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發(fā)現(xiàn)了一種不攜帶任何已知基因片段的巨病毒

 萬寶全書 2020-02-24

貝洛奧里藏特米納斯吉拉斯州聯(lián)邦大學(xué)的病毒學(xué)家J?natas Abrah?o和同事發(fā)現(xiàn)了一種巨病毒——大小與細(xì)菌相當(dāng),故而得名。2003年,我們才第一次知道巨病毒的存在——來自被感染的變形蟲。

除了一種新的巨型病毒,這次還發(fā)現(xiàn)了一種相對(duì)較小的病毒。它們和之前感染變形蟲的病毒大不相同。研究人員將其命名為Yaravirus。(根據(jù)土著圖皮瓜拉尼神話,雅拉是“水之母”。)

大小并不是雅拉病毒唯一與眾不同之處。團(tuán)隊(duì)為它們做DNA測序時(shí),沒有發(fā)現(xiàn)任何與已知基因匹配的遺傳片段。

紐約大學(xué)的Elodie Ghedin對(duì)此倒是十分淡定,他主要研究廢水和呼吸系統(tǒng)中的病毒。她表示,污水病毒庫中超95%的病毒“與[數(shù)據(jù)庫]中的參考基因組不匹配”。就像Abrah?o的發(fā)現(xiàn)一樣,“我們似乎一直都在發(fā)現(xiàn)新病毒。

Abrah?o說,雅拉病毒的某些基因看起來像巨病毒中的基因,但目前尚不清楚兩者之間的關(guān)系。他和同事仍在研究這種新型病毒其他方面的特性。

Abrah?o一次就追逐一種病毒,而美國國家癌癥研究所的病毒學(xué)家Christopher Buck和研究生Michael Tisza正在廣撒網(wǎng)。他們在動(dòng)物組織中搜索一種把自身遺傳物質(zhì)圍成環(huán)的病毒——所謂的環(huán)狀病毒,包括乳頭瘤病毒,其中有人乳頭瘤病毒,可引起宮頸癌,其它通常對(duì)人無害。但是Buck有證據(jù)表明,后者可能與腎移植患者和其他人的膀胱癌發(fā)病率相關(guān)。

為了找到病毒,研究人員從人類和其他動(dòng)物的數(shù)十種組織樣本中分離出病毒顆粒,并篩選出具有環(huán)狀基因組的對(duì)象。該團(tuán)隊(duì)通過尋找一種編碼病毒外殼的基因,證實(shí)了DNA確實(shí)屬于病毒。這些基因序列通常無法識(shí)別,但是Tisza編寫了一個(gè)計(jì)算機(jī)程序,足以預(yù)測哪些基因最有可能負(fù)責(zé)為這些殼的獨(dú)特折疊形態(tài)編碼。

該團(tuán)隊(duì)總共發(fā)現(xiàn)了約2500種環(huán)形病毒,其中約600種是新發(fā)現(xiàn)。他們在eLife上報(bào)告說,目前尚不清楚這些有機(jī)體會(huì)對(duì)人類健康產(chǎn)生什么影響(如果有的話)。但是Buck說,數(shù)據(jù)支持醫(yī)生和科學(xué)家開始建立這些聯(lián)系。

新研究的意義不僅僅在于確定哪些病毒會(huì)引起疾病。某些生活在人體中的病毒可能有助于保持我們的健康,而另一些幫助我們的機(jī)體循環(huán)利用必需的養(yǎng)分來保持生態(tài)系統(tǒng)的平穩(wěn)運(yùn)行。溫哥華不列顛哥倫比亞大學(xué)的環(huán)境病毒學(xué)家Curtis Suttle說:“沒有[他們],我們就無法生存。發(fā)現(xiàn)和表征病毒能夠帶來巨大的好處。

本文譯自 sciencemag,由譯者 majer 基于創(chuàng)作共用協(xié)議(BY-NC)發(fā)布。

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