公元589年正月初一，隋吳州總管賀若弼從廣陵渡過(guò)了長(zhǎng)江，同時(shí)，隋廬江總管韓擒虎也輕易占領(lǐng)了采石。正月初六，賀若弼攻拔京口，并于正月二十在建康附近的白土岡擊潰南陳大軍。韓擒虎接著順利占領(lǐng)南陳的宮城，生擒了陳后主陳叔寶。

賀若弼乘勝進(jìn)軍到樂游苑，南陳都督魯廣達(dá)還繼續(xù)帶領(lǐng)殘余部隊(duì)苦戰(zhàn)不息，殺死和俘虜了好幾百隋兵。天黑時(shí)，他才解去甲胄，面朝宮廷的方向下拜了兩次，哭著跟部眾說(shuō)：“我不能救國(guó)，自身負(fù)罪深重！”士卒們也都痛哭流淚。于是他們放下武器，束手就擒。其他宮門的衛(wèi)兵也都逃走了。賀若弼當(dāng)夜燒了北掖門，進(jìn)入臺(tái)城。他聽說(shuō)韓擒虎已得到了陳叔寶，便叫他前來(lái)相見。陳叔寶驚惶恐懼，渾身流汗，兩腿發(fā)抖，并對(duì)賀若弼接連下拜了兩次。賀若弼跟他說(shuō)：“小國(guó)的君主應(yīng)當(dāng)算是大國(guó)的公卿，下拜也是禮數(shù)。你到我們隋朝后也會(huì)封個(gè)歸命侯什么的，所以不用恐懼。”接著他因?yàn)楣禹n擒虎之后而感到羞恥，和韓擒虎吵了起來(lái)，然后氣呼呼地拔劍出去。他想叫蔡征為陳叔寶書寫投降的箋文，命令他乘坐一輛騾車到自己的軍營(yíng)來(lái)，但后來(lái)事情沒辦成。賀若弼將陳叔寶安置在德教殿，并派兵守衛(wèi)他。

高颎先進(jìn)入建康。他兒子高德弘擔(dān)任晉王楊廣的記室，楊廣派高德弘快馬感到高颎那里，讓他將張麗華（即張貴妃）留下。高熲說(shuō)：“當(dāng)年姜太公蒙了自己的臉孔殺了妲己。我們今天又怎能留下張麗華！”因此在青溪把她給殺了。高德弘回來(lái)匯報(bào)給楊廣，楊廣氣得臉色大變，說(shuō)：“古人說(shuō)，‘無(wú)德不報(bào)’，我必定有報(bào)答高公的時(shí)候！”于是非常痛恨高颎。

正月二十二（丙戌），晉王楊廣進(jìn)入建康。他因?yàn)槭┪膽c當(dāng)權(quán)卻不忠誠(chéng)，專門從事諂佞的勾當(dāng)，用以掩蔽陳后主的耳目；又因?yàn)樯蚩颓浼又刭x稅，收刮民間財(cái)富，用以取悅君王；便下令將他倆連同太市令陽(yáng)慧朗、刑法監(jiān)徐析、尚書都令史暨慧等民害，在石闕下處斬，以向三吳民眾謝罪。他還讓高颎和元帥府記室裴矩一道負(fù)責(zé)收集圖片書籍，封存府庫(kù)，對(duì)南陳國(guó)庫(kù)的資產(chǎn)一無(wú)所取。因此天下人都盛贊楊廣，覺得他非常賢能。裴矩是裴讓之弟弟的兒子。

楊廣因?yàn)橘R若弼在約定的期限前擅自決戰(zhàn)，違犯了軍令，派人收捕了他，交給廷尉官吏。隋文帝楊堅(jiān)得悉后，急忙派驛馬去把賀若弼召回，并下詔給楊廣說(shuō)：“平定江表都是賀若弼和韓擒虎的功勞。”他還賜給賀若弼一萬(wàn)段絲帛；又賜給賀若弼和韓擒虎一道特別詔書，贊美他們的功勞。

開府儀同三司王頒是王僧辯的兒子。當(dāng)夜，他挖掘了陳武帝陳霸先的陵園，把他的尸骨燒成灰燼，摻上水喝了下去，為他父親復(fù)仇。然后他將自己綁了起來(lái)，到晉王楊廣那里自首。楊廣將這事上報(bào)朝廷，隋文帝命令赦免了王頒。隋文帝還下詔，總共派五戶人家專門照看陳武帝陳霸先、陳文帝陳蒨、陳孝宣帝陳頊的陵園。

隋文帝派人去把南陳滅亡的消息告訴被扣留在隋朝的南陳使臣許善心。許善心穿著衰服在西階之下號(hào)哭，然后鋪了些草，面朝東方，在上頭連坐了三天。隋文帝派人送敕書向他吊唁。三天后，有詔書命令他回到他住的館舍，宣布任命他為通直散騎常侍，還賜給他一套官服。許善心為陳朝的滅亡痛哭盡哀。他到房間里換了衣服后，重新出來(lái)，朝北站立，哭著拜受了詔令。次日他上朝晉見隋文帝，又跪伏在殿下，悲痛得不能自已。隋文帝看著身邊的侍從們說(shuō)：“我平定了陳國(guó)，唯一的好處就是得到了這人。他能如此懷念他往日的君主，今后一定會(huì)是我的忠臣?！庇谑请妨?，讓他以本官在門下省當(dāng)值。

許善心字務(wù)本，是高陽(yáng)北新城人。他祖父許懋曾歷任南梁太子中庶子，始平和天門二郡守、散騎常侍。他父親許亨，也在南梁任過(guò)給事黃門侍郎，在南陳歷任羽林監(jiān)、太中大夫、衛(wèi)尉卿，領(lǐng)大著作。許善心九歲時(shí)就成了孤兒，由母親范氏撫養(yǎng)成人。他幼年時(shí)就很聰明，很有思理，聽到什么馬上就能背誦，知識(shí)淵博，很有見識(shí)，被世人稱道。他家里有舊書一萬(wàn)多卷，他全都通讀過(guò)。他十五歲就能寫文章，還寫信給父親的友人徐陵。徐陵看后非常驚奇，跟人說(shuō)：“許善心的才調(diào)極高，真是個(gè)神童?！彼钤鐡?dān)任新安王的法曹。太子詹事江總舉薦他為秀才，在朝堂上對(duì)策時(shí)，他高中頭獎(jiǎng)，授為度支郎中，后來(lái)轉(zhuǎn)為侍郎，補(bǔ)了撰史學(xué)士的空缺。禎明二年（588），他加授通直散騎常侍，出使隋朝，接著被隋文帝留下，不讓回去。

再說(shuō)南陳水軍都督周羅和郢州刺史荀法仍然在堅(jiān)守江夏。隋秦王楊俊督領(lǐng)三十位總管和十多萬(wàn)水路大軍進(jìn)駐漢口，但前進(jìn)不得。兩軍相持了一個(gè)多月。南陳荊州刺史陳慧紀(jì)派南康內(nèi)史呂忠肅進(jìn)駐岐亭，占據(jù)巫峽。他派人在北岸鑿穿巖石，固定住三條鐵鎖，橫截住上游下來(lái)的隋軍戰(zhàn)船。呂忠肅將自己的所有財(cái)產(chǎn)都捐獻(xiàn)出來(lái)補(bǔ)充軍用。楊素和劉仁恩率軍奮勇出擊，前后經(jīng)歷了四十多戰(zhàn)。呂忠肅堅(jiān)守險(xiǎn)要，拼死力爭(zhēng)。隋兵戰(zhàn)死了五千多人，南陳士兵把隋兵的鼻子割下來(lái)領(lǐng)取獎(jiǎng)賞。后來(lái)隋軍也打了不少勝仗，俘虜了很多南陳士卒，卻接二連三地將他們放回去。就這樣，隋軍得到人心，士氣也更為高漲。呂忠肅最終只好放棄他的柵寨逃走了。楊素于是慢慢移走了橫截江面的鐵鎖。呂忠肅又重新占據(jù)荊門的延洲。楊素接著派了一千巴族人，乘著四艘五牙船，用拍竿（船上用來(lái)發(fā)射石塊等東西的武器）擊碎了呂忠肅的十來(lái)艘戰(zhàn)艦，徹底打垮了他，還俘虜了南陳甲士二千多人，呂忠肅僅僅逃得了性命。南陳信州刺史顧覺駐扎在安蜀城，這時(shí)也棄城逃走。

陳慧紀(jì)駐扎在公安，把他的儲(chǔ)藏全都燒了，然后帶兵東下。于是巴陵以東再也沒有南陳的守軍了。陳慧紀(jì)率領(lǐng)三萬(wàn)將士，和一千多艘建有高樓的戰(zhàn)艦，沿江而下，想入援建康，但被秦王楊俊攔住，無(wú)法前進(jìn)。這時(shí)，南陳晉熙王陳叔文從湘州卸任回來(lái)，剛好抵達(dá)巴州，陳慧紀(jì)便推舉陳叔文為盟主。而陳叔文已經(jīng)帶領(lǐng)巴州刺史畢寶等人寫信給楊俊請(qǐng)求投降了。楊俊于是派人前去迎接并慰勞他們。剛好建康被占領(lǐng)的消息傳來(lái)，晉王楊廣便請(qǐng)陳叔寶用親筆信去招降上游的將領(lǐng)們，并派樊毅去見周羅，派陳慧紀(jì)的兒子陳正業(yè)去見陳慧紀(jì)，勸他們放下武器。當(dāng)時(shí)大部分城池的南陳守軍都已經(jīng)放下武器了，周羅也只好和部將們舉行了三天哭悼?jī)x式，遣散了將士，然后到楊俊那里投降。陳慧紀(jì)也投降了，于是長(zhǎng)江上游全都被隋朝平定了。楊素來(lái)到漢口，和楊俊會(huì)合。隋蘄州總管王世積在蘄口，聽說(shuō)南陳已經(jīng)滅亡，便寫信告諭江南的各郡。于是南陳江州司馬黃偲棄城逃走，豫章各郡的太守也都到王世積那里投降。

正月二十九（癸巳），隋文帝下詔，派使者巡視并安撫南陳各個(gè)州郡。二月初一（乙未），隋文帝取消了淮南行臺(tái)省。

隋朝納言蘇威上奏，請(qǐng)求每五百家設(shè)置一個(gè)鄉(xiāng)正，負(fù)責(zé)管理百姓，簡(jiǎn)化訴訟糾紛。李德林認(rèn)為：“本來(lái)取消鄉(xiāng)官判案的原因，就是因?yàn)樗袜l(xiāng)里的人非親即熟，所以無(wú)法公平斷案?，F(xiàn)在再讓鄉(xiāng)正專管五百家，恐怕為害更甚。而且有些邊僻的小縣，總共不到五百家人。怎能讓兩縣共管一鄉(xiāng)！”隋文帝不聽。二月初二（丙申），朝廷下制：“五百家為鄉(xiāng)，置鄉(xiāng)正一人；一百家為里，置里長(zhǎng)一人?！?/p>

南陳吳州刺史蕭瓛很得人心。南陳亡國(guó)后，吳人推舉他為主。隋右衛(wèi)大將軍武川人宇文述帶領(lǐng)行軍總管元契和張默言等人討伐他。隋落叢公燕榮也帶著水軍從東海過(guò)來(lái)。南陳永新侯陳君范從晉陵率軍趕來(lái)，和蕭瓛合并，共同抗拒宇文述。宇文述大軍即將到來(lái)時(shí)，陳君范在晉陵城東樹立柵寨，留下士兵抗拒宇文述，又派部將王褒守衛(wèi)吳州，自己帶兵從義興進(jìn)入太湖，想到宇文述的背后襲擊他。宇文述攻破他的柵寨后，回兵出擊，擊潰了陳君范。接著他又派兵從另一條路去襲擊吳州。王褒守不住，只好穿了道士衣服棄城逃走。蕭瓛帶領(lǐng)剩余部眾退保包山，但又被燕榮率軍打敗。他帶著身邊幾個(gè)人躲在百姓家中，但被人捉住了。宇文述進(jìn)軍到奉公埭，南陳東揚(yáng)州刺史蕭巖在會(huì)稽投降，但連同蕭瓛一道被送到長(zhǎng)安斬首。

楊素攻下荊門后，派別將龐暉帶兵在那一帶攻城略地，往南直至湘州。湘州城中的南陳將士，早都沒了斗志。刺史岳陽(yáng)王陳叔慎，這時(shí)才十八歲。他設(shè)宴招待屬下的文武僚吏。酒喝得半醉時(shí)，陳叔慎嘆道：“我們之間的君臣關(guān)系，就到此為止了！”長(zhǎng)史謝基伏在案幾上痛哭流淚。湘州助防遂興侯陳正理也在座，當(dāng)場(chǎng)起身說(shuō)：“主辱臣死。各位難道就不是陳國(guó)的臣子嗎！如今天下有難，實(shí)在是我們?yōu)閲?guó)效命的時(shí)候。即使不能成功，還可以見證我們作臣子的氣節(jié)。青門之外，還怕一死不成！今天有這樣的機(jī)會(huì)，我們絕不能再猶豫了。遲遲不響應(yīng)的人斬！”大家也都答應(yīng)了。于是他們殺了牲口結(jié)盟，并派人送了封詐降信給龐暉。龐暉信以為真，便按照信中的指定日期進(jìn)城。結(jié)果陳叔慎派兵埋伏在門旁，當(dāng)龐暉來(lái)了時(shí)，馬上捉拿了他示眾，然后把他殺了，連同他的部眾。陳叔慎坐在射堂上，招募兵馬。短短幾天之內(nèi)，他就得到了五千人。衡陽(yáng)太守樊通和武州刺史鄔居業(yè)也都請(qǐng)求起兵相助。隋朝任命的湘州刺史薛胄帶兵前來(lái)，和行軍總管劉仁恩一道出兵攻打湘州。陳叔慎派陳正理和樊通一道抵御他們，但都戰(zhàn)敗了。薛胄乘勝攻進(jìn)城里，生擒了陳叔慎。劉仁恩也在橫橋打敗鄔居業(yè)，并生擒了他。他們把陳叔慎和鄔居業(yè)都送到秦王楊俊那里，在漢口將他們處斬。

當(dāng)時(shí)嶺南尚未歸附，那里的各郡共同推奉高涼郡太夫人洗氏為領(lǐng)袖，號(hào)稱圣母，保境拒守。隋朝下詔派柱國(guó)將軍韋洸等人前去安撫嶺外。南陳豫章太守徐墱占據(jù)南康抗拒隋軍，韋洸他們過(guò)不去。晉王楊廣讓陳叔寶給洗夫人寫信，解釋說(shuō)陳國(guó)已經(jīng)滅亡，請(qǐng)她歸順?biāo)宄?。洗夫人召集幾千部落首領(lǐng)，痛哭了一整天，然后派她的孫子馮魂率領(lǐng)部眾去迎接韋洸，并出擊南康，殺了徐墱。韋洸進(jìn)入嶺南地區(qū)后，來(lái)到廣州，向嶺南各州的軍民分析了形勢(shì)，解釋了事情的本末，于是嶺南全部得以平定。韋洸還上表舉薦馮魂為儀同三司，朝廷同時(shí)冊(cè)封洗氏為宋康郡夫人。韋洸是韋敻的兒子。

陳朝衡州司馬任瓖勸說(shuō)都督王勇出兵占領(lǐng)嶺南，然后訪求一位陳氏宗室的子孫，立他為帝。王勇沒有聽從任瓖的勸告，率領(lǐng)所部歸降隋朝。任瓖于是棄官而去。任瓖是任忠弟弟的兒子。

于是南陳被全面平定，隋朝總共得到它的三十個(gè)州，一百個(gè)郡，四百個(gè)縣。隋文帝下詔將建康的城邑和宮室，全部夷為平地，變作農(nóng)田進(jìn)行開墾耕作，改在石頭城設(shè)置蔣州。

晉王楊廣班師回朝，留下王韶鎮(zhèn)守石頭城，把處理南陳的后事全交給他。三月初六（己巳），陳叔寶和他的南陳王公以及百官離開建康，前往長(zhǎng)安。他們男女老少全都上路，五百里連綿不絕。隋文帝下令，暫且分出部分長(zhǎng)安士大夫的民宅給他們居住，并派人在房屋內(nèi)外修整一番，還派使者去迎接慰勞。南陳君臣到了長(zhǎng)安后有賓至如歸的感覺。夏四月初六（己亥，通鑒作辛亥為誤），隋文帝來(lái)到驪山，親自慰勞歸來(lái)的大軍。四月十二（乙巳），各路大軍凱旋歸來(lái)，并在太廟舉行獻(xiàn)俘儀式。陳叔寶和南陳諸位王侯將相，以及他們的乘輿和服御、天文圖籍等，依次排列，還由隋軍的鐵騎包圍著，跟從晉王楊廣和秦王楊俊進(jìn)入太廟，排列在殿庭之中。隋文帝拜楊廣為太尉，賜給他一輛輅車、一匹乘馬、和一套袞服和冠冕、以及玄圭和白璧。四月十三（丙午，通鑒作丙辰，疑有誤。《隋書》無(wú)此記載，但根據(jù)時(shí)間判斷，應(yīng)該不會(huì)跟獻(xiàn)俘相隔太久），隋文帝坐在廣陽(yáng)門觀禮臺(tái)上，接見了陳叔寶和他的太子以及諸王二十八人，還有司空司馬消難以下直至尚書郎，共二百余人。隋文帝讓納言向他們宣詔慰勞；然后又讓內(nèi)史令宣詔，責(zé)備他們君臣不能相輔，最終直至滅亡。陳叔寶及其群臣全都慚愧無(wú)比，害怕地跪伏在地，大氣都不敢出，更不用說(shuō)回答了。隋文帝接著全都寬宥了他們。

當(dāng)初，隋文帝的父親楊忠被派去接應(yīng)從北齊投奔北周的司馬消難（見558年三月的故事），因此和司馬消難結(jié)為兄弟，關(guān)系非常密切。隋文帝總是把他當(dāng)作自己的叔父。滅陳之后，司馬消難也從南陳過(guò)來(lái)了。隋文帝特別赦免了他的死刑，依法發(fā)配去當(dāng)樂戶（即為貴族家庭奏樂的隸戶），但才二十來(lái)天就又赦免了。隋文帝還經(jīng)常因?yàn)橥盏年P(guān)系引見他。司馬消難不久就死在家里。

四月十七（庚戌），隋文帝在廣陽(yáng)門宴請(qǐng)功臣將士。他派人將賞賜給將士的布帛擺在門外大道的兩側(cè)，布帛多到一直擺到長(zhǎng)安的南城。將士們都得到不同程度的獎(jiǎng)賞，一共用了三百多萬(wàn)段。隋文帝還下詔，免除原來(lái)南陳境內(nèi)百姓十年的租賦。其他州郡也免除了當(dāng)年的租賦。

樂安公元諧進(jìn)言說(shuō)：“陛下的威德遠(yuǎn)播，臣從前就請(qǐng)求過(guò)讓突厥的可汗擔(dān)任候正，讓陳叔寶擔(dān)任令史。今天陛下可以采用臣當(dāng)年的建議了?！彼逦牡壅f(shuō)：“朕平定陳國(guó)，本來(lái)只是為了除掉暴逆，并非為了夸耀自己。元公所奏的，實(shí)在不是朕的本意。突厥人不懂得山川地形，怎能讓他偵察報(bào)警？陳叔寶昏聵醉酒，怎能錄用驅(qū)使？”元諧不聲不響地退下了。

四月二十八（辛酉），隋文帝將楊素進(jìn)爵為越公，并提拔他兒子楊玄感為儀同三司，楊玄獎(jiǎng)為清河郡公；還賜給他一萬(wàn)段布帛，一萬(wàn)石谷粟。隋文帝讓賀若弼登上御座，并賜給他八千段布帛，進(jìn)位為上柱國(guó)，封宋公。隋文帝還賜給他金寶，并把陳叔寶的妹妹嫁給他為妾。

賀若弼和韓擒虎在隋文帝面前爭(zhēng)功。賀若弼說(shuō)：“臣在蔣山前拚死作戰(zhàn)，才擊潰他們的精銳部隊(duì)，生擒他們的驍勇戰(zhàn)將。正因?yàn)檫@場(chǎng)戰(zhàn)役震揚(yáng)了我軍的威武，才得以平定陳國(guó)。韓擒虎幾乎沒和陳軍交鋒過(guò)，怎能和臣相比！”韓擒虎說(shuō)：“本來(lái)根據(jù)朝廷的明旨，讓臣和賀若弼同時(shí)合力奪取偽都。而賀若弼竟然膽敢擅自提前進(jìn)軍，遇見賊兵就馬上開戰(zhàn)，結(jié)果造成將士死傷了很多。臣只率領(lǐng)輕騎五百，兵不血刃，直取金陵，降服了蠻奴，活捉了陳叔寶，占據(jù)他的府庫(kù)，打翻了他的巢穴。賀若弼到那天傍晚才攻打陳國(guó)宮廷的北掖門，而臣還開門接納了他。他本該忙著請(qǐng)罪才是，怎能和臣相比！”隋文帝說(shuō)：“你們二將的功勞都是最大的?！庇谑菍㈨n擒虎進(jìn)位為上柱國(guó)，也賜給他八千段布帛。有司部門彈劾韓擒虎放縱士卒，奸淫南陳宮里的宮女。所以隋文帝沒有為他提升爵位和增加封邑。

隋文帝還提升高颎為上柱國(guó)，進(jìn)爵為齊公，賜給他九千段布帛。隋文帝慰勞他說(shuō)：“高公伐陳后，有人誣告高公反叛，朕已把他殺了。我們君臣的彼此信任，并非那些青蠅之輩所能離間的?！彼逦牡鬯较伦屗唾R若弼比較平定南陳的功勞，高颎說(shuō)：“賀若弼先是獻(xiàn)上了十道計(jì)策，后來(lái)又在蔣山苦戰(zhàn)破賊。臣只不過(guò)是個(gè)文官而已，怎敢和大將論功！”隋文帝聽后大笑，嘉獎(jiǎng)他懂得謙讓。

隋文帝伐陳時(shí)，曾讓高颎向上儀同三司李德林請(qǐng)教平定南陳的方略，然后將這些意見轉(zhuǎn)授給晉王楊廣。到這時(shí)，隋文帝為了獎(jiǎng)賞他的功勞，便授李德林為柱國(guó)，封郡公，賞了他三千段布帛。在敕令已經(jīng)宣讀之后，有人跟高颎說(shuō)：“如今把平陳的事都?xì)w功于李德林，大將們一定會(huì)感到憤概和惋惜。而且后世也會(huì)把高公的這趟出征當(dāng)作白跑了一趟。”高颎覺得有理，急忙進(jìn)宮把這話轉(zhuǎn)告了隋文帝。隋文帝于是取消了對(duì)李德林的封賞。

隋文帝接著任命秦王楊俊為揚(yáng)州總管，并負(fù)責(zé)那里四十四州的軍事，出鎮(zhèn)廣陵。他同時(shí)讓晉王楊廣回到并州。