容
pybedtools:對bedtools的封裝和擴展
使用biopython處理序列數(shù)據(jù)
序列比對在biopython中的處理
使用biopython查詢NCBI數(shù)據(jù)庫
進化樹在biopython中的可視化
使用biopython可視化染色體和基因元件
使用biopython解析kegg數(shù)據(jù)庫
機器學習簡介
使用scikit-learn構(gòu)建數(shù)據(jù)集
使用scikit-learn填充缺失值
使用scikit-learn對數(shù)據(jù)進行預處理
線性回歸與最小二乘法
基于正則化的回歸:嶺回歸和套索回歸
使用局部加權(quán)線性回歸解決非線性數(shù)據(jù)的擬合問題
邏輯回歸:建立在回歸基礎(chǔ)上的一種分類模型
KNN:最容易理解的分類算法
來自: 生信修煉手冊 > 《待分類》
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云時代架構(gòu)云時代架構(gòu):“云時代架構(gòu)”技術(shù)社區(qū)秉著“做互聯(lián)網(wǎng)時代適合的架構(gòu)”原則,回歸架構(gòu)的簡潔之美,為讀者提供互聯(lián)網(wǎng)前沿技術(shù)解決方案、方法論和優(yōu)秀實踐,目前提供分享、培訓、開源和咨詢等技術(shù)...
兩年收獲300+粉絲,一切都是“努力”的結(jié)果
兩年收獲300+粉絲,一切都是“努力”的結(jié)果。說起這個公眾號的歷史,起碼得有兩年了,最開始純粹是因為我喜歡寫作,也就是發(fā)發(fā)牢騷、表...
十月總結(jié)|這次公眾號終于有了定位!
十月總結(jié)|這次公眾號終于有了定位!公眾號自今年6月19日注冊,最初名字是【心靈文案箱】經(jīng)過一個月的考慮,粉絲關(guān)注情況來決定,以后這...
公眾號互推增粉技巧
公眾號互推增粉技巧。今天和大家分享一下怎么互推增粉,現(xiàn)在我的小藍筆微信公眾號已經(jīng)開始運營了,盡管也是處于起步階段,公眾號目前有2...
此號非彼號,不才是庸才。
此號非彼號,不才是庸才。本不想現(xiàn)在開鋪公眾號,這在以前的那篇《我的公眾號》文章里已經(jīng)提及。并非想藉此號出名,也不能憑此號掙散銀,謹以記錄日常點滴,僅此而已。為了減少本公眾號粉絲的侵擾,此...
我的公眾號可以賺錢啦
我的公眾號可以賺錢啦。點開他們發(fā)來的詳細介紹,我了解到這是一種通過在自己的公眾號發(fā)布他們的推廣軟文,憑閱讀量就可以獲得一定收益...
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怎樣提高微信公眾號粉絲,3個方面著手微信公眾號。運營一個微信公眾號,最令人頭疼的事莫過于漲粉絲了,一個微信公眾號不管出于什么目的...
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微信掃碼,在手機上查看選中內(nèi)容