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隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡(STORM)技術(shù)解讀 | 每日生物評(píng)論

 最后的大腸桿菌 2019-07-10
隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡

風(fēng)暴的基本概念一個(gè)相當(dāng)大的變化,Palm和FPALM已采用多種激勵(lì)計(jì)劃及合成熒光基團(tuán)和熒光蛋白的誘導(dǎo)暗態(tài)。

STORM成像的熒光探針

適合用于成像與暴風(fēng)相關(guān)的超分辨率方法的熒光探針是那些具有非常高的亮度和對(duì)比度的水平,在光漂白前每個(gè)分子的光子產(chǎn)生的最大數(shù)目,或返回到一個(gè)黑暗的,非熒光的狀態(tài)。對(duì)于所有的熒光基團(tuán)的摩爾消光系數(shù)和熒光量子產(chǎn)率,低疲勞率,和交換動(dòng)力學(xué),很容易地控制。因此,在光漂白或光控暗狀態(tài)而言,最好的探針是那些失活可以平衡,以確保在任何特定時(shí)間,只有一小分子中是激活的激活率。

除了高亮度水平和光控穩(wěn)定性的要求,超分辨率探針必須是能夠擬定精度高的亞細(xì)胞目標(biāo)化,他們應(yīng)該具有盡可能低的背景噪聲水平。熒光蛋白,混合動(dòng)力系統(tǒng)相結(jié)合的一種基因編碼的目的肽與一個(gè)單獨(dú)的合成染料膜滲透物的組件,高度特異性的合成熒光團(tuán)(如MitoTrackers LysoTrackers SYTO熒光團(tuán))是能靶向蛋白組裝或細(xì)胞器。

Abbkine公司的TrakineTM細(xì)胞染色試劑盒以及TrakineTM Pro活細(xì)胞試劑盒所用的染料完美的印證了這一功能。利用TraKine? Pro熒光探針,成功記錄STORM顯微鏡下成功觀測(cè)到活細(xì)胞細(xì)胞核/溶酶體和線粒體相互作用過(guò)程。為研究亞細(xì)胞器結(jié)構(gòu)之間的相互作用以及它們背后的分子生物學(xué)機(jī)制提供條件。得益于莊小威院士的啟發(fā),Abbkine TraKine? Pro系列熒光染料應(yīng)運(yùn)而生,主要包括以下四個(gè)品類的產(chǎn)品。

實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目代表貨號(hào)
TrakineTM Pro 活細(xì)胞Tublin染色(綠色)KTC4100
TrakineTM Pro 活/死細(xì)胞溶酶體染色(深紅/橙)KTC4210/KTC4220
TrakineTM Pro 活/死細(xì)胞線粒體染色(深紅)KTC4300
TrakineTM Pro 活/死細(xì)胞細(xì)胞核染色(深紅)KTC4510

屬性選擇合成探針STORM成像

(縮寫)EXnm)EMnm)EC (×10-3)QYN光子
CY3B559570130.00.671400
CY3.5581 596150.00.675000
CY5.5675694190.00.236000
CY7747767200.00.281000
Alexa Fluor 48849551971.00.921200
Alexa Fluor 56857860391.30.692800
Alexa Fluor 750749775240.00.336000
Alexa Fluor 647650665240.00.12450
ATTO 48850152390.00.801300
ATTO 520516538110.00.901200
ATTO 565563592120.00.9020000
ATTO 647645669120.00.201500
ATTO 647N644669150.00.653000
ATTO 680680700125.00.31500
ATTO 740740764120.00.11000
TAMRA54657590.40.25000
Dyomics 654654675220.0NA3600
DyLight 750752778220.0NA700
IRDye 800 CW778794240.0NA3000
羅丹明B530620105.00.65750
C-羅丹明54557590.00.901000
C-熒光49451829.00.931500

影響因素STORM成像分辨率

STORM,PALM,F(xiàn)PALM的技術(shù),如超分辨單分子成像的理論基礎(chǔ)雖然先前已詳細(xì)討論了,在確定任何特別的調(diào)查使用這些方法的實(shí)際結(jié)果的因素有很多。其中的關(guān)鍵方面是必須考慮的是,每個(gè)單獨(dú)的定位測(cè)量的準(zhǔn)確度,已被定位在最終圖像中(通常被稱為分子密度)的探針的密度,和標(biāo)簽本身的物理尺寸。分辨率和單分子定位精度之間的關(guān)系是很容易確定。能力解決兩個(gè)熒光分子作為單獨(dú)的實(shí)體的位置定位的精度,這決定了(不確定性)的每個(gè)分子中,從而對(duì)之間的距離是有限的。反過(guò)來(lái),定位的精度,主要是依賴于單個(gè)激活-去激活周期收集的熒光分子的光子數(shù),提供了背景噪聲可以忽略不計(jì)。

雙色彩風(fēng)暴成像

在熒光顯微術(shù)的主要優(yōu)點(diǎn)是容量乘以與一個(gè)以上的熒光基團(tuán)標(biāo)記的圖像樣本來(lái)生成圖像的二,三,四種顏色,幫助解開的相對(duì)的組織和不同的生物結(jié)構(gòu)或分子之間發(fā)生的相互作用。在兩個(gè)或兩個(gè)以上的熒光標(biāo)記探針駐留在同一決議體積的情況下,他們可以被視為經(jīng)典的共定位分析算法,以確定發(fā)射光譜之間的重疊程度。在兩個(gè)或兩個(gè)以上的顏色是必不可少的,用于探測(cè)生物分子之間的相互作用,并提供了寶貴的洞察許多生物過(guò)程的性質(zhì),如果它可以成功地應(yīng)用到超分辨率成像。

三維風(fēng)暴成像

絕大多數(shù)生物結(jié)構(gòu)的三維實(shí)體,從而表現(xiàn)出橫向和軸向尺寸范圍在幾十微米或以上的功能,很容易解決的許多流行的成像方式在熒光顯微鏡。這種能力擴(kuò)展到單分子的超分辨成像,精確地確定一個(gè)機(jī)制來(lái)激活熒光橫向和軸向位置的境界是必要的。不幸的是,熒光團(tuán)的軸向位置上的準(zhǔn)確的信息是很難取得衍射受限的三維成像,因?yàn)榻蛊矫娓浇膮^(qū)域中的點(diǎn)擴(kuò)散函數(shù)是對(duì)稱的。呈現(xiàn)確切位置的兩個(gè)分子位于焦平面上方或下方在納米之間難以區(qū)分。此外,該點(diǎn)擴(kuò)散函數(shù)也包含在焦平面附近的一個(gè)較大的區(qū)域(高達(dá)幾百納米)使其難以跨越的熒光有關(guān)的軸向位置的信息很少本地化分子居住的任何地方附近的寬視場(chǎng)顯微鏡的焦平面。

單分子風(fēng)暴型三維成像的另一種方法利用多焦點(diǎn)的平面成像,以實(shí)現(xiàn)軸向分辨率的衍射極限以下。通過(guò)同時(shí)成像在試樣中的兩個(gè)焦平面,激活的熒光團(tuán)的圖像可以被分析,以適應(yīng)一個(gè)三維點(diǎn)擴(kuò)散函數(shù),以確定它們的空間坐標(biāo)。

活細(xì)胞STORM成像

進(jìn)行時(shí)間分辨的圖像序列捕獲的活細(xì)胞和組織的結(jié)構(gòu)是熒光顯微鏡的標(biāo)志成果之一,并可以實(shí)施與幾乎所有的對(duì)比度或光學(xué)切片模式,包括寬視場(chǎng),激光掃描共聚焦,旋轉(zhuǎn)盤,總的內(nèi)部反射和多光子顯微鏡。

因?yàn)閐STORM利用常用的有機(jī)熒光基團(tuán)(如Cy5標(biāo)記的Alexa Fluor 488,ATTO 655)所表現(xiàn)出的的固有光控性能,是不要求精確共軛的第二熒光激活。因此,dSTORM可以產(chǎn)生衍射極限的下方,使用與選定的合成熒光標(biāo)記活細(xì)胞顯著高分辨率的圖像。該技術(shù)也被檢查翻譯用Cy5的Alexa Fluor 647標(biāo)記的微絲在體外吸附在玻璃表面,很容易轉(zhuǎn)換成應(yīng)用程序與其他常見的生物大分子沿肌球蛋白II網(wǎng)絡(luò)。

結(jié)論

STORM成像,將有一個(gè)直接關(guān)系到成功的活細(xì)胞觀察的另一個(gè)重要方面是數(shù)據(jù)采集速度。由于本征時(shí)間和空間分辨率之間的折衷,超分辨率成像一般是比較緩慢的。更具體地,構(gòu)造風(fēng)暴圖像繪制在許多成像幀的檢體中的寬視場(chǎng)視圖累計(jì)本地化。因此,成像速度在風(fēng)暴需要準(zhǔn)備一個(gè)高分辨率的圖像的幀的數(shù)量是有限的。相比之下,聚焦的光點(diǎn)擴(kuò)散函數(shù)的工程技術(shù),如STED,有限的時(shí)候需要掃描整個(gè)標(biāo)本的一個(gè)小的焦點(diǎn)。因此,單分子技術(shù)有望比STED相關(guān)的方法要快,成像時(shí),一個(gè)大的標(biāo)本地區(qū),但慢的時(shí)候成像面積小。目前,風(fēng)暴的最高分辨率圖像采集時(shí)間通常需要幾分鐘。然而,在60至70納米的空間分辨率,時(shí)間分辨的圖像的時(shí)間分辨率在活細(xì)胞中的幾十秒鐘的聚集。應(yīng)該預(yù)期將改善與成像速度更快的相機(jī),較高的激發(fā)功率,探頭具有更快的光控率。

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