源自血液的常規(guī)生物標(biāo)志物被廣泛用于癌癥診斷,但是它們的低靈敏度和特異性限制了它們在普通人群中進(jìn)行癌癥篩查的廣泛應(yīng)用。而circRNA是液體活檢生物標(biāo)志物的新型理想候選物。近日,來自南京醫(yī)科大學(xué)杜牧龍、劉凌翔、王美林課題組的研究人員在Molecular Cancer雜志上發(fā)表綜述,總結(jié)了泛癌數(shù)據(jù)集中circRNAs在體液中的表達(dá)模式,及其在液體活檢中的臨床應(yīng)用,并開發(fā)了Web界面對每個circRNA進(jìn)行檢索。 癌癥是全世界重要的公共衛(wèi)生問題,也是美國第二大死亡原因。癌癥源于遺傳改變和轉(zhuǎn)錄程序的失調(diào)。近年來,癌癥給個人、家庭、社區(qū)和衛(wèi)生系統(tǒng)帶來了巨大負(fù)擔(dān)。然而,癌癥的早期發(fā)現(xiàn)可以幫助最小化癌癥帶來的負(fù)擔(dān)。在過去的幾十年中,一些基于血液的生物標(biāo)志物(例如癌胚抗原CEA和前列腺特異性抗原PSA)已用于癌癥的早期檢測,但是缺乏靈敏和特異性的生物標(biāo)志物限制了早期診斷,以及許多癌癥患者的預(yù)后。例如,前列腺癌和良性前列腺增生患者均存在PSA 升高。因此,迫切需要研究具有高特異性和敏感性的生物標(biāo)志物。 液體活檢是一種非侵入性方法,它使用體液(例如血液、血漿、血清、尿液和胃液)來反映疾病狀態(tài)。近來,已有大量研究集中于檢測和定量腫瘤活檢中的生物標(biāo)志物,尤其是環(huán)狀RNA(circRNA)。環(huán)狀RNA是一類新發(fā)現(xiàn)的非編碼RNA,主要通過前體mRNA剪接產(chǎn)生。隨著高通量轉(zhuǎn)錄組分析技術(shù)的迅速發(fā)展,人們已經(jīng)認(rèn)識到許多circRNA在血漿、血清、外泌體和尿液等體液中穩(wěn)定且高水平存在。CircRNA的表達(dá)方式在癌癥患者和健康對照者之間表現(xiàn)出明顯的差異,這表明體液中的circRNA可能代表了監(jiān)測癌癥發(fā)展和進(jìn)展的新型生物標(biāo)記。盡管關(guān)于circRNA的研究尚處于起步階段,但多項(xiàng)研究表明它們作為癌癥有價值的診斷和預(yù)后生物標(biāo)志物的潛力。由于缺少5'和3'末端,CircRNA對RNase活性具有高度抗性。另外,由于circRNA經(jīng)常以組織和發(fā)育階段的特定方式表達(dá),并且不僅在組織和細(xì)胞中而且在體液中也大量發(fā)現(xiàn),因此circRNA是液體活檢生物標(biāo)志物的理想候選物。 在這篇綜述中,研究人員總結(jié)了多種癌癥類型的體液中circRNA的表達(dá)模式,并描述了其在液體活檢中的臨床應(yīng)用,以進(jìn)行癌癥的診斷和預(yù)后。從每個分析中提取的受體工作特征(ROC)曲線和曲線下的相應(yīng)面積(AUC)值用于描述circRNA的診斷值。此外,研究人員開發(fā)了一個用戶友好的Web界面(https://mulongdu./circrnas_in_fluids/),使感興趣的人可以輕松瀏覽和搜索與疾病相關(guān)的circRNA。 圖:10種最常見癌癥的患者體液中鑒定出的CircRNA。根據(jù)“ 2020年癌癥統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)” ,顯示了十種最常見的癌癥,包括肺癌、乳腺癌、結(jié)直腸癌、前列腺癌、胃癌、肝細(xì)胞癌、食道鱗狀細(xì)胞癌、宮頸癌、甲狀腺癌和膀胱癌。由于卵巢癌發(fā)病率和死亡率在女性中增加,因此在此圖中還列出了卵巢癌相關(guān)的circRNA。該圖是在https://app./gallery/illustrations中生成的。 【科研成長加油站】 不做實(shí)驗(yàn)不寫meta,輕輕松松發(fā)40多篇SCI(12.19-20/2021.1.16-17 網(wǎng)絡(luò)精講班 腸道菌群機(jī)制研究及國自然課題設(shè)計(jì)專題會議 腸道菌與代謝研究課題設(shè)計(jì)、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分析與基金申報(bào) 1月23-24日 論文插圖、機(jī)制模式圖 科研數(shù)據(jù)處理、統(tǒng)計(jì)分析與圖表制作繪制專題班(課后提供作圖服務(wù) 1月23-24日 30-31日線上班 發(fā)過Nature文章的大咖一周內(nèi)教您學(xué)會挖掘單細(xì)胞測序公共數(shù)據(jù)庫來發(fā)表文章 1月25-29日 2天教你學(xué)會影像組學(xué)的數(shù)據(jù)分析和SCI論文寫作 1月16-17日 線上 腸道菌群機(jī)制研究及國自然課題設(shè)計(jì)專題會議 國自然熱點(diǎn):m6A(RNA甲基化修飾)課題思路介紹及熱點(diǎn)方向分析 中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究技術(shù)專題會議( 1.16-17 網(wǎng)絡(luò)精講班) 五天學(xué)會Nature級的圖表及插圖制作方法(網(wǎng)絡(luò)精講班+線下班)
|
|