生信挖掘的常用數(shù)據(jù)庫GEO使用教程: 1、用必應(yīng)搜索GEO(不要用百度搜,會出現(xiàn)一堆不相關(guān)的結(jié)果): 2、進入官網(wǎng)后,選擇series或datasets,兩種方法找到的結(jié)果不一樣,比如說你搜MSI,會出現(xiàn)不同的數(shù)據(jù)集結(jié)果,可以都試一下以便查找自己想要的數(shù)據(jù)集: 3、找到自己剛興趣的數(shù)據(jù)集后,我們來了解一下詳情頁都有哪些東西需要注意,以芯片數(shù)據(jù)為例: Series Matrix File是表達量數(shù)據(jù)矩陣,GSE4045_RAW.tar是原始數(shù)據(jù)集。一般來說下載Series Matrix File是最方便的,但是下載完之后會有許多問題,比如說表達量來源(MAS5 ,RMA ,RPKM,F(xiàn)PKM,TPM還是原始的counts)?芯片對應(yīng)的基因怎么置換?請聽下回分解! |
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