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【原】文獻計量學系列X2 — PubMed題錄數(shù)據(jù)下載與導入

 松哥精鼎統(tǒng)計 2020-10-23
引言


R 語言Bibliometrix包支持2種格式的PubMed題錄數(shù)據(jù)格式，分別為通過PubMed輸出的“txt”和通過API下載的“xml”。數(shù)據(jù)中均不包括參考文獻，因此部分文獻計量學分析做不了，比如引文分析。本位以“bibliometrics”為主題詞，簡單介紹如何從PubMed數(shù)據(jù)庫中檢索相關(guān)文獻，并下載文獻題錄數(shù)據(jù)。







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一、PubMed數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站下載與導入題錄數(shù)據(jù)


注：Pubmed數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站最多能輸出10000條數(shù)據(jù)。

更多信息請參考網(wǎng)站：

https://pubmed.ncbi.nlm./help/。

題錄數(shù)據(jù)框字段標識參照該網(wǎng)站“Appendices”的“Search Fielddescriptions and tags”板塊。（PubMed retrieving query 是從該網(wǎng)站中摘錄下來的，方便讀者查閱。需要的請加微信號“wxjl777”







二、通過API下載與導入PubMed題錄數(shù)據(jù)


更多信息請參考網(wǎng)站：
https://cran./web/packages/pubmedR/vignettes/A_Brief_Example.html。







三、小結(jié)


本節(jié)講解了PubMed數(shù)據(jù)庫2種輸出與導入方法。由于此2種方法沒有文獻發(fā)表月份數(shù)據(jù)列（即“PD”列），下一期將探索如何從2種數(shù)據(jù)中提取文獻發(fā)表月份數(shù)據(jù)。
更多數(shù)據(jù)庫文獻題錄下載與導入，請參考網(wǎng)站https://cran./web/packages/bibliometrix/vignettes/Data-Importing-and-Converting.html

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