1、政府采購工程適用《招標(biāo)投標(biāo)法》,僅僅是招標(biāo)投標(biāo)活動（或程序）上的適用,但在招標(biāo)投標(biāo)程序之外的其他活動及管理,還應(yīng)當(dāng)《政府采購法》,否則與政府采購范圍相沖突 .
　　2、本法所指的工程,僅指建設(shè)工程,不應(yīng)包括信息、環(huán)保、水電工程等.
　　其次從立法的過程看：
　　工程是否列政府采購的對象,在立法過程中有過較大爭論.最后支持將工程列入采購法調(diào)整范圍原因在于：
　　第一,政府采購法屬于實體法、招標(biāo)投標(biāo)法屬于程序法.我國采取兩法并立的立法模式,并不能導(dǎo)致兩法內(nèi)容的互相排斥；
　　第二,是否納入政府采購范圍,關(guān)鍵要看采購主體及資金來源,而不是采購的對象；
　　第三,在實踐中,政府投資工程是政府不可缺少的一項重要資源,工程支出占政府采購支出支出比重相當(dāng)高,如果將工程排除在外,不僅調(diào)整范圍不完整,入世談判缺少一個重要的籌碼,也將使政府采購制度的意義大為降低.
　　因此我們認(rèn)為,兩法并行但不矛盾.
　　從兩法的關(guān)系看,《招標(biāo)投標(biāo)法》和《合同法》一樣,可以說是《政府采購法》的配套法律,這也符合國際通行作法和各國的立法經(jīng)驗的.
　　同時,在處理兩法關(guān)系時,應(yīng)按“后法優(yōu)于前法”和“特別法優(yōu)于一般法”的法律適用原則,當(dāng)政府采購法的規(guī)定與招標(biāo)投標(biāo)法不一致,或政府采購法另有特別規(guī)定時,應(yīng)遵行政府采購法.
　　所以說,招投標(biāo)與政府采購制度有聯(lián)系,但兩者不能劃等號；政府采購法與招標(biāo)投標(biāo)法有交叉,但不矛盾,而是相互協(xié)調(diào)、彼此補(bǔ)充.
　　兩法的主要區(qū)別有：
　?。ㄒ唬┮?guī)范的主體不同
　　《政府采購法》規(guī)范的主體是各級國家機(jī)關(guān)、事業(yè)單位和團(tuán)體組織.
　　《招標(biāo)投標(biāo)法》規(guī)范的主體則無限制,凡是在我國境內(nèi)的任何主體進(jìn)行招標(biāo)投標(biāo)活動（強(qiáng)制或自愿）,包括私人企業(yè)以及其他非法人組織.并且,《招標(biāo)投標(biāo)法》不但規(guī)范招標(biāo)（采購）主體,也規(guī)范投標(biāo)（銷售）主體,這與《政府采購法》規(guī)范的主體很大不同.
　　實踐中,招標(biāo)投標(biāo)法許多條文是針對強(qiáng)制招標(biāo)（工程建設(shè)項目及相關(guān)的貨物、服務(wù)）而言,不適合當(dāng)事人自愿招標(biāo)的情況.
　?。ǘ┮?guī)范的行為性質(zhì)不同
　　政府采購法,規(guī)范的是政府采購行為.這種行為不僅包括招標(biāo)采購,還包括詢價采購、競爭性談判采購、單一來源采購行為.
　　學(xué)術(shù)界常被視是一種行政行為,認(rèn)為政府可以利用采購政策干預(yù)采購市場.
　　招標(biāo)投標(biāo)法,規(guī)范的是招標(biāo)投標(biāo)行為.是指招標(biāo)人以招標(biāo)公告或投標(biāo)邀請書的方式,公開選擇賣方一種交易方式.
　　僅指“標(biāo)買”,不包括“標(biāo)賣” .是一種民事行為
　　同時從行為的過程看,政府采購行為要比招標(biāo)投標(biāo)行為來得長而復(fù)雜.
　?。ㄈ?qiáng)調(diào)的法律責(zé)任不同
　　雖然《政府采購法》與《招標(biāo)投標(biāo)法》都涉及民事責(zé)任、行政責(zé)任和刑事責(zé)任的規(guī)定,但兩者的側(cè)重點是不同的.
　　由于《政府采購法》屬于行政法的范疇,規(guī)范的是政府機(jī)關(guān)單位如何管理規(guī)范政府采購行為,因而它強(qiáng)調(diào)的是行政責(zé)任；
　　《招標(biāo)投標(biāo)法》屬于民法、經(jīng)濟(jì)法的范疇,招標(biāo)投標(biāo)行為是一種民事行為,因而強(qiáng)調(diào)的是民事責(zé)任.
　?。ㄋ模┕芾眢w制與操作模式的不同
　　1、管理體制.
　　政府采購是實行財政統(tǒng)一管理,監(jiān)察、審計和行政主管部門分工監(jiān)督的體制.最高領(lǐng)導(dǎo)機(jī)關(guān)是財政部.
　　招標(biāo)投標(biāo)是實行發(fā)改協(xié)調(diào)指導(dǎo),各行業(yè)（行政）主管部門歸口監(jiān)督的體制.最高領(lǐng)導(dǎo)機(jī)關(guān)是發(fā)改委.
　　2、執(zhí)行模式.
　　政府采購實行集中采購和分散采購相結(jié)合的模式,采取強(qiáng)制委托和自愿委托的形式.
　　招標(biāo)投標(biāo)實行分散采購（包括分散委托和自行組織）的模式,由招標(biāo)人自愿委托.
　　3、采購目錄和限額標(biāo)準(zhǔn)（招標(biāo)范圍和規(guī)模標(biāo)準(zhǔn)）
　　政府采購按預(yù)算隸屬關(guān)系由國務(wù)院和省級政府或授權(quán)部門制定并頒布.
　　招標(biāo)投標(biāo)由國家發(fā)改委會同有關(guān)部門制訂,報國務(wù)院批準(zhǔn)后公布.
　　4、采購方式審批
　　非公開招標(biāo)的政府采購方式由市級以上財政部門審批.
　　邀請招標(biāo)方式由國家發(fā)改委或省政府批準(zhǔn).
　　5、供應(yīng)商（投標(biāo)人）資格要求
　　政府采購對供應(yīng)商資格除了技術(shù)要求和能力要求外,還有政策性要求,如納稅、環(huán)保、社保、就業(yè)等要求.
　　政府采購除了邀請招標(biāo)方式允許對供應(yīng)商進(jìn)行資格預(yù)審,公開招標(biāo)卻不可以；而招標(biāo)投標(biāo)中卻均允許,而且比較普遍.
　　以聯(lián)合體形式參加的,政府采購對一般供應(yīng)商資格條件,聯(lián)合體各方均應(yīng)具備,特定資格條件,只需其中一方具備；招標(biāo)投標(biāo)要求聯(lián)合體各方均應(yīng)具備,并按資質(zhì)最低的一方確定資質(zhì)等級.
　　6、救濟(jì)程序（供質(zhì)疑、投訴）不同
　　政府采購中供應(yīng)商質(zhì)疑、投訴是特指供應(yīng)商認(rèn)為采購文件、采購過程及采購結(jié)果使自己權(quán)益受到損害的,可以向采購組織單位和財政部門進(jìn)行申訴和監(jiān)督的行為.
　　對政府采購供應(yīng)商質(zhì)疑、投訴按規(guī)定進(jìn)行受理、答復(fù)是采購組織單位和財政部門的應(yīng)盡職責(zé)和法定義務(wù),否則供應(yīng)商可以行政復(fù)議或行政訴訟.
　　招標(biāo)投標(biāo)法的異議、投訴是指投標(biāo)人和其他利害關(guān)系人只要認(rèn)為招投標(biāo)活動不符合本法規(guī)定的,均有權(quán)向招標(biāo)人提出異議或向有關(guān)行政監(jiān)管部門投訴.
　　投訴人和投訴事項寬泛,不必提供確切證據(jù),不會引起訴訟風(fēng)險.