在真核生物中,組蛋白與帶負(fù)電荷的雙螺旋DNA組裝成核小體。因氨基酸成分和分子量不同,組蛋白主要分成5類:H1,H2A,H2B,H3和H4。除H1外,其他4種組蛋白均分別以二聚體形式相結(jié)合,形成核小體核心。DNA便纏繞在核小體的核心上。而H1則與核小體間的DNA結(jié)合。
組蛋白修飾(histone modification)是指組蛋白在相關(guān)酶作用下發(fā)生甲基化、乙酰化、磷酸化、腺苷酸化、泛素化、ADP核糖基化等修飾的過程。
組蛋白上發(fā)生甲基化的位點(diǎn)是賴氨酸和精氨酸。賴氨酸能夠分別發(fā)生一、二、三甲基化,精氨酸只能發(fā)生一、二甲基化。在組蛋白H3上,共有5個(gè)賴氨酸位點(diǎn)可以發(fā)生甲基化修飾。一般來說,組蛋白H3K4的甲基化主要聚集在活躍轉(zhuǎn)錄的啟動(dòng)子區(qū)域。組蛋白H3K9的甲基化與基因的轉(zhuǎn)錄抑制及異染色質(zhì)有關(guān)。H3K27甲基化可導(dǎo)致相關(guān)基因的沉默,并且與X染色體失活相關(guān)。H3K36的甲基化與基因轉(zhuǎn)錄激活相關(guān)。
組蛋白修飾調(diào)節(jié)基因表達(dá)和發(fā)育。在一項(xiàng)新的研究中,為了解決在人類早期發(fā)育中組蛋白修飾如何發(fā)生重編程,中國清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院的頡偉(Wei Xie)課題組、鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院的孫瑩璞(Ying-Pu Sun)課題組和徐家偉(Jiawei Xu)課題組研究了人卵母細(xì)胞和早期胚胎中的關(guān)鍵組蛋白標(biāo)記。相關(guān)研究結(jié)果于2019年7月4日在線發(fā)表在Science期刊上,論文標(biāo)題為“Resetting histone modifications during human parental-to-zygotic transition”。
圖片來自:Science 2019. 在小鼠卵母細(xì)胞中,H3K4me3與H3K27me3都表現(xiàn)出與體細(xì)胞不同的非經(jīng)典分布規(guī)律。與小鼠中不同的是,允許性標(biāo)記H3K4me3在人卵母細(xì)胞的啟動(dòng)子中主要表現(xiàn)出經(jīng)典的分布模式。在受精后,合子基因組激活(zygotic genome activation, ZGA)前的胚胎在富含CpG的調(diào)節(jié)區(qū)域中獲得可訪問性的染色質(zhì)和廣泛的H3K4me3。相比之下,抑制性標(biāo)記H3K27me3經(jīng)歷全局性消除。隨后,一旦合子基因組激活,富含CpG的調(diào)節(jié)區(qū)域轉(zhuǎn)變?yōu)榛钚曰蛞种茽顟B(tài),隨后在發(fā)育基因上恢復(fù)H3K27me3。
最后,通過結(jié)合染色質(zhì)和轉(zhuǎn)錄組圖譜,這些研究人員揭示出早期譜系特化期間的轉(zhuǎn)錄程序和不對(duì)稱的H3K27me3分布模式。
總的來說,這些數(shù)據(jù)揭示出一種預(yù)備性階段(priming phase)與人類親本-合子轉(zhuǎn)變表觀遺傳轉(zhuǎn)變(parental-to-zygotic epigenetic transition)關(guān)聯(lián)在一起。
原始出處: Weikun Xia et al. Resetting histone modifications during human parental-to-zygotic transition. Science 2019.
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